宣威肺癌蛋白质组学研究
发布时间：2021-11-17 23:50
[目的]为了阐明宣威肺癌发病机理,开展宣威肺癌蛋白质组学研究,筛选出与宣威肺癌发病机制或可作为宣威肺癌预后因子的潜在生物标志物,改善宣威肺癌患者诊断治疗及预后评估。[方法]利用胰酶酶解的方法提取肺癌组织及配对的正常组织中的蛋白质,通过TMT标记的方法进行蛋白质组测序,并利用生物信息学软件进行蛋白质注释、亚细胞定位、差异蛋白筛选、GO富集、蛋白质互作网络等分析筛选目标蛋白。[结果]指定的差异表达量下（阈值设为FC值1.5）,所有样本中,癌组织和癌旁正常组织的差异表达蛋白均超过100个,肺癌组织和肺正常组织中检测到下调蛋白数为193个,上调蛋白数为189个,共计总数为382个。基因本论分析结果显示上述中检测到的差异蛋白大多具有transport功能,是细胞膜等主要组分并发挥结合作用。KEGG信号通路富集分析发现Nitrogen metabolism（氮代谢）和Hematopoietic cell lineage（造血细胞系）等通路被显著富集到。[结论]通过生物信息学分析,每个样木我们至少鉴定到5991个蛋白质,其中癌组织与肺正常组织差异表达蛋白达到382个。GO富集分析结果提示:差异表达蛋...
【文章来源】：昆明医科大学云南省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２．不同时期宣威肺癌死亡率比较［１４］?（Ａ）?１９９０－１９９２年（Ｂ）?２００４－２００５年??
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６４３９．０个蛋白。详细的实验结果汇总如下（表５）。依据样本中蛋白质的表达量，??利用主成分分析（图６），我们可以很清晰把肺癌组织和癌旁肺组织区分来。??１３７９２２０??■｜｜｜｜｜?１３１１７３?１２５９９７??１ｅ＋０５－??６４＾?５９９１??Ｉ?Ｉ??／／／／／／??，／?／?／?／??图５．质谱数据结果基本统计图??表５．质谱数据结果基本统计表??Ｔｏｔａｌ?Ｍａｔｃｈｅｄ?Ｐｅｐｔｉｄｅｓ?Ｕｎｉｑｕｅ?Ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ?Ｑｕａｎｔｉｆｉａｂｌｅ??ｓｐｅｃｔｒｕｍ?ｓｐｅｃｔｒｕｍ?ｐｅｐｔｉｄｅｓ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ??１３７９２２０．０?２２３２２８（１６．２％）?１３１１７３．０?１２５９９７．０?６４３９．０?５９９１．０??２０??
【参考文献】：
期刊论文
[1]云南省肿瘤医院2005年-2014年肺癌流行病学特征变化趋势分析[J]. 林艳苹,张强,陆彦霓,黄云超,马洁,周永春. 中国肺癌杂志. 2020(03)
[2]R-EBUS、LungPro导航支气管镜联合快速现场细胞学评估在周围型肺结节诊断中的应用价值比较[J]. 陈琬玲,马煜辉,张祥武,黄秋博,赵光强,雷玉洁,彭薇,尹新,杨艳芬,谭慧,张磊,黄云超. 中国癌症杂志. 2020(02)
[3]结核分枝杆菌感染对非小细胞肺癌患者调节性免疫细胞的负向调节作用[J]. 宁洪叶,蒋贤高,施伎蝉,何贵清,吴正兴. 中华危重症医学杂志(电子版). 2019(04)
[4]肺癌组织中结核分枝杆菌L型MPB64基因的检测[J]. 米热古丽·阿不都热合曼,哈里木拉提·艾木肉拉,热西旦·司马义,买尔旦·阿不来,胡蓉,马瑶. 标记免疫分析与临床. 2018(12)
[5]云南省127960名城市居民癌症风险评估及筛查结果分析[J]. 张强,黄云超,沈丽达,赵云红,姜高香,周海,林艳苹. 中国肿瘤. 2018(09)
[6]结核分枝杆菌L型血流感染与肺癌患者红细胞免疫功能的相关性分析[J]. 赵会海,秦立霞,李彦青,刘莉,徐娜,秦静. 临床和实验医学杂志. 2018(05)
[7]非小细胞肺癌患者外周血ctDNA样本中EGFR-T790M基因突变分析[J]. 杜亚茜,马煜辉,杨长绍,叶联华,丁晓洁,李权,郭银金,刘俊熙,黄云超,周永春. 实用医学杂志. 2017(19)
[8]miR-501-5p在宣威地区肺腺癌组织中的表达及临床意义[J]. 陈帅,周永春,陈颖,陈小波,李光剑,雷玉洁,田林玮,赵光强,黄秋博,黄云超. 南方医科大学学报. 2017(03)
[9]Sox4在女性肺癌细胞上皮-间质转化中的作用及其机制[J]. 周永春,陈云兰,黄云超. 中国老年学杂志. 2017(04)
[10]EBUS-TBNA联合EBUS-TENA在纵隔淋巴结诊断与分期中的应用[J]. 马煜辉,谭慧,黄云超,周永春,杨凯云,黄秋博. 实用医学杂志. 2016(09)
本文编号：3501833
【文章来源】：昆明医科大学云南省
【文章页数】：65 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图２．不同时期宣威肺癌死亡率比较［１４］?（Ａ）?１９９０－１９９２年（Ｂ）?２００４－２００５年??
