RPS6在胆管癌中的作用及机制研究
发布时间：2021-06-10 01:56
背景与目的:胆管癌是起源于胆管上皮细胞的恶性肿瘤,其特征是早期诊断困难并且预后不良。本论文前期基于iTRAQ蛋白质组学技术和HCS增殖筛选实验发现RPS6在胆管癌组织中高表达,并且沉默RPS6能够显著抑制胆管细胞的增殖,有研究发现RPS6在多种肿瘤中异常高表达。鉴于RPS6在胆管癌发生发展中体现出潜在的调节作用,进一步研究其生物学功能及与胆管癌的关系,将为胆管癌患者的预后评估和分子靶向治疗提供理论依据。本研究旨在分析RPS6在胆管癌患者组织中表达情况与患者预后的关系,探讨RPS6调控胆管癌细胞增殖的分子生物学机制。方法:利用iTRAQ蛋白质组学鉴定胆管癌患者癌组织与癌旁组织的蛋白谱变化,挑选20个差异蛋白并通过高内涵增殖实验筛选显著抑制胆管癌细胞增殖的基因RPS6。利用免疫组织化学法对组织芯片中包含的91例胆管癌患者及31例癌旁组织进行染色,分析RPS6及其磷酸化形式p-RPS6在胆管癌中的表达情况并进行生存分析。构建慢病毒干扰质粒,通过qRT-PCR及Western Blotting验证敲低效果,CCK-8细胞增殖实验验证敲低RPS6对胆管癌细胞生长的抑制效果,最后利用转录组学高通量...
【文章来源】：兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：58 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
-1GV248慢病毒载体结构示意图
兰州大学硕士学位论文RPS6在胆管癌中的作用及机制研究24第三章实验结果与结论3.1胆管癌组织差异蛋白分析本实验应用基于iTRAQ的蛋白质组学分析的研究策略构建胆管癌组织差异蛋白谱，在胆管癌患者癌与癌旁组织中共检测到2381个可信蛋白，其中差异蛋白共786个，差异蛋白的表达模式聚类热图分析如图3-1-1所示。图3-1-1基于R语言进行表达模式聚类热图分析差异蛋白进行聚类热图分析显示，图中最下侧为差异蛋白名称，其中红色为上调差异蛋白，绿色为下调差异蛋白，差异倍数越高，颜色越深。每行表示不同蛋白在每个组中的表达量情况，每列表示相同蛋白在不同组中的表达量情况。T：肿瘤组织，N：癌旁组织。然后对差异蛋白进行韦恩分析（图3-1-2），在786个差异蛋白中，2组以上共有的差异蛋白为339个，3组共同的差异蛋白为96个。在96个差异蛋白中，通过KEGG分析和文献追踪，挑选可能影响癌症发生发展的20个差异蛋白，差异蛋白基本信息及利用iTRAQ检测到的信息如下表3-1-1所示。图3-1-2胆管癌癌与癌旁组织差异蛋白韦恩图T1：N1T2：N2T3：N3
兰州大学硕士学位论文RPS6在胆管癌中的作用及机制研究24第三章实验结果与结论3.1胆管癌组织差异蛋白分析本实验应用基于iTRAQ的蛋白质组学分析的研究策略构建胆管癌组织差异蛋白谱，在胆管癌患者癌与癌旁组织中共检测到2381个可信蛋白，其中差异蛋白共786个，差异蛋白的表达模式聚类热图分析如图3-1-1所示。图3-1-1基于R语言进行表达模式聚类热图分析差异蛋白进行聚类热图分析显示，图中最下侧为差异蛋白名称，其中红色为上调差异蛋白，绿色为下调差异蛋白，差异倍数越高，颜色越深。每行表示不同蛋白在每个组中的表达量情况，每列表示相同蛋白在不同组中的表达量情况。T：肿瘤组织，N：癌旁组织。然后对差异蛋白进行韦恩分析（图3-1-2），在786个差异蛋白中，2组以上共有的差异蛋白为339个，3组共同的差异蛋白为96个。在96个差异蛋白中，通过KEGG分析和文献追踪，挑选可能影响癌症发生发展的20个差异蛋白，差异蛋白基本信息及利用iTRAQ检测到的信息如下表3-1-1所示。图3-1-2胆管癌癌与癌旁组织差异蛋白韦恩图T1：N1T2：N2T3：N3
本文编号：3221779
【文章来源】：兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：58 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
-1GV248慢病毒载体结构示意图
兰州大学硕士学位论文RPS6在胆管癌中的作用及机制研究24第三章实验结果与结论3.1胆管癌组织差异蛋白分析本实验应用基于iTRAQ的蛋白质组学分析的研究策略构建胆管癌组织差异蛋白谱，在胆管癌患者癌与癌旁组织中共检测到2381个可信蛋白，其中差异蛋白共786个，差异蛋白的表达模式聚类热图分析如图3-1-1所示。图3-1-1基于R语言进行表达模式聚类热图分析差异蛋白进行聚类热图分析显示，图中最下侧为差异蛋白名称，其中红色为上调差异蛋白，绿色为下调差异蛋白，差异倍数越高，颜色越深。每行表示不同蛋白在每个组中的表达量情况，每列表示相同蛋白在不同组中的表达量情况。T：肿瘤组织，N：癌旁组织。然后对差异蛋白进行韦恩分析（图3-1-2），在786个差异蛋白中，2组以上共有的差异蛋白为339个，3组共同的差异蛋白为96个。在96个差异蛋白中，通过KEGG分析和文献追踪，挑选可能影响癌症发生发展的20个差异蛋白，差异蛋白基本信息及利用iTRAQ检测到的信息如下表3-1-1所示。图3-1-2胆管癌癌与癌旁组织差异蛋白韦恩图T1：N1T2：N2T3：N3
兰州大学硕士学位论文RPS6在胆管癌中的作用及机制研究24第三章实验结果与结论3.1胆管癌组织差异蛋白分析本实验应用基于iTRAQ的蛋白质组学分析的研究策略构建胆管癌组织差异蛋白谱，在胆管癌患者癌与癌旁组织中共检测到2381个可信蛋白，其中差异蛋白共786个，差异蛋白的表达模式聚类热图分析如图3-1-1所示。图3-1-1基于R语言进行表达模式聚类热图分析差异蛋白进行聚类热图分析显示，图中最下侧为差异蛋白名称，其中红色为上调差异蛋白，绿色为下调差异蛋白，差异倍数越高，颜色越深。每行表示不同蛋白在每个组中的表达量情况，每列表示相同蛋白在不同组中的表达量情况。T：肿瘤组织，N：癌旁组织。然后对差异蛋白进行韦恩分析（图3-1-2），在786个差异蛋白中，2组以上共有的差异蛋白为339个，3组共同的差异蛋白为96个。在96个差异蛋白中，通过KEGG分析和文献追踪，挑选可能影响癌症发生发展的20个差异蛋白，差异蛋白基本信息及利用iTRAQ检测到的信息如下表3-1-1所示。图3-1-2胆管癌癌与癌旁组织差异蛋白韦恩图T1：N1T2：N2T3：N3
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