盆腔放疗影响宫颈癌患者肠道菌群临床研究
发布时间：2021-01-26 01:01
研究背景宫颈癌是女性生殖系统中最常见的恶性肿瘤,严重危及女性健康。我国大部分患者诊断时已是局部晚期,盆腔放疗是患者综合治疗过程中重要的手段。越来越多的研究表明,接受盆腔放疗的妇科肿瘤患者会发生肠道菌群失调。然而目前缺乏宫颈癌放疗患者肠道菌群结构和功能代谢方面的临床研究。研究目的通过对宫颈癌放疗患者肠道菌群多样性、群落结构、物种丰度和功能代谢的研究,探讨盆腔放疗对宫颈癌患者肠道微生态的影响,揭示这种影响造成的肠道菌群失平衡问题的生物学意义。研究方法2018年5月1日到2018年12月31日期间,在安徽医科大学附属省立医院西区肿瘤营养与代谢治疗科办理住院的宫颈癌放疗后患者,入选标准:（1）年龄≥18岁;（2）KPS≥60;（3）病理明确诊断宫颈恶性肿瘤;（4）既往接受盆腔放射治疗;（5）伴或不伴有放射性肠损伤临床表现。本研究共纳入34例宫颈癌放疗患者,录入人口学因素和肿瘤学特征等临床信息,并依据取样标准和要求采集入组患者的粪便标本。利用Illumina Mi Seq高通量测序平台对肠道菌群的16S r RNA基因v4区序列进行测序分析,并用QIIME 2等软件对测序序列进行生物信息学分析。...
【文章来源】：安徽医科大学安徽省
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
肠道损伤组（IG）与肠道非损伤组（NIG）肠道细菌群落的丰富度和Alpha多样性比较
安徽医科大学硕士学位论文15PCoA分析方法，每个点代表一个样本，椭圆组代表两个不同的临床分组。对两组进行Beta多样性显著性分析，结果示两组差异无明显统计学意义（P>0.05）(如图2A和图2B)[25-27]。图2利用Bray-Curtis距离、非加权和加权Unifrac度量对肠道损伤组（IG）与肠道非损伤组（NIG）肠道微生物多样性进行PCoA分析Fig2Principalcoordinateanalysis(PCoA)profileofmicrobialdiversityacrossIntestinalinjurygroup(IG)andIntestinalnon-injurygroup(NIG)usingBray-Curtisdistance,UnweightedandWeightedUnifracdistance注：P值范围为：*P<0.05，**P<0.01，***P<0.001，ns:P>0.053.3.3不同组间肠道菌群组成及差异分析肠道损伤组（IG）和肠道非损伤组（NIG）组间分类概况的比较显示，在属水平上，两组共筛选出5种菌属丰度具有显著性差异，分别为g_Acidaminococcus、g_Pyramidobacter、g_Dialister、g_Megasphaera、f_Dethiosulfovibrionaceae_uncl,结果示差异具有统计学意义（如图3）。
安徽医科大学硕士学位论文16图3肠道损伤组（IG）与肠道非损伤组（NIG）中相对丰度存在显著差异的属Fig3GenusoftherelativeabundanceofIntestinalinjurygroup(IG)andIntestinalnon-injurygroup(NIG)注：P值范围为：*P<0.05，**P<0.01，***P<0.001，ns:P>0.053.3.4两组患者肠道菌群功能与代谢通路分析为了评价两组肠道菌群代谢功能的差异，我们使用PICRUSt（PhylogeneticInvestigationofCommunitiesbyReconstructionofUnobservedStates）软件对肠道菌群代谢功能进行预测，以此分析。先将预测的宏基因组数据与KEGG数据库进行比对做出功能推断，然后使用Leftse（LinearDiscriminantAnalysisEffectSize）确定具有差异丰富的KEGG代谢途径[28-30]。结果示肠道损伤组（IG）患者中发现4种显著富集的代谢途径，而肠道非损伤组（NIG）患者中发现3种显著富集的代谢途径（如图4）。肠道损伤组（IG）患者中富集途径与萜类和聚酮类代谢、其他次生代谢产物的生物合成、其他氨基酸代谢、辅因子和维生素的代谢有关，例如：香叶醇降解、丁酰苷菌素和新霉素生物合成、β-丙氨酸代谢及视黄醇代谢。而肠道非损伤组（NIG）患者与膜转运、碳水化合物代谢、遗传信息翻译有关，例如：细菌分泌系统、乙醛酸和二羧酸盐代谢、RNA转运。
本文编号：3000203
【文章来源】：安徽医科大学安徽省
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
肠道损伤组（IG）与肠道非损伤组（NIG）肠道细菌群落的丰富度和Alpha多样性比较
安徽医科大学硕士学位论文15PCoA分析方法，每个点代表一个样本，椭圆组代表两个不同的临床分组。对两组进行Beta多样性显著性分析，结果示两组差异无明显统计学意义（P>0.05）(如图2A和图2B)[25-27]。图2利用Bray-Curtis距离、非加权和加权Unifrac度量对肠道损伤组（IG）与肠道非损伤组（NIG）肠道微生物多样性进行PCoA分析Fig2Principalcoordinateanalysis(PCoA)profileofmicrobialdiversityacrossIntestinalinjurygroup(IG)andIntestinalnon-injurygroup(NIG)usingBray-Curtisdistance,UnweightedandWeightedUnifracdistance注：P值范围为：*P<0.05，**P<0.01，***P<0.001，ns:P>0.053.3.3不同组间肠道菌群组成及差异分析肠道损伤组（IG）和肠道非损伤组（NIG）组间分类概况的比较显示，在属水平上，两组共筛选出5种菌属丰度具有显著性差异，分别为g_Acidaminococcus、g_Pyramidobacter、g_Dialister、g_Megasphaera、f_Dethiosulfovibrionaceae_uncl,结果示差异具有统计学意义（如图3）。
安徽医科大学硕士学位论文16图3肠道损伤组（IG）与肠道非损伤组（NIG）中相对丰度存在显著差异的属Fig3GenusoftherelativeabundanceofIntestinalinjurygroup(IG)andIntestinalnon-injurygroup(NIG)注：P值范围为：*P<0.05，**P<0.01，***P<0.001，ns:P>0.053.3.4两组患者肠道菌群功能与代谢通路分析为了评价两组肠道菌群代谢功能的差异，我们使用PICRUSt（PhylogeneticInvestigationofCommunitiesbyReconstructionofUnobservedStates）软件对肠道菌群代谢功能进行预测，以此分析。先将预测的宏基因组数据与KEGG数据库进行比对做出功能推断，然后使用Leftse（LinearDiscriminantAnalysisEffectSize）确定具有差异丰富的KEGG代谢途径[28-30]。结果示肠道损伤组（IG）患者中发现4种显著富集的代谢途径，而肠道非损伤组（NIG）患者中发现3种显著富集的代谢途径（如图4）。肠道损伤组（IG）患者中富集途径与萜类和聚酮类代谢、其他次生代谢产物的生物合成、其他氨基酸代谢、辅因子和维生素的代谢有关，例如：香叶醇降解、丁酰苷菌素和新霉素生物合成、β-丙氨酸代谢及视黄醇代谢。而肠道非损伤组（NIG）患者与膜转运、碳水化合物代谢、遗传信息翻译有关，例如：细菌分泌系统、乙醛酸和二羧酸盐代谢、RNA转运。
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