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金属离子对肿瘤抑制蛋白p53影响的分子模拟

发布时间:2021-01-25 22:07
  p53蛋白是一种肿瘤抑制蛋白,在人体内有重要的功能。本文通过分子模拟研究了金属离子Na+,K+,Ca2+,Mg2+,Zn2+对p53蛋白的影响。模拟结果显示,Mg2+离子导致p53蛋白RMSD值较大,说明Mg2+引起蛋白质构象变化较大。Mg2+影响p53蛋白核心区域与DNA结合能力,最终会影响p53蛋白功能。 

【文章来源】:大连大学学报. 2020,41(03)

【文章页数】:3 页

【部分图文】:

金属离子对肿瘤抑制蛋白p53影响的分子模拟


p53蛋白质结构

蛋白质,球状,水体,分子


放入蛋白质分子的球状水体

分布情况,离子,残基,幅度


图3是分子模拟的计算结果。从图3中可以看出,加入Mg2+后,p53蛋白质的RMSD值要明显比加入Na+,K+,Ca2+,Zn2+离子的值要高。这表明在Mg2+的作用下,p53蛋白质中各原子的运动幅度要高于在其他离子作用下的运动幅度。也就是说,Mg2+引起蛋白质构象变化较大,而这种大的变化有可能导致p53蛋白的突变。图4、图5从不同角度显示了分子模拟过程中,Mg2+作用下p53蛋白质分子中各氨基酸残基的RMSD值分布情况,其中红色表示残基活动剧烈,蓝色表示运动幅度较小,而白色则介于二者之间。从图中可以看出,在Mg2+影响下,蛋白质分子有几处氨基酸残基运动幅度较大,特别是图4右方α螺旋附近区域,有氨基酸残基运动剧烈。该区域是p53蛋白的核心区域,负责与DNA的结合,其氨基酸残基运动幅度较大有可能增加p53蛋白质与DNA结合概率,但是过大的运动幅度则该区域构象有可能发生突变,使p53蛋白质失去与DNA结合的能力,丧失DNA修复等功能。


本文编号:2999975

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