基于数据分析N-cadherin在肝癌中的表达及N-糖基化位点突变体的构建
发布时间：2021-04-22 21:54
在癌细胞中经常会检测到蛋白质上的糖基化情况发生改变,肿瘤发生时,糖基化发生异常从而导致糖蛋白上发生糖链结构或者糖链数目上的改变,脂类分子上也存在此种现象导致糖脂中的糖链发生改变;除此之外,和糖链存在相互作用的糖结合蛋白（GBPs）的表达情况也会发生改变。细胞表面的糖蛋白会参与到许多重要的生物学过程中,其上的糖基化作用对于糖蛋白功能具有重要影响;研究表明,糖蛋白上异常糖基化作用会引起肿瘤细胞侵袭迁移能力发生改变等肿瘤恶性表型。神经型钙黏附蛋白（N-cadherin）作为上皮-间充质转化（EMT）的一种标志物、钙粘蛋白家族的重要成之一,临床研究表明,N-cadherin主要定位于细胞膜以及细胞连接部位,其功能主要是介导细胞间的黏附作用,虽然N-cadherin是一种典型的糖蛋白,但是对于其上的糖基化研究尚不明确,因此研究N-cadherin上的糖基化作用对于癌症的具体影响具有重要意义。本研究基于数据对N-cadherin在正常人体和癌症病人同一器官内的表达情况进行分析,发现与正常人体相比,癌症患者部分器官N-cadherin表达量出现变化。对N-cadherin在肝癌和癌旁组织中mRNA水...
【文章来源】：哈尔滨工业大学黑龙江省 211工程院校 985工程院校
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 绪论
1.1 课题研究背景及目的和意义
1.2 糖基化对肿瘤的影响
1.2.1 肿瘤细胞的异常糖基化
1.2.2 糖基化与肿瘤侵袭、转移
1.2.3 糖基化与肿瘤免疫
1.2.4 糖基化与肿瘤耐药性
1.3 糖基化与蛋白质稳定性
1.3.1 蛋白质稳定性简介
1.3.2 蛋白质稳定性的影响因素
1.3.3 糖基化对蛋白质稳定性的影响
1.4 钙粘蛋白
1.4.1 钙粘蛋白的基本结构与特征
1.4.2 E-cadherin简介
1.4.3 N-cadherin简介
1.5 N-cadherin功能
1.5.1 N-cadherin结构
1.5.2 N-cadherin在正常细胞中的功能
1.5.3 N-cadherin与肿瘤的侵袭迁移
1.5.4 N-cadherin参与的信号转导
1.5.5 N-cadherin突变与疾病
1.5.6 N-cadherin糖基化及其功能
1.6 本文的主要研究内容
1.6.1 基于数据分析肝癌中N-cadherin的表达与相关基因富集分析
1.6.2 N-cadherin野生型及N-糖基化位点突变体的构建
第2章 材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 细胞系
2.1.2 质粒和重组体
2.1.3 实验仪器
2.1.4 实验试剂
2.1.5 实验试剂配方
2.1.6 引物序列
2.1.7 抗体
2.1.8 主要分析软件
2.2 实验方法
2.2.1 细胞培养
2.2.2 RNA提取和逆转录
2.2.3 重组体构建
2.2.4 细胞转染
2.2.5 细胞总蛋白提取
2.2.6 蛋白质免疫印迹
第3章 基于数据分析肝癌中N-cadherin的表达与相关基因富集分析
3.1 引言
3.2 N-cadherin在肝癌中的表达
3.2.1 N-cadherin在人体各器官的分布
3.2.2 N-cadherin在不同癌症中的表达情况
3.2.3 N-cadherin在染色体上的位置图
3.2.4 肝癌与癌旁组织中N-cadherin在mRNA水平上的表达差异
3.2.5 N-cadherin对肝癌预后的影响
3.3 N-cadherin在肝癌中的相关基因富集分析
3.3.1 肝癌中N-cadherin与其他mRNA的相关性
3.3.2 N-cadherin与其他蛋白质的相关性
3.3.3 肝癌中N-cadherin相关基因KEGG富集分析
3.3.4 肝癌中N-cadherin相关基因GO富集分析
3.3.5 肝癌中N-cadherin相关基因的基因功能网络图
3.4 本章小结
第4章 N-cadherin野生型及N-糖基化位点突变体的构建
4.1 引言
4.2 肝癌中N-cadherin基因和蛋白结构域突变生物信息分析
