云南宣威肺癌T-UCR表达谱分析

发布时间：2021-01-12 14:44

　　[目的]宣威地区发生的肺癌具有鲜明的特点,我们称之为宣威肺癌（lung cancer in Xuanwei,LCXW）。它的发病率和死亡率居全国之首,并呈不断上升的趋势。严峻的形势使得我们迫切地需要探索它的发病机制。T-UCRs是由UCRs转录而来的一类新的长链非编码RNA。UCRs是在人、小鼠和大鼠基因组上完全保守的区域,无任何的碱基缺失、插入或者突变,一致度达100%。极端的保守性意味着它可能有重要的生物学功能。新近的研究显示T-UCRs在肿瘤中频繁的失调,且在肿瘤中发挥着重要作用。不同类型的肿瘤都有其独特的T-UCR表达谱,而目前尚未见宣威肺癌T-UCR表达谱分析的相关研究。因此,我们旨在探索宣威肺癌中T-UCRs的表达模式,利用人类T-UCR芯片建立宣威肺癌不同分期的T-UCR表达谱。为T-UCRs进一步的功能研究奠定良好的基础并为宣威肺癌的机制研究、诊断及预后提供新的见解与思路。[方法]我们将26对宣威肺癌及癌旁非肿瘤样本根据病理分期分为三组,使用人类T-UCR芯片检测宣威肺癌各期T-UCR表达谱,筛选出各期差异表达的T-UCRs及相关基因,并综合分析三期表达谱,识别出三期一... 

【文章来源】：昆明医科大学云南省

【文章页数】：78 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图１－１?Ｉ、ＩＩ、ＩＩＩ期肺癌组织与癌旁非肿瘤肺组织的芯片扫描结果图??３潜在的Ｔ－ＵＣＲ?ｓ??芯片的４７５个探针覆盖了权威数据库（Ｒｅｆｓｅｑ、ＵＣＳＣ?ｋｎｏｗｎｇｅｎｅｓ、Ｅｎｓｅｍｂｌ）??预测的１５３条ｏｔｅｎｔｉａｌ?Ｔ－ＵＣＲｓ

??调。散点图（图１－２）与聚类分析图（图１－３）能够清楚的显示各期癌和癌旁差??异表达的Ｔ－ＵＣＲｓ。以差异倍数２?２．０为条件进一步筛选上述的１３３条探针信号，??发现Ｉ期ＬＣＸＷ样本中差异表达的Ｔ－ＵＣＲｓ３４个，其中２４个上调，１０个下调。??ＩＩ期４５个，３１个上调，１４个下调。Ｅｌ期８５个，５７个上调，２８个下调（表１－２）。??Ｉ到ＩＩＩ上调和下调的Ｔ－ＵＣＲｓ呈逐步增多的趋势。??？?ａｗ＊?急??，６［?１?＇？ｌ?????？??？?°?？?．?？??Ｏｆ?ｔｊ?？??Ｉ?．?ｒ?Ｌ，－??—?Ｉ?ｉ?？？？？？．．?？?＊?？??４?．＊＊．?？?？?＇，?＊?？？?？??？?．?？?ｌ?？?？？?？．．??ｉ?＊?？?？？?？?－??？２?４?？?ａ?Ｋ?４?？?Ｉ?Ｋ?Ｕ?Ｖ＜??—?ａｎ?■?ｉｒｉ?ｉ?ｗ??图１－２?Ｉ、ＩＩ、ＩＩＩ期潜在Ｔ－ＵＣＲｓ的散点图：Ｘ、Ｙ轴为两样本的归一化信号值。??“Ａ”代表癌组织，“Ｐ”代表癌旁非肿瘤肺组织。红色为上调，绿色为下调。??Ｃｏｌｏｒ?Ｋｅｙ????ｔｗｍ?＾??５?６?７?８?１??Ｖａｌｕｅ?１「」—｜??ｑ．?ａ?ｃｌ?＜?＜?＜??〇．＇?ａ．＇?＜?＜?＜??图１－３?Ｉ、ＩＩ、ＩＩＩ期潜在Ｔ－ＵＣＲｓ的聚类分析图：红色代表高表达

??调。散点图（图１－２）与聚类分析图（图１－３）能够清楚的显示各期癌和癌旁差??异表达的Ｔ－ＵＣＲｓ。以差异倍数２?２．０为条件进一步筛选上述的１３３条探针信号，??发现Ｉ期ＬＣＸＷ样本中差异表达的Ｔ－ＵＣＲｓ３４个，其中２４个上调，１０个下调。??ＩＩ期４５个，３１个上调，１４个下调。Ｅｌ期８５个，５７个上调，２８个下调（表１－２）。??Ｉ到ＩＩＩ上调和下调的Ｔ－ＵＣＲｓ呈逐步增多的趋势。??？?ａｗ＊?急??，６［?１?＇？ｌ?????？??？?°?？?．?？??Ｏｆ?ｔｊ?？??Ｉ?．?ｒ?Ｌ，－??—?Ｉ?ｉ?？？？？？．．?？?＊?？??４?．＊＊．?？?？?＇，?＊?？？?？??？?．?？?ｌ?？?？？?？．．??ｉ?＊?？?？？?？?－??？２?４?？?ａ?Ｋ?４?？?Ｉ?Ｋ?Ｕ?Ｖ＜??—?ａｎ?■?ｉｒｉ?ｉ?ｗ??图１－２?Ｉ、ＩＩ、ＩＩＩ期潜在Ｔ－ＵＣＲｓ的散点图：Ｘ、Ｙ轴为两样本的归一化信号值。??“Ａ”代表癌组织，“Ｐ”代表癌旁非肿瘤肺组织。红色为上调，绿色为下调。??Ｃｏｌｏｒ?Ｋｅｙ????ｔｗｍ?＾??５?６?７?８?１??Ｖａｌｕｅ?１「」—｜??ｑ．?ａ?ｃｌ?＜?＜?＜??〇．＇?ａ．＇?＜?＜?＜??图１－３?Ｉ、ＩＩ、ＩＩＩ期潜在Ｔ－ＵＣＲｓ的聚类分析图：红色代表高表达

【参考文献】：
期刊论文
[1]1973—2005年肺癌高发地区肺癌死亡趋势的分析[J]. 郝建华,黄云超,任宏轩,陈杨,郝曦,石青萍,肖义泽.  中国全科医学. 2009(24)



本文编号：2972983