FNDC3B circular RNA通过调控CD44的表达促进胃癌细胞迁移和侵袭
发布时间:2021-01-14 08:30
目的:环状RNA(circRNA)是一类由5’和3’末端共价连接形成的环状RNA分子,研究表明其在人类癌症中起着重要的调控作用,但circRNA在胃癌中的相关研究仍鲜少报道。本研究发现FND3B环状RNA(circFNDC3B)表达水平在胃癌组织中下降,提示circFNDC3B在胃癌发生发展过程中可能发挥着重要的作用。因此,本文以两种具有不同的circFNDC3B表达水平的胃癌细胞为主要的研究对象来探索circFNDC3B在胃癌发生发展过程中的作用与分子机制。方法:首先,利用qRT-PCR验证circFNDC3B在胃癌临床样本和胃癌细胞系中的表达水平;其次,采用无缝克隆技术构建circFNDC3B过表达载体和siRNA技术分别对MGC-803细胞和BGC-823细胞进行circFNDC3B表达水平的介入干扰,再通过一系列western blot、划痕实验、transwell实验和qRT-PCR等实验对circFNDC3B在胃癌细胞中的表型和功能作用进行探究;最后,采用RNA结合蛋白免疫沉淀分析(RIP)和RNApull-down实验分析证实circFNDC3B与IGF2BP3、CD44...
【文章来源】:厦门大学福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:84 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1.?circRNAs生物合成模型
双链RNA通过解锁茎环结构以拮抗circRNAs的生物发生[18]。随着探索circRNAs??生物合成的持续进展,张等人提出了类似于可变剪接的可变环化模型以系统性地??解释circRNAs的生成机制[7](如图2所示)。在RNA配对过程中,重复或非重??复的侧翼内含子互补序列的竞争会影响剪接选择和外显子环化,且横跨于侧翼内??含子的互补序列可明显促进外显子的环化。反向互补序列可以导致多个circRNAs??来源于同一个基因的转录本。由于互补序列在不同物种间的分布不同,可变环化??可导致物种之间的特异性环化。互补序列的存在可促进转录本通过可变环化形成??circRNAs,但互补序列对于外显子环化来说是必要但不充分条件[7],这个模型暗??示可变环化的复杂性和circRNAs的多样性,且一定程度上可能受其他因素的影??响,如RBPs正向或负向调控circRNAs的形成[5]。??2??
利用qRT-PCR检测5种胃癌细胞系(GES-l,AGS,SGC-7901,??MGC-803,?BGC-823)中?circFNDC3B?表达水平的差异,发现?circFNDC3B?的表??达水平在不同细胞系中呈现出不同的表达水平,结果如图3.2所示。SGC-7901??细胞和MGC-803细胞中circFNDC3B的表达水平明显低于GES-1细胞(正常胃??粘膜细胞系),分别为p<〇.〇〇〇l和P=〇.〇〇32,但BGC-823细胞的表达水平却明??显高于GES-1细胞(p=0.0007)。此外,本文还分析了每个细胞系中的FNDC3B??mRNA的表达水平,结果显示在MGC-803细胞中FNDC3B?mRNA明显增加??32??
【参考文献】:
期刊论文
[1]Circular RNA hsacirc0000745 may serve as a diagnostic marker for gastric cancer[J]. Mei Huang,Yi-Ren He,Li-Chuan Liang,Qiang Huang,Zhi-Qiang Zhu. World Journal of Gastroenterology. 2017(34)
[2]Minute signet ring cell carcinoma occurring in gastric hyperplastic polyp[J]. Shoji Hirasaki,Seiyuu Suzuki,Hiromitsu Kanzaki,Kohei Fujita,Shuji Matsumura,Eiji Matsumoto. World Journal of Gastroenterology. 2007(43)
[3]Frequent loss of heterozygosity at 8p22 chromosomal region in diffuse type of gastric cancer[J]. Hedayat Allah Hosseini,Ali Ahani,Hamid Galehdari,Ali Mohammad Froughmand,Masoud Hosseini,Abdolrahim Masjedizadeh,Mohammad Reza Zali. World Journal of Gastroenterology. 2007(24)
本文编号:2976572
【文章来源】:厦门大学福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:84 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1.?circRNAs生物合成模型
双链RNA通过解锁茎环结构以拮抗circRNAs的生物发生[18]。随着探索circRNAs??生物合成的持续进展,张等人提出了类似于可变剪接的可变环化模型以系统性地??解释circRNAs的生成机制[7](如图2所示)。在RNA配对过程中,重复或非重??复的侧翼内含子互补序列的竞争会影响剪接选择和外显子环化,且横跨于侧翼内??含子的互补序列可明显促进外显子的环化。反向互补序列可以导致多个circRNAs??来源于同一个基因的转录本。由于互补序列在不同物种间的分布不同,可变环化??可导致物种之间的特异性环化。互补序列的存在可促进转录本通过可变环化形成??circRNAs,但互补序列对于外显子环化来说是必要但不充分条件[7],这个模型暗??示可变环化的复杂性和circRNAs的多样性,且一定程度上可能受其他因素的影??响,如RBPs正向或负向调控circRNAs的形成[5]。??2??
利用qRT-PCR检测5种胃癌细胞系(GES-l,AGS,SGC-7901,??MGC-803,?BGC-823)中?circFNDC3B?表达水平的差异,发现?circFNDC3B?的表??达水平在不同细胞系中呈现出不同的表达水平,结果如图3.2所示。SGC-7901??细胞和MGC-803细胞中circFNDC3B的表达水平明显低于GES-1细胞(正常胃??粘膜细胞系),分别为p<〇.〇〇〇l和P=〇.〇〇32,但BGC-823细胞的表达水平却明??显高于GES-1细胞(p=0.0007)。此外,本文还分析了每个细胞系中的FNDC3B??mRNA的表达水平,结果显示在MGC-803细胞中FNDC3B?mRNA明显增加??32??
【参考文献】:
期刊论文
[1]Circular RNA hsacirc0000745 may serve as a diagnostic marker for gastric cancer[J]. Mei Huang,Yi-Ren He,Li-Chuan Liang,Qiang Huang,Zhi-Qiang Zhu. World Journal of Gastroenterology. 2017(34)
[2]Minute signet ring cell carcinoma occurring in gastric hyperplastic polyp[J]. Shoji Hirasaki,Seiyuu Suzuki,Hiromitsu Kanzaki,Kohei Fujita,Shuji Matsumura,Eiji Matsumoto. World Journal of Gastroenterology. 2007(43)
[3]Frequent loss of heterozygosity at 8p22 chromosomal region in diffuse type of gastric cancer[J]. Hedayat Allah Hosseini,Ali Ahani,Hamid Galehdari,Ali Mohammad Froughmand,Masoud Hosseini,Abdolrahim Masjedizadeh,Mohammad Reza Zali. World Journal of Gastroenterology. 2007(24)
本文编号:2976572
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