运用生物信息学的方法筛选乳腺癌相关microRNA

发布时间：2021-10-12 02:40

　　目的:应用生物信息学的分析方法和工具,筛选乳腺癌与癌旁组织差异表达的微小RNA（Micro RNA mi RNA）,对差异表达的mi RNA进行功能学、分子通路及蛋白互相作用网络等方面进一步分析,寻找与乳腺癌相关的mi RNA,为乳腺癌的临床诊治提供一定的理论指导。方法:1.从TCGA数据库（The Cancer Genome Atlas Program癌症基因组图谱计划）下载乳腺癌及癌旁组织表达mi RNA;2.运用R语言相关程序包处理下载数据,获得mi RNA数据;3.对差异表达mi RNA进行功能学分析;4.明显差异表达的mi RNA进行靶基因预测;5.应用在线分析工具Aimgo2、DAVID、STRING对得到的靶基因基因进行GO（Gene ontology基因本体数据库）、KEGG（kyoto encyclope dia of gene and ge-nomes京都基因与基因组百科全书数据库）以及蛋白-蛋白互相作用网络分析。结果:1.从TCGA数据下载的共计1096例乳腺癌组织、104例癌旁组织表达的1881项mi RNA进行分析,发现表达上调mi RNA共计157项,下调m... 

【文章来源】：河北医科大学河北省

【文章页数】：58 页

【学位级别】：硕士

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中文摘要
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英文缩写
前言
材料与方法
结果
讨论
结论
参考文献
附录一、乳腺癌组织对比癌旁组织上调miRNA
附录二、乳腺癌组织对比癌旁组织下调miRNA
附录三、miR-21-5p预测靶基因的权重分
附录四、miR-21靶基因的GO富集生物学功能
附录五、miR-328靶基因的GO富集生物学功能
综述 乳腺癌与生物信息学
    参考文献
致谢
个人简历



本文编号：3431729