4.3 N-cadherin N-糖基化位点预测
4.4 pCMV-Flag-N-cadherin重组体构建
4.5 N-cadherin单糖基化位点突变重组体构建
4.6 pCMV-Flag-N-cad-MA重组体构建
4.7 N-cadherin糖基化位点突变重组体的表达检测
4.8 本章小结
结论
展望
参考文献
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]肿瘤糖基化在肿瘤免疫逃避中的意义[J]. 路佩佩,刘风玲. 肿瘤学杂志. 2020(05)
[2]蛋白糖基化修饰在肿瘤多药耐药中的作用[J]. 胡一,何东,曹科,龚恋. 中国肿瘤临床. 2019(23)
[3]肿瘤异常糖链糖蛋白在乳腺癌中的表达及其临床意义[J]. 多斯波力·扎克汗,木扎帕尔·阿部都克热木,马斌林. 世界最新医学信息文摘. 2019(72)
[4]B7-H3对人肝癌细胞生物学特性的影响及临床意义[J]. 梁诗琪,张香西,庄小津,王钰禾,邹秋琴,张文敏. 福建医科大学学报. 2019(03)
[5]2018全球癌症统计报告解读[J]. 王宁,刘硕,杨雷,张希,袁延楠,李慧超,季加孚. 肿瘤综合治疗电子杂志. 2019(01)
[6]GRP78异常O-糖基化对乳腺癌细胞侵袭迁移的影响[J]. 刘洋,谢蓉,王秀敏,赵丽娜,王茜,吴琛. 河北大学学报(自然科学版). 2018(01)
[7]蛋白质糖基化修饰的研究进展[J]. 王晓龙,王秀然,卢天成. 基因组学与应用生物学. 2017(10)
[8]糖基化在肿瘤免疫中的作用[J]. 王立萍,陈茜茜,袁庆民,汪淑晶. 中国免疫学杂志. 2017(02)
[9]神经钙黏蛋白调控Akt/PKB信号通路对神经干细胞增殖的影响[J]. 颜建辉,黄丽娟,杨柳,陈雁斌,华力明. 中国老年学杂志. 2016(08)
[10]E-cadherin在肿瘤治疗中的研究进展[J]. 常琳琳,朱虹,郑琳,曹戟,罗沛华,何俏军. 药学进展. 2015(10)
博士论文
[1]N-cadherin在肝癌侵袭转移中的作用及其机制研究[D]. 占大钱.华中科技大学 2011
硕士论文
[1]GnT-Ⅳa通过Vimentin影响肝癌细胞迁移和侵袭的机制初探[D]. 王丰有.哈尔滨工业大学 2019
[2]肺癌患者肿瘤异常糖链蛋白的表达及其意义探讨[D]. 黄婷婷.安徽医科大学 2018
[3]N-cadherin和β-catenin异常表达对细胞粘附、增殖及经典Wnt信号通路的影响[D]. 朱少义.新乡医学院 2018
[4]N-cadherin对人牙髓干细胞增殖、迁移及成牙本质向分化的作用研究[D]. 邓子龙.南方医科大学 2016
本文编号：3154534
【文章来源】：哈尔滨工业大学黑龙江省 211工程院校 985工程院校
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 绪论
1.1 课题研究背景及目的和意义
1.2 糖基化对肿瘤的影响
1.2.1 肿瘤细胞的异常糖基化
1.2.2 糖基化与肿瘤侵袭、转移
1.2.3 糖基化与肿瘤免疫
1.2.4 糖基化与肿瘤耐药性
1.3 糖基化与蛋白质稳定性
1.3.1 蛋白质稳定性简介
1.3.2 蛋白质稳定性的影响因素
1.3.3 糖基化对蛋白质稳定性的影响
1.4 钙粘蛋白
1.4.1 钙粘蛋白的基本结构与特征
1.4.2 E-cadherin简介
1.4.3 N-cadherin简介
1.5 N-cadherin功能
1.5.1 N-cadherin结构
1.5.2 N-cadherin在正常细胞中的功能
1.5.3 N-cadherin与肿瘤的侵袭迁移
1.5.4 N-cadherin参与的信号转导
1.5.5 N-cadherin突变与疾病
1.5.6 N-cadherin糖基化及其功能
1.6 本文的主要研究内容
1.6.1 基于数据分析肝癌中N-cadherin的表达与相关基因富集分析
1.6.2 N-cadherin野生型及N-糖基化位点突变体的构建
第2章 材料与方法
2.1 实验材料
2.1.1 细胞系
2.1.2 质粒和重组体
2.1.3 实验仪器
2.1.4 实验试剂
2.1.5 实验试剂配方
