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FEN1功能以及作为抗肿瘤靶点的可行性研究

发布时间:2020-10-19 23:48
   FEN1是一种多功能、结构特异性的核酸酶,它在维持基因组稳定性上起着重要的作用。体内FEN1的合理调控对维持细胞正常生长是至关重要的。我们通过寻找与FEN1相互作用的蛋白而进一步深入探究FEN1未知的功能。我们尝试串联亲和纯化等方法获得了与FEN1相互作用的蛋白混合物并通过质谱进行鉴定。我们发现HSP70与FEN1相互作用并促进FEN1的活性和BER的效率。近来,我们在人类癌症样本中发现了 FEN1的突变,这暗示着突变可能会影响基因组的不稳定性并导致癌症的发生。然而,FEN1功能缺失和癌症易感性之间的确切关系仍然不清楚。我们利用与结直肠癌相关的突变体,并分别从分子生化水平、细胞水平和动物模型三个层面对癌症发生的相关机制进行了阐述。首先我们构建FEN1点突变,并表达纯化重组蛋白。我们在体外分析了重组蛋白对DNA底物的酶切活性以及结合力,发现这一突变失去FEN1的FEN、EXO和GEN活性但仍然保留与DNA的结合亲和力。接下来我们分析了 L209P突变与野生型FEN1共存对其酶活性的影响,结果发现该突变以一种dominant-negative的方式影响野生型FEN1的功能。最后我们在体外比较了SW480细胞的BER修复能力并同时用重组蛋白进行了 LP-BER的重建。结果发现该突变影响体外以及细胞内的BER效率。我们还研究了 L209P突变在细胞水平的变化。过表达L209P突变使得SW480细胞对5-FU和H202的敏感性更高并且其细胞凋亡比例增加。过表达L209P突变的SW480细胞的内源性损伤增加,表现为DNA双链断裂增加。并且该突变导致细胞内出现更多的染色体畸变,包括细胞内异倍体和染色体断裂的频率增加。此外,我们发现含L209P突变的细胞具有更高的克隆形成能力,并且突变细胞在小鼠异源生长模型上肿瘤形成能力更强。综上所述,与癌症相关的FEN1基因的变异会影响机体的BER修复效率,并诱导细胞发生转化。对该突变体的研究揭示了癌症发生的分子机制。基于以上的研究发现,FEN1功能对于正常细胞来讲是必要的,FEN1功能缺失将导致肿瘤发生。然而,与此同时,在己经转化成肿瘤的细胞中,其FEN1的表达水平远远高于正常细胞。我们发现在乳腺癌细胞中FEN1是高表达的,并且FEN1对于快速生长的癌细胞是必须的。我们发现改变FEN1在细胞中的表达水平会改变癌细胞对于化疗药物的反应。并且,对临床肿瘤样本的分析发现,肿瘤中FEN1表达水平越高,肿瘤恶性程度就越高,病人的预后就越差。在细胞中抑制FEN1活性会引起DNA复制停滞和未修复的DNA中间体的积累,进而导致DNA双链断裂和细胞凋亡。因此,我们认为,抑制FEN1活性将会抑制肿瘤细胞生长。基于这一设想,我们提出了以FEN1为靶点的抗肿瘤的策略。我们设计了一种全新的FEN1抑制剂(SC13),它可以特定的抑制FEN1的活性,并且影响冈崎片段的成熟和LP-BER,影响体内和体外的DNA复制和修复。SC13抑制癌细胞增殖,并导致细胞内DSBs和染色体断裂的产生,癌细胞中染色体的不稳定性进一步会诱导细胞发生凋亡。SC13和化疗药物联合使用会增加癌细胞中的DSBs的频率。更为重要的是,在用于小鼠的抗肿瘤实验中,SC13表现出良好的抗肿瘤效果。当SC13与化疗药物联合使用时,肿瘤抑制效果是比较明显的,表明SC13联合使用会增加癌细胞对化疗药物的敏感性。这些发现可以为乳腺癌和其他癌症的治疗提供参考。
【学位单位】:南京师范大学
【学位级别】:博士
【学位年份】:2018
【中图分类】:R730
【部分图文】:

