MYC调控剪接因子PQBP1和SF3B1在卵巢癌中的表达机制
发布时间:2021-02-08 18:34
MYC是一个转录因子,隶属于bHLH-LZ家族,其常与Max相互作用形成二聚体靶向特定DNA序列(CACGTG)调控众多基因转录,因其介导了超过30%的肿瘤发生而作为经典癌基因为人们所熟知。大部分肿瘤如卵巢癌、乳腺癌及结肠癌等都存在MYC的基因扩增和异常激活。人类基因组约15%的基因受MYC转录调控,例如E2F2、CDKN1A、CCND1等。MYC通过调控众多基因的转录,在促进血管形成、促进肿瘤发生,以及诱导肿瘤细胞恶性增殖和分化及等方面占据重要地位。最近研究表明,MYC能够调控肿瘤细胞代谢。虽然大量研究解析了 MYC在肿瘤中的生物学功能,也有众多靶基因陆续被发现。但是仍然存在很多机制没有阐明。2015年Nature文章报道MYC介导的肿瘤细胞依赖剪接体生存,MYC与剪接因子BUD31存在合成致死效应,靶向剪接体可有效杀死MYC介导的肿瘤,但是MYC依赖剪接体生存的机制在该文章中并没有阐明。本课题论证了 MYC能够通过转录调控致癌剪接因子的表达促进肿瘤细胞存活。剪接是指pre-mRNA内含子被剪掉,外显子被拼接的过程。其发生在细胞核中,由snRNP识别pre-mRNA剪接位点,经两次转...
【文章来源】:山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1A);通过GEPIA2网站对MYC的预后进行分析,发现MYC高表??达的高级别浆液性卵巢癌患者预后较差(图1B)
.?__■_???im?—.??■■?s????■.■._.■■?__'.v.'.-_t.,?.,.-1.'..'?1?■■■._■■?■"??猶._?‘;,■?.:??-'*::■*??MVC'?j??■*=■4*?m??POLR2A?j!??-:.全?__?■??,■*?气《4?■—?,?I?????■?A?i?1?._■___?!蠱??m?-jmmJKmJkmjk_*?_■??m?m?m??_????_????图1:?MYC在HGSOC中拷贝数增加并与剪接因子关系密切??A.?TCGA数据库分析卵巢癌患者中MYC表达量的遗传变化。B.?MYC转基因小鼠进??行GO分析对各项事件发生数量排序,其中选择性剪接事件改变占第三位。C.HGSOC中??MYC高表达与预后不良相关。D.ChIP-seq分析预测MYC对PQBP1和SHB1有潜在调控。??2.MYC过表达和敲低细胞系的构建??为验证MYC对剪接因子PQBP1和SF3B1是否存在调控作用,我们构建了??MYC过表达和敲低细胞系。过表达病毒载体购买自吉凯公司,敲低病毒载体为??实验室构建。敲低细胞系的建立,从Sigma官网获取si-MYC序列,PCR扩增后??克隆到PLKO/Tet-on载体。慢病毒的包装使用经典慢病毒三质粒包装体系,包括??—个目的质粒PLKO-sh-MYC和两个包装质粒psPAX-2和PMD2G。使用lipo2000??转染293T细胞,然后48?h、72?h后收两次病毒液,0.45?pM滤器过滤病毒液备??用。取1?mL病毒液感染A2780、SKOV3、HEY、HO8910等卵巢癌
图4:?MYC转录调控PQBPK?SF3B1??
本文编号:3024355
【文章来源】:山东大学山东省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】:72 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图1A);通过GEPIA2网站对MYC的预后进行分析,发现MYC高表??达的高级别浆液性卵巢癌患者预后较差(图1B)
.?__■_???im?—.??■■?s????■.■._.■■?__'.v.'.-_t.,?.,.-1.'..'?1?■■■._■■?■"??猶._?‘;,■?.:??-'*::■*??MVC'?j??■*=■4*?m??POLR2A?j!??-:.全?__?■??,■*?气《4?■—?,?I?????■?A?i?1?._■___?!蠱??m?-jmmJKmJkmjk_*?_■??m?m?m??_????_????图1:?MYC在HGSOC中拷贝数增加并与剪接因子关系密切??A.?TCGA数据库分析卵巢癌患者中MYC表达量的遗传变化。B.?MYC转基因小鼠进??行GO分析对各项事件发生数量排序,其中选择性剪接事件改变占第三位。C.HGSOC中??MYC高表达与预后不良相关。D.ChIP-seq分析预测MYC对PQBP1和SHB1有潜在调控。??2.MYC过表达和敲低细胞系的构建??为验证MYC对剪接因子PQBP1和SF3B1是否存在调控作用,我们构建了??MYC过表达和敲低细胞系。过表达病毒载体购买自吉凯公司,敲低病毒载体为??实验室构建。敲低细胞系的建立,从Sigma官网获取si-MYC序列,PCR扩增后??克隆到PLKO/Tet-on载体。慢病毒的包装使用经典慢病毒三质粒包装体系,包括??—个目的质粒PLKO-sh-MYC和两个包装质粒psPAX-2和PMD2G。使用lipo2000??转染293T细胞,然后48?h、72?h后收两次病毒液,0.45?pM滤器过滤病毒液备??用。取1?mL病毒液感染A2780、SKOV3、HEY、HO8910等卵巢癌
图4:?MYC转录调控PQBPK?SF3B1??
本文编号:3024355
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zlx/3024355.html