基于大数据库的蛋白4.1R表达分析和75例肺腺癌组织芯片确认其与生存期的关系
发布时间:2021-07-22 07:18
背景蛋白4.1具有肿瘤抑制活性,通过FERM结构域对肿瘤的生长调控进行牢牢把控,但是蛋白4.1R与肿瘤发生的关系尚不清楚,与肺肿瘤特别是肺腺癌的发生和发展是否有关,仍有待解决。目的探讨蛋白4.1R表达水平与肺腺癌预后和病理特征的关系及其分子机制。方法利用Oncomine和HPA二种大数据库对蛋白4.1R在肺腺癌中的表达进行全面的分析;并利用商业化的组织芯片检测技术对75例肺腺癌石蜡组织切片进行蛋白4.1R的表达再确认,分析的主要指标是蛋白表达相关因素、生存期相关因素分析。最后运用蛋白4.1R基因过表达和沉默技术探讨蛋白4.1R基因表达的意义和分子机制。结果Oncomine网站目前有715个数据集,86733个样品。在13种数据集中有31个肺癌的统计分析涉及蛋白4.1R,只有1次分析中的蛋白4.1R有所改变,与正常组织相比,在肺癌中蛋白4.1R总体表达量是下调。但是各个数据集的蛋白4.1R表达结果并不完全一致。关于在肺腺癌中蛋白4.1R表达尚无定论,而以下调为主。其中支持蛋白4.1R表达下调的数据有二个。Bhattacharjee的结果显示:共有203例患者,小细胞肺癌下调最为明显,比正...
【文章来源】:郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】:114 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
例肺腺癌患者的临床分期和生存率的关系
第一部分 肺腺癌组织芯片数据分析comine 数据库分析结果 Oncomine 网页(www.oncomine.com),该网站目前有 715 个样品。输入查询的蛋白名称蛋白 4.1R,获得了 688 个数据集料(截至 2017 年 1 月 4 日)含有蛋白 4.1R 的资料。选择肺癌 个肺癌数据集,6129 个样品;搜索肺腺癌数据,则有 56 个数据合条件。在 13 种数据集中有 31 个肺癌的统计分析涉及蛋白析中的蛋白 4.1R 有所改变,与正常组织相比,在肺癌中蛋白 下调。但是各个数据集的蛋白 4.1R 表达结果并不完全一致。
图 3. 肺腺癌中蛋白 4.1R 的表达水平上调(Oncomine)与正常肺组织相比, 肺腺癌蛋白 4.1R 的表达水平分别是: Okayama: 1.459 倍,p 值.27E-9 (A)。Hou: 1.120 倍,p 值为 2.547E-6, (B)。 Selamat: 1.091 倍,p 值为 1.28E-11, (u: 1.211 倍,p 值为 0.043,(D)。以上肺腺癌中蛋白 4.1R 的表达水平均比正常肺组织有所上调,差异均有显著性。.3 不支持蛋白 4.1R 表达上调或下调的数据(图 4)肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表达水平改变的数据来自另一个较大的患者kayama 的研究结果。与 20 例正常肺相比,226 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表平达到 1.508 倍,p 值为 0.990, 无显著性差异(A)。同样不支持肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表达水平下调的还有 Hou 的数据:45腺癌患者的蛋白 4.1R 表达水平是正常肺-1.078 倍,p 值为 0.077, 无显著性(B)。Garber:与 6 例正常肺相比,40 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表达水平达.138 倍,p 值为 0.170, 位列全部表达基因排名的 5199 名,无显著性差异(C
【参考文献】:
期刊论文
[1]细胞骨架4.1蛋白在非小细胞肺癌中的表达及意义[J]. 郑祥艳,祁元明,高艳锋,王宪远,祁敏现,时晓芳,安秀丽. 癌症. 2009(07)
本文编号:3296708
【文章来源】:郑州大学河南省 211工程院校
【文章页数】:114 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
例肺腺癌患者的临床分期和生存率的关系
第一部分 肺腺癌组织芯片数据分析comine 数据库分析结果 Oncomine 网页(www.oncomine.com),该网站目前有 715 个样品。输入查询的蛋白名称蛋白 4.1R,获得了 688 个数据集料(截至 2017 年 1 月 4 日)含有蛋白 4.1R 的资料。选择肺癌 个肺癌数据集,6129 个样品;搜索肺腺癌数据,则有 56 个数据合条件。在 13 种数据集中有 31 个肺癌的统计分析涉及蛋白析中的蛋白 4.1R 有所改变,与正常组织相比,在肺癌中蛋白 下调。但是各个数据集的蛋白 4.1R 表达结果并不完全一致。
图 3. 肺腺癌中蛋白 4.1R 的表达水平上调(Oncomine)与正常肺组织相比, 肺腺癌蛋白 4.1R 的表达水平分别是: Okayama: 1.459 倍,p 值.27E-9 (A)。Hou: 1.120 倍,p 值为 2.547E-6, (B)。 Selamat: 1.091 倍,p 值为 1.28E-11, (u: 1.211 倍,p 值为 0.043,(D)。以上肺腺癌中蛋白 4.1R 的表达水平均比正常肺组织有所上调,差异均有显著性。.3 不支持蛋白 4.1R 表达上调或下调的数据(图 4)肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表达水平改变的数据来自另一个较大的患者kayama 的研究结果。与 20 例正常肺相比,226 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表平达到 1.508 倍,p 值为 0.990, 无显著性差异(A)。同样不支持肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表达水平下调的还有 Hou 的数据:45腺癌患者的蛋白 4.1R 表达水平是正常肺-1.078 倍,p 值为 0.077, 无显著性(B)。Garber:与 6 例正常肺相比,40 例肺腺癌患者的蛋白 4.1R 表达水平达.138 倍,p 值为 0.170, 位列全部表达基因排名的 5199 名,无显著性差异(C
【参考文献】:
期刊论文
[1]细胞骨架4.1蛋白在非小细胞肺癌中的表达及意义[J]. 郑祥艳,祁元明,高艳锋,王宪远,祁敏现,时晓芳,安秀丽. 癌症. 2009(07)
本文编号:3296708
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