人的ARID1A启动子区域G-四链体结构的鉴定及其功能的研究
发布时间：2021-02-04 12:21
人的ARID1A是SWI/SNF家族的一员,在调节染色体结构和基因的表达方面发挥着重要作用。ARID1A的抑癌作用已经被明确确定,其转录活性在很多肿瘤中都被抑制。在肿瘤细胞中,ARID1A表达的下调可能与基因组缺失、DNA甲基化和microRNA介导的抑制作用有关,能否将恢复ARID1A的转录活性作为抗癌药物的研制思路有待证实。G-四链体结构广泛存在于基因组中,对染色体DNA复制和RNA剪切及其稳定性等方面有重要的调节作用,而靶向存在于启动子区域G-四链体结构治疗疾病的研究并不多,还有很大的研究空间。在本研究中我们利用多种实验方法证实了在ARID1A启动子区域形成了 G-四链体结构,同时发现G-四链体结构可以激活ARID1A基因转录,以此提供了一种治疗癌症的思路。具体研究结果如下:1.利用QGRS Mapper方法预测到人的ARID1A启动子区域可能存在G-四链体结构;根据ARID1A启动子可能形成G-四链体区域的序列合成寡核苷酸,通过圆二色性以及热稳定性实验评估了对这些寡核苷酸形成G-四链体的影响,利用非变性聚丙烯凝胶电泳,验证不同条件下这些寡核苷酸形成结构差异:染色质免疫共沉淀证实...
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：115 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－１?Ｇ－四链体的模式图［７４】??
?复制过程中发生的错误。当解旋酶的作用失调时，基因组编码信息的完整性会受到影??响，这不仅会导致复制或者转录发生错误，还会引起细胞衰老、死亡、癌变、组织水平??的老化以及神经相关的病变［７４］。某些转朵丨Ａ：］子的结合位点与形成Ｇ－四链体区域的部分??序列相同，因此这些调控因子对基因表达的调节会受到启动子Ｋ域是否形成Ｇ－四链体??结构的影响，这些Ｇ－四链体结构对基因的调节有可能是促进作用（作为转录因子的结??合位点）也有可能是抑制作用（作为一种屏障或者破坏双链结合位点）［１（）７］（图１－２）。??Ａ?＇⑶?８??Ｉ?ｖ?１１?ｔＴｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔ?ｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔ?＇ｉＶＶＷＶｉｉ?ｒＴＴ＾＾＾＾ＴＴＴｍ??ｔｌｌｌｌｌｉｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌｉｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌｉｌｌｌｌｌｌｌｌ?１?ｉ?金?Ｉ?１?Ｉ?１?Ｉ?Ｉ?Ｉ?皇?Ｉ?Ｉ?１?Ｉ?Ｉ?Ｉ?１?１?１?Ｉ?Ｉ?１?Ｉ?Ｉ?１?１?童?Ｉ?ｉ?ｉ?里?Ｉ?Ｉ??Ｉｔｊ??ｃ?ｍ．?ｄ??１?＇?＊?＊?ｋ?＇?＇?１?＇?＇?＇?１?？?ｉ?？?１?＇?＇?、’?ｐＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴ?ｉＷＩｉｉＨｉｉｉＩＩｉｉＩｉｉＴ?＾ＴＴ?．ＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴ??ｌｉｉｌｌｌｉｉ?里?１鱼量．１１１１１皇１息１?鱼鱼？？？ｔｉｉｉｉ?皇?ｉｉｉｉｉｉ??图１－２?ＤＮＡ的Ｇ－四链体结构在ＲＮＡ聚合酶参与转录过程中可能＃在的作用［７４】??Ａ．?［？１１断转泌（橙色表小ＲＮＡ聚合酶）。Ｂ．促进转珙。Ｃ．激活转氽（蓝色表示与Ｇ－四链体结合的转??录因子）。Ｄ．转录抑制：Ｇ－四链体结构ｉｉｆ以结合转氽抑制蛋白（绿色）
