基于TCGA数据库探究甲状腺癌中Fibronectin 1表达及临床意义分析

发布时间：2021-10-10 02:25

　　目的:甲状腺癌是美国女性最常见的癌症,2015年男性和女性的新增病例估计超过62万例。全球范围内的发病率继续上升。分化型甲状腺癌是甲状腺癌最常见的病理类型,绝大多数患者经手术、放射性碘治疗及TSH抑制治疗能获得良好预后。但仍有部分患者肿瘤复发甚至死亡。本研究着重研究Fibronectin 1（FN 1）在甲状腺癌的表达情况,探讨FN 1与甲状腺癌临床病理特征的关系,以及其在甲状腺癌发生、进展中的可能机制,希望为靶向治疗研发提供靶点。方法:从癌症基因组图谱（The Cancer Genome Atlas,TCGA）数据库下载甲状腺癌中FN 1的RNA SEqV2资料和临床信息,分别采用SPSS进行数据统计比较甲状腺癌组织和非肿瘤甲状腺组织FN 1的表达,利用linkedomics在线分析系统总结Fibronectin 1与临床病理参数的关系,使用Kaplan-Meier Plotter进行无复发生存期比较,通过linkedomics在线系统中的基因富集分析（GSEA）分析预测可能相关的信号通路。结果:（1）FN 1在甲状腺癌组织中的mRNA表达显著增高（16.6630±0.3786 vs... 

【文章来源】：兰州大学甘肃省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：172 页

【学位级别】：硕士

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中文摘要
Abstract
第一章 绪论
    1.1 甲状腺癌概述
    1.2 影响甲状腺癌预后的因素
        1.2.1 肿瘤组织学因素
        1.2.2 肿瘤大小
        1.2.3 淋巴结转移
        1.2.4 甲状腺癌的周围浸润
        1.2.5 远处转移
        1.2.6 癌基因
        1.2.7 年龄
        1.2.8 性别
        1.2.9 治疗相关因素
        1.2.10 肿瘤分期系统
    1.3 甲状腺癌临床表现
        1.3.1 甲状腺结节
        1.3.2 滤泡上皮细胞源性的甲状腺癌变
        1.3.3 甲状腺髓样癌
        1.3.4 甲状腺结节的超声特征与细针穿刺活检指征
        1.3.5 手术方法
    1.4 甲状腺癌的遗传学异常
        1.4.1 BRAF
        1.4.2 RET/PTC重排
        1.4.3 MAPK信号通路
        1.4.4 PI3K/AKT信号通路
        1.4.5 RAS信号通路
        1.4.6 PAX8/PPARγ重排
        1.4.7 P53基因变异
        1.4.8 Wnt信号通路
        1.4.9 NF-κB信号通路
        1.4.10 HIF-1信号通路
    1.5 甲状腺癌靶向治疗的分子途径
        1.5.1 BRAF靶向治疗
        1.5.2 RET突变和RET/PTC靶向治疗
        1.5.3 RAS的点突变靶向治疗
        1.5.4 PI3K靶向治疗
        1.5.5 PPAR靶向治疗
        1.5.6 NF-κB靶向治疗
    1.6 Fibronectin的概述
        1.6.1 自我组装和原纤维生成
        1.6.2 FN和胶原蛋白
        1.6.3 FN是临时细胞外基质
        1.6.4 FN作为细胞粘附的底物
        1.6.5 FN是生长因子的作用靶点之一
        1.6.6 利用FN结合相关伴侣分子
    1.7 Fibronectin1调节肿瘤发生
        1.7.1 肿瘤发生中FN的构象和作用机制
        1.7.2 基于FN肿瘤治疗方法的进展
第二章 基于TCGA数据库探究Fibronectin1与甲状腺癌临床病理特点的相关性分析
    2.1 实验材料工具
        2.1.1 实验材料
        2.1.2 工具与软件
    2.2 实验方法
        2.2.1 甲状腺癌FN1表达情况分析
        2.2.2 甲状腺癌中FN1与临床病理特点的相关性分析
        2.2.3 统计学方法
    2.3 实验结果
        2.3.1 甲状腺癌与非肿瘤甲状腺组织的FN1差异表达
        2.3.2 甲状腺癌组织FN1表达及临床病理相关性
    2.4 讨论
第三章 基于TCGA数据库探究Fibronectin1与甲状腺癌患者无病生存的相关性分析
    3.1 实验材料
    3.2 实验方法
    3.3 实验结果
    3.4 讨论
第四章 基于GSEA的KEGGpathway结合既往甲状腺癌的经典研究靶点进行FN1的基因富集分析
    4.1 实验材料
    4.2 实验方法
    4.3 实验结果
        4.3.1 FN1的相关通路分析和热图资料
        4.3.2 正相关通路
        4.3.3 负相关通路
        4.3.4 富集基因集的优化筛选结果
    4.4 讨论
第五章 结论
    5.1 主要结论
    5.2 研究展望
参考文献
在学期间的研究成果
致谢



本文编号：3427463