黑色素瘤浸润性免疫细胞的调控网络研究

发布时间：2021-06-22 04:47

　　黑色素瘤是严重危害人类健康的疾病之一,其发病率和致死率分别占皮肤癌的4%和80%。PD1和CTLA4的阻断疗法在人晚期黑色素瘤患者中疗效明显,但仍有约50%的患者对该类药物不敏感。因此,深度挖掘潜在的免疫治疗靶点,对开发针对性药物、提高癌症治愈率具有重要意义。机体的免疫功能与肿瘤的发生发展密切相关,免疫系统对肿瘤细胞有免疫监视和清除作用,而肿瘤细胞也会影响免疫系统的免疫应答。近年来基因调控分析用于干细胞和疾病治疗方面。通过调控网络比较分析,可筛选特定细胞的关键基因、转录因子、细胞表面受体和小RNA分子。为研究肿瘤微环境中主要免疫细胞的调控特性、CD8⁺T细胞功能异常及功能恢复的动态调节机制,本文对9种正常免疫细胞、PD1抗体处理前后的功能异常CD8⁺T细胞和黑色素瘤细胞,分别构建基因调控网络、转录因子调控网络和细胞表面受体调控网络,并对差异变化的分子进行相关实验验证。结果如下:1.为研究主要免疫细胞的调控特性,利用人类转录因子数据库和调控网络构建方法,对9种人正常免疫细胞（B细胞、CD4⁺T细胞、CD8⁺

【文章来源】：内蒙古大学内蒙古自治区 211工程院校

【文章页数】：120 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

调控网络，引自Gu,ZuguangBmcSystemsBiology2011[53]

韩鹏勇 黑色素瘤浸润性免疫细胞的调控网络研究胞核中，染色体分为开放和沉默区域，染色体的开放区域代表转录因子可，如启动子、增强子、位点控制区域和绝缘子等[56]，在染色体开放区域，转DNA序列结合控制基因表达[57, 58]。测定染色体开放区域的技术有ATAC-seq和异的酶对染色体开放区域进行切割，结合测序技术研究染色体开放区域（图 操作步骤简单，需求的细胞少，可重现 DNase-seq 技术的结果[59]。在 ATACNI-ATAC 可去除线粒体污染。2015 年 Darren A. Cusanovich采用多细胞标记6 孔板通过转座酶携带的两种长链引物标记，借助流式分选 15～25 个细胞到组合标记大约 1 万个单细胞[60]。HowardYChang 在 2015年通过Fludigm公司结合微流控技术每孔固定单个细胞，借助自动化进行单个细胞的裂解、转座立了单细胞 ATAC-seq分析平台[61]。建立染色体开放区域后，基于转录因子与特异性，可构建基因调控网络[62][64]。

28图 2.3代表9种免疫细胞类型中特异和共有的转录因子。Figure 2.3 Unique and overlapping transcription factors between 9 immune cells.

【参考文献】：
期刊论文
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[2]c-Myb和PCNA在甲状腺乳头状癌患者中的表达及与颈部淋巴结转移的关系[J]. 张寅,刘军,苏磊,桑剑锋,姚永忠.  癌症进展. 2018(04)
[3]43例肢端型黑色素瘤MITF基因扩增分析及其临床意义[J]. 马家芳,孔燕,郭军.  中华肿瘤防治杂志. 2016(09)
[4]生物网络模体发现算法研究综述[J]. 覃桂敏,高琳,呼加璐.  电子学报. 2009(10)
[5]SW-480裸鼠移植瘤模型的建立及其生物学特性[J]. 张胜本,黄显凯,饶本强.  第三军医大学学报. 2000(02)



本文编号：3242150