2.1.6 引物序列
2.1.7 抗体
2.1.8 主要分析软件
2.2 实验方法
2.2.1 细胞培养
2.2.2 RNA提取和逆转录
2.2.3 重组体构建
2.2.4 细胞转染
2.2.5 细胞总蛋白提取
2.2.6 蛋白质免疫印迹
第3章 基于数据分析肝癌中N-cadherin的表达与相关基因富集分析
3.1 引言
3.2 N-cadherin在肝癌中的表达
3.2.1 N-cadherin在人体各器官的分布
3.2.2 N-cadherin在不同癌症中的表达情况
3.2.3 N-cadherin在染色体上的位置图
3.2.4 肝癌与癌旁组织中N-cadherin在mRNA水平上的表达差异
3.2.5 N-cadherin对肝癌预后的影响
3.3 N-cadherin在肝癌中的相关基因富集分析
3.3.1 肝癌中N-cadherin与其他mRNA的相关性
3.3.2 N-cadherin与其他蛋白质的相关性
3.3.3 肝癌中N-cadherin相关基因KEGG富集分析
3.3.4 肝癌中N-cadherin相关基因GO富集分析
3.3.5 肝癌中N-cadherin相关基因的基因功能网络图
3.4 本章小结
第4章 N-cadherin野生型及N-糖基化位点突变体的构建
4.1 引言
4.2 肝癌中N-cadherin基因和蛋白结构域突变生物信息分析
4.3 N-cadherin N-糖基化位点预测
4.4 pCMV-Flag-N-cadherin重组体构建
4.5 N-cadherin单糖基化位点突变重组体构建
4.6 pCMV-Flag-N-cad-MA重组体构建
4.7 N-cadherin糖基化位点突变重组体的表达检测
4.8 本章小结
结论
展望
参考文献
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]肿瘤糖基化在肿瘤免疫逃避中的意义[J]. 路佩佩,刘风玲. 肿瘤学杂志. 2020(05)
[2]蛋白糖基化修饰在肿瘤多药耐药中的作用[J]. 胡一,何东,曹科,龚恋. 中国肿瘤临床. 2019(23)
[3]肿瘤异常糖链糖蛋白在乳腺癌中的表达及其临床意义[J]. 多斯波力·扎克汗,木扎帕尔·阿部都克热木,马斌林. 世界最新医学信息文摘. 2019(72)
[4]B7-H3对人肝癌细胞生物学特性的影响及临床意义[J]. 梁诗琪,张香西,庄小津,王钰禾,邹秋琴,张文敏. 福建医科大学学报. 2019(03)
[5]2018全球癌症统计报告解读[J]. 王宁,刘硕,杨雷,张希,袁延楠,李慧超,季加孚. 肿瘤综合治疗电子杂志. 2019(01)
[6]GRP78异常O-糖基化对乳腺癌细胞侵袭迁移的影响[J]. 刘洋,谢蓉,王秀敏,赵丽娜,王茜,吴琛. 河北大学学报(自然科学版). 2018(01)
[7]蛋白质糖基化修饰的研究进展[J]. 王晓龙,王秀然,卢天成. 基因组学与应用生物学. 2017(10)
[8]糖基化在肿瘤免疫中的作用[J]. 王立萍,陈茜茜,袁庆民,汪淑晶. 中国免疫学杂志. 2017(02)
[9]神经钙黏蛋白调控Akt/PKB信号通路对神经干细胞增殖的影响[J]. 颜建辉,黄丽娟,杨柳,陈雁斌,华力明. 中国老年学杂志. 2016(08)
[10]E-cadherin在肿瘤治疗中的研究进展[J]. 常琳琳,朱虹,郑琳,曹戟,罗沛华,何俏军. 药学进展. 2015(10)
博士论文
[1]N-cadherin在肝癌侵袭转移中的作用及其机制研究[D]. 占大钱.华中科技大学 2011
硕士论文
[1]GnT-Ⅳa通过Vimentin影响肝癌细胞迁移和侵袭的机制初探[D]. 王丰有.哈尔滨工业大学 2019
[2]肺癌患者肿瘤异常糖链蛋白的表达及其意义探讨[D]. 黄婷婷.安徽医科大学 2018
[3]N-cadherin和β-catenin异常表达对细胞粘附、增殖及经典Wnt信号通路的影响[D]. 朱少义.新乡医学院 2018
[4]N-cadherin对人牙髓干细胞增殖、迁移及成牙本质向分化的作用研究[D]. 邓子龙.南方医科大学 2016
本文编号：3154534
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