植物的同源结构一锌指结构域，并且都是作为??核小体重塑以及组蛋白脱乙酰酶复合物中的亚基发挥作用的［１１４，?１１６］。而第三个亚科包括??ＣＨＤ５、ＣＨＤ６、ＣＨＤ７、ＣＨＤ８和ＣＨＤ９［Ｕ１］。ＣＨＤ家族的大多数基因在人类组织中广??泛表达，但是这里只有ＣＨＤ５的表达主要局限于神经元中［１１４＿＿。??１．４．２．２?ＣＨＤ２与ＣＨＤ８的生物功能??ＣＨＤ２作为一种ＡＴＰ依赖性酶，可以重塑染色质结构［１１７］。ＣＨＤ２由Ｎ端的两个功??能域、一个ＡＴＰ结合域和一个ＤＮＡ结合域构成（图１－３）。通过研宄发现ＣＨＤ２的Ｎ－??末端区域是ＣＨＤ２发挥染色质重塑功能的必须结构域。ＣＨＤ２现在己经广泛被用作癫痫??病基因鉴定的靶基因，尤其是儿童期严重癫痫病的发作与ＣＨＤ２基因缺失密不可分??［１１８］。含有ＣＨＤ２基因突变的纯合子小鼠会死亡，杂合子小鼠的存活率也会显著的降低??［１１９］。利用基因敲除技术产生的ＣＨＤ２基因杂合的斑马鱼会发生癫痫并且生长发育迟缓??［１２＜）］。在人类中，ＣＨＤ２杂合的患者有多种发育缺陷［１２１］。对人成肌细胞中ＣＨＤ２的研宄??发现，如果ＣＨＤ２缺失会降低成肌细胞向肌细胞的转化过程ｔ１２２Ｌ这些发现表明了??ＣＨＤ２在人和动物的生长发育过程中非常重要。??１?１８２８??Ｃｈｒｏｍｏｄｏｍａｉｎｓ?ＡＴＰ－ｈｅｌｉｃａｓｅ?ｄｏｍａｉｎ??ＤＥＤＸ－ｈｅｌｉｃａｓｅ?ｄｏｍａｉｎ??图１－３?ＣＨＤ２蛋白结构示意图［１２３１??两个染色质结构域（Ｃｈｒｏｍｏｄｏｍａｉｎｓ），两个解旋酶结合区（ＡＴＰ－ｈｅｌｉｃａｓｅ?ｄｏｍａｉｎ和ＤＥＤＸ－ｈｅｌｉｃａｓｅ??ｄｏｍａｉｎ），?一个Ｄ
【参考文献】：
期刊论文
[1]加强癌症早诊早治,实施健康中国战略[J]. 陈万青,曹毛毛. 中国肿瘤. 2019(09)
[2]HPV多重感染与宫颈癌及癌前病变发生、发展的相关性[J]. 郑家凤,周燕. 实用癌症杂志. 2019(07)
[3]乳腺癌不同分子分型和临床病理特征对预后的影响[J]. 郝增山. 临床研究. 2019(07)
[4]2004-2016年中国女性生殖系统恶性肿瘤死亡趋势分析[J]. 魏长慧,朱继存,牛媛娜,王璐,贺君剑,马婧,孙长青. 中华疾病控制杂志. 2019(05)
[5]乳腺癌分子分型与临床病理特征的相关性研究[J]. 黄亮亮,吕俊远,唐应麒,熊代刚,蔡玉怀,程晓明. 重庆医学. 2019(10)
[6]乳腺癌分子分型研究进展[J]. 卢振东,孙晓晓,谢龙祥,张璐,厉永强,韩亚莉,郭向前,闫中义. 河南大学学报(医学版). 2018(04)
本文编号：3018299
【文章来源】：东北林业大学黑龙江省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：115 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
图１－１?Ｇ－四链体的模式图［７４】??
?复制过程中发生的错误。当解旋酶的作用失调时，基因组编码信息的完整性会受到影??响，这不仅会导致复制或者转录发生错误，还会引起细胞衰老、死亡、癌变、组织水平??的老化以及神经相关的病变［７４］。某些转朵丨Ａ：］子的结合位点与形成Ｇ－四链体区域的部分??序列相同，因此这些调控因子对基因表达的调节会受到启动子Ｋ域是否形成Ｇ－四链体??结构的影响，这些Ｇ－四链体结构对基因的调节有可能是促进作用（作为转录因子的结??合位点）也有可能是抑制作用（作为一种屏障或者破坏双链结合位点）［１（）７］（图１－２）。??Ａ?＇⑶?８??Ｉ?ｖ?１１?ｔＴｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔ?ｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔｔ?＇ｉＶＶＷＶｉｉ?ｒＴＴ＾＾＾＾ＴＴＴｍ??ｔｌｌｌｌｌｉｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌｉｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌｌｉｌｌｌｌｌｌｌｌ?１?ｉ?金?Ｉ?１?Ｉ?１?Ｉ?Ｉ?Ｉ?皇?Ｉ?Ｉ?１?Ｉ?Ｉ?Ｉ?１?１?１?Ｉ?Ｉ?１?Ｉ?Ｉ?１?１?童?Ｉ?ｉ?ｉ?里?Ｉ?Ｉ??Ｉｔｊ??ｃ?ｍ．?ｄ??１?＇?＊?＊?ｋ?＇?＇?１?＇?＇?＇?１?？?ｉ?？?１?＇?＇?、’?ｐＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴ?ｉＷＩｉｉＨｉｉｉＩＩｉｉＩｉｉＴ?＾ＴＴ?．ＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴＴ??ｌｉｉｌｌｌｉｉ?里?１鱼量．１１１１１皇１息１?鱼鱼？？？ｔｉｉｉｉ?皇?ｉｉｉｉｉｉ??图１－２?ＤＮＡ的Ｇ－四链体结构在ＲＮＡ聚合酶参与转录过程中可能＃在的作用［７４】??Ａ．?［？１１断转泌（橙色表小ＲＮＡ聚合酶）。Ｂ．促进转珙。Ｃ．激活转氽（蓝色表示与Ｇ－四链体结合的转??录因子）。Ｄ．转录抑制：Ｇ－四链体结构ｉｉｆ以结合转氽抑制蛋白（绿色）
植物的同源结构一锌指结构域，并且都是作为??核小体重塑以及组蛋白脱乙酰酶复合物中的亚基发挥作用的［１１４，?１１６］。而第三个亚科包括??ＣＨＤ５、ＣＨＤ６、ＣＨＤ７、ＣＨＤ８和ＣＨＤ９［Ｕ１］。ＣＨＤ家族的大多数基因在人类组织中广??泛表达，但是这里只有ＣＨＤ５的表达主要局限于神经元中［１１４＿＿。??１．４．２．２?ＣＨＤ２与ＣＨＤ８的生物功能??ＣＨＤ２作为一种ＡＴＰ依赖性酶，可以重塑染色质结构［１１７］。ＣＨＤ２由Ｎ端的两个功??能域、一个ＡＴＰ结合域和一个ＤＮＡ结合域构成（图１－３）。通过研宄发现ＣＨＤ２的Ｎ－??末端区域是ＣＨＤ２发挥染色质重塑功能的必须结构域。ＣＨＤ２现在己经广泛被用作癫痫??病基因鉴定的靶基因，尤其是儿童期严重癫痫病的发作与ＣＨＤ２基因缺失密不可分??［１１８］。含有ＣＨＤ２基因突变的纯合子小鼠会死亡，杂合子小鼠的存活率也会显著的降低??［１１９］。利用基因敲除技术产生的ＣＨＤ２基因杂合的斑马鱼会发生癫痫并且生长发育迟缓??［１２＜）］。在人类中，ＣＨＤ２杂合的患者有多种发育缺陷［１２１］。对人成肌细胞中ＣＨＤ２的研宄??发现，如果ＣＨＤ２缺失会降低成肌细胞向肌细胞的转化过程ｔ１２２Ｌ这些发现表明了??ＣＨＤ２在人和动物的生长发育过程中非常重要。??１?１８２８??Ｃｈｒｏｍｏｄｏｍａｉｎｓ?ＡＴＰ－ｈｅｌｉｃａｓｅ?ｄｏｍａｉｎ??ＤＥＤＸ－ｈｅｌｉｃａｓｅ?ｄｏｍａｉｎ??图１－３?ＣＨＤ２蛋白结构示意图［１２３１??两个染色质结构域（Ｃｈｒｏｍｏｄｏｍａｉｎｓ），两个解旋酶结合区（ＡＴＰ－ｈｅｌｉｃａｓｅ?ｄｏｍａｉｎ和ＤＥＤＸ－ｈｅｌｉｃａｓｅ??ｄｏｍａｉｎ），?一个Ｄ
【参考文献】：
期刊论文
[1]加强癌症早诊早治,实施健康中国战略[J]. 陈万青,曹毛毛. 中国肿瘤. 2019(09)
[2]HPV多重感染与宫颈癌及癌前病变发生、发展的相关性[J]. 郑家凤,周燕. 实用癌症杂志. 2019(07)
[3]乳腺癌不同分子分型和临床病理特征对预后的影响[J]. 郝增山. 临床研究. 2019(07)
[4]2004-2016年中国女性生殖系统恶性肿瘤死亡趋势分析[J]. 魏长慧,朱继存,牛媛娜,王璐,贺君剑,马婧,孙长青. 中华疾病控制杂志. 2019(05)
[5]乳腺癌分子分型与临床病理特征的相关性研究[J]. 黄亮亮,吕俊远,唐应麒,熊代刚,蔡玉怀,程晓明. 重庆医学. 2019(10)
[6]乳腺癌分子分型研究进展[J]. 卢振东,孙晓晓,谢龙祥,张璐,厉永强,韩亚莉,郭向前,闫中义. 河南大学学报(医学版). 2018(04)
本文编号：3018299
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