胃癌环状RNA0084893的鉴定及生物功能学研究

发布时间：2021-05-27 10:39

　　研究背景:胃癌是世界第三大致死相关性肿瘤,在中国影响着每年超过400,000的人口,约80%的病人在癌症晚期才被确诊,而晚期胃癌患者的5年生存率不超过20%;相比之下,早期胃癌患者术后5年生存率高达90%-95%。将抗癌重点从治疗晚期胃癌转变为加强胃癌的早期诊断治疗,找到稳定有效的早期胃癌筛查办法至关重要。作为非编码家族中的一员,环状RNA（circular RNA,circRNA）广泛存在于组织及真核细胞中,因其缺乏游离的5’和3’端且反向剪切形成共价闭合环状结构,具有稳定性高、半衰期长等特点。随着高通量测序技术及生物信息学的发展,人们发现circRNA不但大量存在于肿瘤组织中,也在肿瘤的发生发展阶段以特定的方式表达。研究表明,环状RNA可以调控肿瘤细胞的基因表达,改变其生物学特性,有望成为新的肿瘤标志物及治疗靶点。虽然目前已知功能的circRNA有数千种,但仍有许多circRNA在胃癌中的作用尚待发掘。研究目的:本实验进一步研究了胃癌中具有早期诊断价值的circRNA,并进行体外生物信息学实验探究其对胃癌细胞增殖、迁移、侵袭、凋亡及细胞周期的影响,通过高通量测序技术预测了该circ... 

【文章来源】：浙江大学浙江省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：70 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
致谢
中文摘要
英文摘要
中英文缩略词表
序言
1 研究内容和技术路线
    1.1 研究内容
        1.1.1 目的基因的筛选
        1.1.2 circ RNA0084893 在胃癌组织和癌旁组织中的表达水平
        1.1.3 结合胃癌患者临床病理数据分析circ RNA0084893 的临床诊断价值
        1.1.4 circ RNA0084893 在胃癌细胞和正常胃粘膜上皮细胞中的表达
        1.1.5 沉默circ RNA0084893 后胃癌细胞的增殖、迁移、侵袭、细胞周期及凋亡变化
        1.1.6 RNA测序预测circ RNA0084893 可能的作用机制
    1.2 技术路线
2 实验材料与实验方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 主要仪器设备(表2.1)
        2.1.2 主要试剂耗材(表2.2)
        2.1.3 实验生物材料(表2.3)
    2.2 实验方法
        2.2.1 目的circ RNA的筛选
        2.2.2 标本资料与采集
        2.2.3 细胞培养
        2.2.4 总RNA提取
        2.2.5 PCR引物设计及合成
        2.2.6 逆转录
        2.2.7 实时荧光定量PCR
        2.2.8 siRNA的构建
        2.2.9 细胞转染
        2.2.10 克隆形成实验
        2.2.11 CCK-8细胞增殖实验
        2.2.12 流式细胞术
        2.2.13 细胞划痕实验
        2.2.14 Transwell实验
3 实验结果
    3.1 组织病理结果
        3.1.1 目标circ RNA的成功筛选
        3.1.2 circ RNA0084893 在胃癌组织中低表达
        3.1.3 circ RNA0084893 与患者临床组织病理的关系
    3.2 细胞学实验结果
        3.2.1 circ RNA0084893 在胃癌细胞中低表达
        3.2.2 转染si RNA后 circ RNA0084893 在胃癌细胞株中下调表达
        3.2.3 沉默circ RNA0084893 后促进胃癌细胞增殖
        3.2.4 沉默circ RNA0084893 后影响细胞周期与细胞凋亡
        3.2.5 沉默circ RNA0084893 后促进胃癌细胞迁移及侵袭
    3.3 RNA测序结果
        3.3.1 RNA结构变异分析
        3.3.2 RNA表达差异分析
4 讨论
全文结论
参考文献
综述 竞争性内源RNA与消化系统恶性肿瘤的研究进展
    参考文献
作者简历及学期间所取得的科研成果


【参考文献】：
期刊论文
[1]Long non-coding RNAs involved in metastasis of gastric cancer[J]. Meng-Ting Lin,Hao-Jun Song,Xiao-Yun Ding.  World Journal of Gastroenterology. 2018(33)
[2]Circular RNA hsacirc0000745 may serve as a diagnostic marker for gastric cancer[J]. Mei Huang,Yi-Ren He,Li-Chuan Liang,Qiang Huang,Zhi-Qiang Zhu.  World Journal of Gastroenterology. 2017(34)
[3]中国早期胃癌筛查及内镜诊治共识意见（2014年4月·长沙）[J]. 廖专,孙涛,吴浩,杨帆,邹文斌.  胃肠病学. 2014(07)
[4]microRNAs and ceRNAs: RNA networks in pathogenesis of cancer[J]. Xiangqian Su,Jiadi Xing,Zaozao Wang,Lei Chen,Ming Cui,Beihai Jiang.  Chinese Journal of Cancer Research. 2013(02)



本文编号：3207417