血管肉瘤相关miRNAs的生物信息学预测及分析
发布时间：2021-07-01 16:56
目的探讨血管肉瘤相关miRNAs及其靶基因在其恶性生物学行为中的作用。方法从GEO数据库中下载血管肉瘤miRNAs表达谱芯片数据,应用GEO2R筛选出差异表达的miRNAs并进行靶基因预测,对靶基因进行GO及KEGG生物功能富集分析及蛋白互作分析。结果筛选出53个差异表达的miRNAs （P<0.05,|log fold-change|≥4）,其中上调者51个,下调者2个;GO功能富集分析发现差异表达miRNAs的靶基因主要参与细胞通讯、信号转导等生物学过程;KEGG信号通路富集分析发现靶基因主要参与肿瘤信号通路、代谢通路、环腺苷酸（cAMP）信号通路、丝裂原活化蛋白激酶（MAPK）信号通路、PI3K/AKT信号通路、Ras信号通路等重要通路;String蛋白互作分析发现,STAT3、TP53、MAPK1、SRC等在蛋白互作网络中处于核心地位。结论异常表达的miRNAs在血管肉瘤的恶性生物学行为中发挥着关键作用,为进一步探讨血管肉瘤发生、发展的具体分子机制、分子标志物的筛选及靶向药物的开发奠定基础。
【文章来源】：临床与实验病理学杂志. 2020,36(04)北大核心CSCD
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
A.差异表达miRNAs的聚类图;B.差异表达miRNAs的火山图;红色代表上调的miRNAs,绿色代表下调的miRNAs,黑色代表miRNAs变化不显著,色键从绿色至红色变化提示miRNAs表达增强
通路富集分析发现,差异表达miRNAs的靶基因显著富集于肿瘤信号通路、代谢通路、环腺苷酸(cAMP)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、PI3K/AKT信号通路、Ras信号通路等210条通路,富集最显著的10条通路见图3。图3 差异表达miRNAs靶基因KEGG信号通路富集分析
差异表达miRNAs靶基因KEGG信号通路富集分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]原发性胸膜上皮样血管肉瘤2例临床病理分析[J]. 张娜,王志敢,罗海军,刘爱凤. 临床与实验病理学杂志. 2019(06)
[2]胃原发性血管肉瘤1例[J]. 胡营营,马亚琪,宋欣,刘爱军. 临床与实验病理学杂志. 2018(09)
[3]miR-137 inhibits melanoma cell proliferation through downregulation of GLO1[J]. Na Lv,Shuai Hao,Chonglin Luo,Alia Abukiwan,Ying Hao,Fei Gai,Weiwei Huang,Lingyun Huang,Xueyuan Xiao,Stefan B.Eichmüller,Dacheng He. Science China（Life Sciences）. 2018(05)
本文编号：3259519
【文章来源】：临床与实验病理学杂志. 2020,36(04)北大核心CSCD
【文章页数】：5 页
【部分图文】：
A.差异表达miRNAs的聚类图;B.差异表达miRNAs的火山图;红色代表上调的miRNAs,绿色代表下调的miRNAs,黑色代表miRNAs变化不显著,色键从绿色至红色变化提示miRNAs表达增强
通路富集分析发现,差异表达miRNAs的靶基因显著富集于肿瘤信号通路、代谢通路、环腺苷酸(cAMP)信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、PI3K/AKT信号通路、Ras信号通路等210条通路,富集最显著的10条通路见图3。图3 差异表达miRNAs靶基因KEGG信号通路富集分析
差异表达miRNAs靶基因KEGG信号通路富集分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]原发性胸膜上皮样血管肉瘤2例临床病理分析[J]. 张娜,王志敢,罗海军,刘爱凤. 临床与实验病理学杂志. 2019(06)
[2]胃原发性血管肉瘤1例[J]. 胡营营,马亚琪,宋欣,刘爱军. 临床与实验病理学杂志. 2018(09)
[3]miR-137 inhibits melanoma cell proliferation through downregulation of GLO1[J]. Na Lv,Shuai Hao,Chonglin Luo,Alia Abukiwan,Ying Hao,Fei Gai,Weiwei Huang,Lingyun Huang,Xueyuan Xiao,Stefan B.Eichmüller,Dacheng He. Science China（Life Sciences）. 2018(05)
本文编号：3259519
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