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利用CRISPR/Cas9系统构建HMGA2敲除肝癌细胞系与兔模型

发布时间:2021-02-27 07:46
  研究背景及目的:高迁移率蛋白A2(high-mobilitygroup AT-hook2,HMGA2)属于高迁移率蛋白超家族成员,是一种非组蛋白染色质结合蛋白。通过三个AT-hook区高亲和力的结合到基因组中AT富集的区域,从而改变染色质的空间构象,进而发挥基因表达调控功能。HMGA2主要在动物的胚胎期高表达,而在正常成体组织中表达量很低或几乎不表达,HMGA2突变或缺失的动物表现出严重的胎儿发育阻滞以及明显的侏儒表型,表明HMGA2主要与动物的胚胎发育有关,参与动物的生长发育调节;此外,研究发现在大部分肿瘤细胞中HMGA2也相对于癌旁组织高表达,而且参与了肿瘤细胞的增殖、迁移、侵袭等致瘤过程,还与患者的预后不良有关,表明HMGA2也是一个重要的致癌因子。综合以上信息,本课题首先探究了 HMGA2在肝癌细胞系HepG2中的作用,检测HMGA2的失活对于肝癌细胞相关代谢、生长、增殖的影响;其次,以兔为模式动物,期望采用CRISPR/Cas9系统敲除HMGA2基因制备侏儒兔模型,为实验动物微型化以及侏儒症研究提供一种模型动物。研究方法:(1)在人的HMGA2基因第一外显子和第二外显子处各设... 

【文章来源】:南方医科大学广东省

【文章页数】:104 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

利用CRISPR/Cas9系统构建HMGA2敲除肝癌细胞系与兔模型


图2-1?HMGA2在不同组织样本中的表达??Figure?2-1?Different?expression?of?HMGA2?in?different?tumor?tissues??

序列,位点,序列,外显子


?颂士学位论文???2.4.2?sgRNA?设计??采用在线sgRNA设计软件,在人HMGA2基因的第一外显子与第二外显子处各设计??一对sgRNA,分别命名为sgEl和sgE2?(如图2-2)。为了便于与Bbsl酶切的PX458载体??连接,需在sgRNA正义链的5'端添加CACC接头,反义链的3端添加AAAC接头。此外,??由于sgE2的5端不是以G开头,为了提高U6启动子的活性,需在sgE2的5'端额外添加一??个G。最终得到的sgRNA?oligo序列如表2-1所示。??ACAATTAGGAACCAACCGGTGAGCCCTCTCCTAAGAGACCCAGGGGA??TGTTAATCCTTGGrTGGCCACTCGGGAGAGGATTCTCTGGGTCCCCT??—??PAM?sbE2???????El?E2?E3?E4?E5??_?t?—?:.6kb?_??^CAACCTGCCGCCCCAGCGCCTCAGAAGAGAGGACGCGGCCGCCCCAGG??GTTGGACGGCGGGGTCGCGGAGTCTTCTCTCCTGCGCCGGCGGGGTCC??PAM??图2-2?sgRNA位点??Figure?2-2?The?locus?of?sgRNA??表2-1?sgRNA?oligo序列??Table?2-11'he?sequence?of?sgRNA?oligo??序列名称?序列(5'—3')??Name?Sequence?(5’—3')??sgEl-T?CACCGTCCTCTCTTCTGAGGCGCT??sgEl-B?AAACAGCGCCTCAGAAGAGA

利用CRISPR/Cas9系统构建HMGA2敲除肝癌细胞系与兔模型


图2-3?PX458酶切结果(M:?DL15000marker,?Linel:PX458,Line2:PX458酶切)??

【参考文献】:
期刊论文
[1]高迁移率族蛋白A2与原发性肝细胞癌患者临床病理特征及其预后的关系[J]. 杨晋,夏先明,贺凯,张孟瑜,冯春红,秦蜀.  中国现代医学杂志. 2019(24)
[2]PCOS易感基因Hmga2在小鼠子宫蜕膜化中的表达与调节[J]. 曹永芝,赵跃然,林德贵.  中国实验动物学报. 2017(05)



本文编号:3053919

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