PKMYT1对肺腺癌放射敏感性的影响
发布时间：2021-07-21 07:46
目的:肺腺癌是最常见的肺癌类型之一,近几十年来其发生率显著增长。放射疗法是肺腺癌的有效治疗方法,但是,肺腺癌对放射治疗表现出不同程度的放射抵抗性,是影响放射治疗效果从而导致治疗失败的主要因素。因此,探讨提高肺腺癌放射敏感性方法和手段对肺腺癌的临床放射治疗有重要的意义。本研究采用生物信息学方法分析GEO肺腺癌芯片,从肺腺癌芯片中寻找与肺腺癌不良预后相关基因,然后从中选出可能作为调控肺腺癌放射敏感性靶点的基因进行深入实验。研究方法:1、GEO数据库中选取了三个肺腺癌的基因表达谱（GSE32863,GSE33532和GSE43458）。使用GEO2R在线工具来筛选各基因表达谱中与癌旁正常肺组织相比在肺腺癌组织中表达上调的基因,然后使用Venn在线软件筛选三个数据集中共同表达上调的基因。在DAVID在线网站中对这些基因进行基因本体论（Gene Ontology,GO）和京都基因与基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of Gene and Genome,KEGG）分析。使用STRING在线网站来获取基因之间的蛋白质相互作用网络（protein-protein interacti...
【文章来源】：中国医科大学辽宁省
【文章页数】：97 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
从GSE33532、GSE43458和GSE32863芯片中获得324个共同上调基因
中国医科大学硕士学位论文5细胞质。KEGG分析结果显示上调的基因主要富集在细胞周期，氨基酸的生物合成，果糖和甘露糖代谢，ECM-受体相互作用，碳代谢，抗生素的生物合成，卵母细胞减数分裂，孕酮介导的卵母细胞成熟，p53信号通路和代谢途径（图2，表1和表2）。图2324个上调基因进行GO和KEGG分析
中国医科大学硕士学位论文9图3A:蛋白质相互作用网络的构建。B:重要模块的识别3.4核心基因的生存分析使用KaplanMeier-plotter在线网站来分析72个核心基因与肺腺癌患者总生存期（OS）的关系。结果显示着72个基因中，有58个基因与肺腺癌患者的OS有显著相关性，基因高表达肺腺癌患者的OS明显低于低表达患者，差异有显著性（P<0.05，表3和图4）。表3使用KaplanMeier-plotter分析72个基因与肺腺癌预后的相关关系CategoryGenesGeneswithsignificantlyworsesurvival(P<0.05)MAD2L1PKMYT1KIF2CTTKCCNA2BUB1KIF20ACKAP2LBIRC5CCNB2EXO1CDCA3CDKN3CDC20OIP5HJURPKIF14MCM2MCM10PRC1MELKKIF15NCAPGPTTG1TK1KIF4AUBE2CFOXM1AURKAKIFC1CEP55CDC25CTYMSASF1BKIAA0101EZH2CENPFDLGAP5CHEK1CDCA5ZWINTANLNPOLQCDC45GINS2TIMELESSSHCBP1RFC4NEK2AURKBUBE2TCCNB1TPX2MCM4TOP2APBKASPMCDCA8Geneswithoutsignificantlyworsesurvival(P>0.05)KNTC1HMMRRAD51POLE2ECT2RAD51AP1STILATAD2PLK4CDK1KIF11MCM6CDCA7CKS1B
【参考文献】：
期刊论文
[1]Genetic Variants in CHEK1 Gene Are Associated with the Prognosis of Thoracic Esophageal Squamous Cell Carcinoma Patients Treated with Radical Resection[J]. 李婧,唐洋,黄柳,于倩倩,胡广原,陈超,张鹏,袁响林. Journal of Huazhong University of Science and Technology（Medical Sciences）. 2016(06)
本文编号：3294620
【文章来源】：中国医科大学辽宁省
【文章页数】：97 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
从GSE33532、GSE43458和GSE32863芯片中获得324个共同上调基因
中国医科大学硕士学位论文5细胞质。KEGG分析结果显示上调的基因主要富集在细胞周期，氨基酸的生物合成，果糖和甘露糖代谢，ECM-受体相互作用，碳代谢，抗生素的生物合成，卵母细胞减数分裂，孕酮介导的卵母细胞成熟，p53信号通路和代谢途径（图2，表1和表2）。图2324个上调基因进行GO和KEGG分析
中国医科大学硕士学位论文9图3A:蛋白质相互作用网络的构建。B:重要模块的识别3.4核心基因的生存分析使用KaplanMeier-plotter在线网站来分析72个核心基因与肺腺癌患者总生存期（OS）的关系。结果显示着72个基因中，有58个基因与肺腺癌患者的OS有显著相关性，基因高表达肺腺癌患者的OS明显低于低表达患者，差异有显著性（P<0.05，表3和图4）。表3使用KaplanMeier-plotter分析72个基因与肺腺癌预后的相关关系CategoryGenesGeneswithsignificantlyworsesurvival(P<0.05)MAD2L1PKMYT1KIF2CTTKCCNA2BUB1KIF20ACKAP2LBIRC5CCNB2EXO1CDCA3CDKN3CDC20OIP5HJURPKIF14MCM2MCM10PRC1MELKKIF15NCAPGPTTG1TK1KIF4AUBE2CFOXM1AURKAKIFC1CEP55CDC25CTYMSASF1BKIAA0101EZH2CENPFDLGAP5CHEK1CDCA5ZWINTANLNPOLQCDC45GINS2TIMELESSSHCBP1RFC4NEK2AURKBUBE2TCCNB1TPX2MCM4TOP2APBKASPMCDCA8Geneswithoutsignificantlyworsesurvival(P>0.05)KNTC1HMMRRAD51POLE2ECT2RAD51AP1STILATAD2PLK4CDK1KIF11MCM6CDCA7CKS1B
【参考文献】：
期刊论文
[1]Genetic Variants in CHEK1 Gene Are Associated with the Prognosis of Thoracic Esophageal Squamous Cell Carcinoma Patients Treated with Radical Resection[J]. 李婧,唐洋,黄柳,于倩倩,胡广原,陈超,张鹏,袁响林. Journal of Huazhong University of Science and Technology（Medical Sciences）. 2016(06)
本文编号：3294620
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