miR-496靶向RASSF6影响结直肠癌上皮-间充质转化的研究
发布时间：2021-10-26 12:02
背景:结直肠癌（colorectal cancer,CRC）是一种在全世界范围内高发的恶性肿瘤,对人们的健康产生了严重的危害。与大多数实体瘤类似,CRC的分子发病机制较为复杂,其中APC、TP53等重要抑癌基因的失活是其发病的重要基础。因此深入研究并阐明抑癌基因的表达调控对正确理解、认识CRC的发病机理具有重要的意义。最近,我们利用全外显子组测序及功能实验,首次报道抑癌基因RASSF6（Ras-association domain family number 6）的表达缺失或下调参与CRC的发生、发展。Micro RNA,作为一种调控m RNA表达水平的短序列非编码RNA受到越来越多的重视。我们前期利用生物信息学方法分析确定RASSF6上游CRC新致癌miRNA（miR-496）。就我们掌握的文献,到目前为止,系统分析RASSF6上游miRNAs的靶向调控以及miR-496在CRC发生、发展中的分子作用机制还未见报道。因此,本研究的完成有助于我们进一步认知CRC发生、发展过程中RASSF6的表达调控网络,明确新致癌基因miR-496的作用机制,具有重要的理论意义。研究方法:1、利用mi...
【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
LoVo、SW480细胞生长状
西北大学硕士学位论文10女性样本，年龄范围在44岁到81岁之间，每位患者（无家族病史）均具有完整的临床病理资料。我们选取结直肠癌细胞系中的人结直肠腺癌细胞LoVo和SW480细胞系用于本章的研究，以上两个细胞系均购自广州吉尼欧生物科技有限公司，细胞无污染、状态良好，生长状态如图1所示。LoVoSW480图1LoVo、SW480细胞生长状态（图片源于ATCC）2.1.3实验仪器表1主要仪器及厂商仪器生产厂家超低温冰箱TOMOS公司CO2培养箱日本三洋公司高性能台式离心机美国Thermo公司低速离心机北京鼎国生物技术公司微量移液器德国Eppendorf公司超净工作台苏州苏洁净化公司AF-100AS制冰机常熟市雪科有限公司化学发光仪美国Thermo公司手掌式微型离心机杭州瑞诚仪器有限公司数显恒温水浴锅北京鼎国生物技术公司金属浴美国TOMOS公司CFX96实时定量荧光PCR仪美国伯乐公司酶标仪美国Thermo公司电子天平德国赛多利斯漩涡混合仪北京东林昌盛生物科技有限公司
第二章RASSF6上游miRNA的筛选及miR-496的确定23图2RASSF6上游miRNA筛选示意图表1015个miRNAs的mirSVRscore和PhastConsscore评分情况miRNAmirSVRscoremirSVR排序PhastConsscorehsa-miR-448-1.107410.6290hsa-miR-496-1.017620.5159hsa-miR-653-0.917030.6232hsa-miR-223-0.914740.5525hsa-miR-203a-0.843150.5587hsa-miR-216a-0.813460.5366hsa-miR-217-0.769370.5366hsa-miR-181c-0.763580.6223hsa-miR-876-5p-0.761690.6209hsa-miR-181a-0.7598100.6223hsa-miR-181b-0.7598110.6223hsa-miR-181d-0.7561120.6223hsa-miR-203a-0.7297130.5665hsa-miR-590-3p-0.6636140.6232hsa-miR-590-5p-0.6174150.6869hsa-miR-21-0.6100160.6869注：hsa-miR-203有两个不同的RASSF6靶向结合位点。因为所选miRNAs靶向调节RASSF6，RASSF6是一个抑癌基因，在CRC中低表达，故我们通过TCGA数据库下载筛选出来的15个miRNA及RASSF6在正常及CRC组织中的表达值及相应患者临床病理信息，进一步筛选出其中表达上调的miRNAs，结果如图3所示，与正常组织相比，有10个miRNA在CRC中表达上调。继续用GraphPad软件分
【参考文献】：
期刊论文
[1]Low RASSF6 expression in pancreatic ductal adenocarcinoma is associated with poor survival[J]. Hui-Lin Ye,Dou-Dou Li,Qing Lin,Yu Zhou,Quan-Bo Zhou,Bing Zeng,Zhi-Qiang Fu,Wen-Chao Gao,Yi-Min Liu,Rui-Wan Chen,Zhi-Hua Li,Ru-Fu Chen. World Journal of Gastroenterology. 2015(21)
