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牙龈癌与牙周炎患者口腔菌群结构的比较和分析:共性与差异

发布时间:2021-10-10 01:25
  目的:流行病学调查研究显示,牙周炎可能是口腔鳞状细胞癌的独立危险因素。随着微生物在癌症过程中重要作用的发现,以及牙周炎与牙龈癌发病位置的相关性,本研究试图探索牙周炎与牙龈鳞状细胞癌(gingival squamous cell carcinoma,GSCC)患者口腔菌群的结构与功能,比较二者菌群结构的共性与差异,从而探索二者之间的联系。材料和方法:根据纳入、排除标准,本研究选取2017-2019年于中国医科大学附属口腔医院就诊的GSCC受试者10例、匹配的牙周炎受试者15例和健康受试者15例。经过伦理委员会批准及受试者签署知情同意之后,记录受试者人口自然统计学信息及牙周临床参数,按照人类微生物组计划(human microbiome project,HMP)的取样流程收集3组受试者的唾液、龈下菌斑,另外收集GSCC受试者舌背棉拭子、颊黏膜棉拭子、癌组织和癌旁组织样本。提取DNA后利用16S rDNA扩增子测序和功能预测对菌群结构与功能进行分类分析,数据质控以后进行操作分类单元(operational taxonomy unites,OTU)聚类、菌群结构分析、多样性分析、组间比较分析、... 

【文章来源】:中国医科大学辽宁省

【文章页数】:65 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

牙龈癌与牙周炎患者口腔菌群结构的比较和分析:共性与差异


GSCC受试者口腔内不同位点群落结构情况

菌斑,唾液,牙周炎,菌群


中国医科大学硕士学位论文18(Porphyromonas)(见图3.4A、B)。牙周炎受试者唾液、龈下菌斑的细菌构成不同。根据LEfSe结果,密螺旋体属、噬二氧化碳纤维菌属、棒状杆菌属在龈下菌斑中的相对丰度明显高于唾液,而嗜血杆菌属、奈瑟菌属、韦荣菌属在唾液中相对丰度明显高于龈下菌斑(见图3.4C)。图3.4.牙周炎受试者口腔内唾液与龈下菌斑菌群结构与比较分析A.门水平细菌分布,横坐标为样本,纵坐标为相对丰度;B.属水平细菌分布,横坐标为样本,纵坐标为相对丰度;C.对照组唾液与龈下菌斑比较LDA分析PSub:牙周炎组龈下菌斑;PS:牙周炎组唾液3.5对照组受试者口腔内不同位点的菌群结构Alpha多样性结果显示,牙周健康对照组受试者的唾液与龈下菌斑相比,细菌相对丰度与多样性均较高(见表2)。PCoA显示唾液与龈下菌斑菌群结构

菌斑,唾液,口腔,菌群


中国医科大学硕士学位论文19图3.5.对照组受试者口腔内唾液与龈下菌斑菌群结构与比较分析A.门水平细菌分布,横坐标为样本,纵坐标为相对丰度;B.属水平细菌分布,横坐标为样本,纵坐标为相对丰度;C.对照组唾液与龈下菌斑比较LDA分析HSub:牙周炎组龈下菌斑;HS:牙周炎组唾液不相似。从门水平分析,对照组受试者口腔内相对丰度最高的3种细菌为变形菌门(35.88%)、放线菌门(23.72%)、厚壁菌门(16.91%);从属水平分析,牙周炎受试者口腔内相对丰度最高的3种细菌为奈瑟菌属、棒状杆菌属、放线菌属。唾液中相对丰度最高的3种细菌为奈瑟菌属、嗜血杆菌属、韦荣菌属;龈下菌斑中相对丰度最高的3种细菌为棒状杆菌属、放线菌属、奈瑟菌属(见图3.5A、B)。牙周健康受试者唾液、龈下菌斑的细菌构成不同。根据LEfSe结果,螺旋体属、密螺旋体属、棒状杆菌属在龈下菌斑中的相对丰度明显高于唾液,而奈瑟菌属、嗜血杆菌属、韦荣菌属在唾液中相对丰度明显高于龈下菌斑(见图3.5C)。


本文编号:3427375

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