晶体结构,粗细程度,箭头,外切酶


1三种活性的底物模式图。箭头的大小和粗细程度代表不同活性强度。红色EN活性,蓝色箭头代表EXO活性,橙色代表GEN活性。??hree?biochemical?activities?of?FEN1.?The?schematic?structure?of?the?correspondiith?various?conformations.?FEN1?possesses?three?different?activities,?including?FEctivity.?The?size?and?thickness?of?arrows?represent?the?strength?of?the?activities.?Colesents?different?activities.?Red,?flap?endonuclease?activity;?blue,?exonuclease?activityclease?activity.??N1与底物结合的晶体结构??关于FEN1结构的描述出现在噬菌体同系物中,T5?5#亥酸外切酶是带蛋白质,允许单链DNA?(ssDNA)通过p3]。与生化数据一致的是,菌的晶体结构数据表明,FEN1通过围绕疏水楔而优先结合悬置的lnt大小的3'-flap和5'-flapp4]。酶的这种构结构的底部,并引导它允许FEN1精确地切割lnt直至下游双链区切口_。??rai等人[31]对人源FEN1做了进一步的研究,确认FEN1主要识别3'-,。近,Tsu

序列,代谢途径,发夹结构,中间体


?第1章绪论?;???虽然在HD患者中没有发现功能缺陷的FEN1突变体,然而其他证据表明,FEN1??可以抑制重复序列的扩增[97]。将包含TOR重复序列的片段结构底物与DNA?ligase?I??和FEN1同时孵育,发现FEN1浓度增加会抑制环状和发夹结构中间体的形成,这些??中间体可以形成TNR扩增,这样FEN1就间接的抑制了?TNR的扩增[98]。在酿酒酵母??中,FEN1的缺乏大大增加了?TNR的扩增,遗传分析表明FEN1的EXO和GEN活??性均会抑制TNR的扩增[99]。Liu和Wilson提出,重复扩增机制之一是LP-BER过程??中单链中间体上发夹结构的形成[1%。这些结构可以发生滑移,同时片段结构也跟着??滑动,使得FEN1在错误的位置切割,剩余的TNR序列由连接酶连接留在了?DNA中??并导致了?TNR的扩增。类似的TNR扩增过程在冈崎片段中间体形成时也可能发生。??错配修复系统中蛋白发生突变也可以抑制TNR扩增[1Q1,I()2]。最近的研宄表明,错配??修复复合体Msh2-Msh3可以稳定泡状结构和发夹结构,导致FEN1在不适当的地方??进行切割,这似乎也会导致TNR重复扩增11()3]。??〇??

代谢途径,核定位信号,残基,核仁


modifications,?based?on?the?known?biochemical?activities?and?pathways?of?these?proteins.??1.3.2?FEN1在细胞内的区室化??细胞内定位是FEN1功能调节的主要方式之一(图1.4)[135]。在真核细胞内,FEN1??合成之后必须移到核内才能发挥功能[136]。最初的序列分析发现真核FEN1的C末端??有一信号序列,推测为核定位信号(nuclear?localization?signal,NLS),引导蛋白从细??胞质进入核内。通过点突变发现有两组带正电荷的残基KRK?(Lys-354、Arg-355、??Lys-356)和?KKK?(Lys-365、Lys-366、Lys-367)是?FEN1?核定位信号的关键残基[17]。??同时也发现在细胞周期的S期和发生DNA损伤时会诱导更多FEN1进入细胞核[17]。??近来首次发现,FEN1在核仁中聚集,在参与停滞的DNA复制叉分解和维持核糖体??DNA?(rDNA)的稳定性中起着重要的作用[115]。紫外照射(UV处理)之后,FEN1??发生磷酸化后从核仁移到核浆
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