[2]Current treatment for colorectal liver metastases[J]. Evangelos P Misiakos,Nikolaos P Karidis,Gregory Kouraklis. World Journal of Gastroenterology. 2011(36)
本文编号：3459466
【文章来源】：西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】：82 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
LoVo、SW480细胞生长状
西北大学硕士学位论文10女性样本，年龄范围在44岁到81岁之间，每位患者（无家族病史）均具有完整的临床病理资料。我们选取结直肠癌细胞系中的人结直肠腺癌细胞LoVo和SW480细胞系用于本章的研究，以上两个细胞系均购自广州吉尼欧生物科技有限公司，细胞无污染、状态良好，生长状态如图1所示。LoVoSW480图1LoVo、SW480细胞生长状态（图片源于ATCC）2.1.3实验仪器表1主要仪器及厂商仪器生产厂家超低温冰箱TOMOS公司CO2培养箱日本三洋公司高性能台式离心机美国Thermo公司低速离心机北京鼎国生物技术公司微量移液器德国Eppendorf公司超净工作台苏州苏洁净化公司AF-100AS制冰机常熟市雪科有限公司化学发光仪美国Thermo公司手掌式微型离心机杭州瑞诚仪器有限公司数显恒温水浴锅北京鼎国生物技术公司金属浴美国TOMOS公司CFX96实时定量荧光PCR仪美国伯乐公司酶标仪美国Thermo公司电子天平德国赛多利斯漩涡混合仪北京东林昌盛生物科技有限公司
第二章RASSF6上游miRNA的筛选及miR-496的确定23图2RASSF6上游miRNA筛选示意图表1015个miRNAs的mirSVRscore和PhastConsscore评分情况miRNAmirSVRscoremirSVR排序PhastConsscorehsa-miR-448-1.107410.6290hsa-miR-496-1.017620.5159hsa-miR-653-0.917030.6232hsa-miR-223-0.914740.5525hsa-miR-203a-0.843150.5587hsa-miR-216a-0.813460.5366hsa-miR-217-0.769370.5366hsa-miR-181c-0.763580.6223hsa-miR-876-5p-0.761690.6209hsa-miR-181a-0.7598100.6223hsa-miR-181b-0.7598110.6223hsa-miR-181d-0.7561120.6223hsa-miR-203a-0.7297130.5665hsa-miR-590-3p-0.6636140.6232hsa-miR-590-5p-0.6174150.6869hsa-miR-21-0.6100160.6869注：hsa-miR-203有两个不同的RASSF6靶向结合位点。因为所选miRNAs靶向调节RASSF6，RASSF6是一个抑癌基因，在CRC中低表达，故我们通过TCGA数据库下载筛选出来的15个miRNA及RASSF6在正常及CRC组织中的表达值及相应患者临床病理信息，进一步筛选出其中表达上调的miRNAs，结果如图3所示，与正常组织相比，有10个miRNA在CRC中表达上调。继续用GraphPad软件分
【参考文献】：
期刊论文
[1]Low RASSF6 expression in pancreatic ductal adenocarcinoma is associated with poor survival[J]. Hui-Lin Ye,Dou-Dou Li,Qing Lin,Yu Zhou,Quan-Bo Zhou,Bing Zeng,Zhi-Qiang Fu,Wen-Chao Gao,Yi-Min Liu,Rui-Wan Chen,Zhi-Hua Li,Ru-Fu Chen. World Journal of Gastroenterology. 2015(21)
[2]Current treatment for colorectal liver metastases[J]. Evangelos P Misiakos,Nikolaos P Karidis,Gregory Kouraklis. World Journal of Gastroenterology. 2011(36)
本文编号：3459466
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