？级母离子质量误差容忍度，０．０２?Ｄａ二级碎片离子质量误差容忍度设置酶切参??数；固定修饰为ｔ？胱氨酸烷钱化，甲硫氨酸的氧化设置为可变修饰，蛋ＡＮ端的??乙酰化，脱酰胺化（ＮＱ）。１％的蛋丨＇１鉴定、ＰＳＭ鉴定ＦＤＲ用ＴＭＴ－ＩＯＰｌｅｘ进行??定量。??２．８质谱质控检测??Ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ?ｐｅｐｔｉｄｅ?ｌｅｎｇｔｈ?ｄｉｓｔｒｉｂｕｔｉｏｎ??■Ｉｋ！??￣ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ—ｉ??７?８?９?１０?１１?１２?１３?１４?ＩＳ?１６?１７?１?８?１９?２０?２１?２２?２３?２４?２５?２６?２７?２８?２９?３０?＞３０??Ｐｅｐｔｉｄｅ?ｌｅｎｇｔｈ??图２．肽段长度分布??如丨冬丨２所示，结果４所选取的＿解和碎裂／／式的常态吻介，肽段氨裉酸主??要分布区域为７至２０个。其中，不符合ＨＣＤ的碎裂方式ＩＬ大子２０个氨基酸的??肽段质最和电荷数偏高，而产生的碎片离子过少的小十５个氣袪酸的肽段则无??法进行有效的序列鉴定。总体肴来，质谱分析得到肽段长度的分布已满足相应??的质控标准。??１３??
６４３９．０个蛋白。详细的实验结果汇总如下（表５）。依据样本中蛋白质的表达量，??利用主成分分析（图６），我们可以很清晰把肺癌组织和癌旁肺组织区分来。??１３７９２２０??■｜｜｜｜｜?１３１１７３?１２５９９７??１ｅ＋０５－??６４＾?５９９１??Ｉ?Ｉ??／／／／／／??，／?／?／?／??图５．质谱数据结果基本统计图??表５．质谱数据结果基本统计表??Ｔｏｔａｌ?Ｍａｔｃｈｅｄ?Ｐｅｐｔｉｄｅｓ?Ｕｎｉｑｕｅ?Ｉｄｅｎｔｉｆｉｅｄ?Ｑｕａｎｔｉｆｉａｂｌｅ??ｓｐｅｃｔｒｕｍ?ｓｐｅｃｔｒｕｍ?ｐｅｐｔｉｄｅｓ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ?ｐｒｏｔｅｉｎｓ??１３７９２２０．０?２２３２２８（１６．２％）?１３１１７３．０?１２５９９７．０?６４３９．０?５９９１．０??２０??
【参考文献】：
期刊论文
[1]云南省肿瘤医院2005年-2014年肺癌流行病学特征变化趋势分析[J]. 林艳苹,张强,陆彦霓,黄云超,马洁,周永春. 中国肺癌杂志. 2020(03)
[2]R-EBUS、LungPro导航支气管镜联合快速现场细胞学评估在周围型肺结节诊断中的应用价值比较[J]. 陈琬玲,马煜辉,张祥武,黄秋博,赵光强,雷玉洁,彭薇,尹新,杨艳芬,谭慧,张磊,黄云超. 中国癌症杂志. 2020(02)
[3]结核分枝杆菌感染对非小细胞肺癌患者调节性免疫细胞的负向调节作用[J]. 宁洪叶,蒋贤高,施伎蝉,何贵清,吴正兴. 中华危重症医学杂志(电子版). 2019(04)
[4]肺癌组织中结核分枝杆菌L型MPB64基因的检测[J]. 米热古丽·阿不都热合曼,哈里木拉提·艾木肉拉,热西旦·司马义,买尔旦·阿不来,胡蓉,马瑶. 标记免疫分析与临床. 2018(12)
[5]云南省127960名城市居民癌症风险评估及筛查结果分析[J]. 张强,黄云超,沈丽达,赵云红,姜高香,周海,林艳苹. 中国肿瘤. 2018(09)
[6]结核分枝杆菌L型血流感染与肺癌患者红细胞免疫功能的相关性分析[J]. 赵会海,秦立霞,李彦青,刘莉,徐娜,秦静. 临床和实验医学杂志. 2018(05)
[7]非小细胞肺癌患者外周血ctDNA样本中EGFR-T790M基因突变分析[J]. 杜亚茜,马煜辉,杨长绍,叶联华,丁晓洁,李权,郭银金,刘俊熙,黄云超,周永春. 实用医学杂志. 2017(19)
[8]miR-501-5p在宣威地区肺腺癌组织中的表达及临床意义[J]. 陈帅,周永春,陈颖,陈小波,李光剑,雷玉洁,田林玮,赵光强,黄秋博,黄云超. 南方医科大学学报. 2017(03)
[9]Sox4在女性肺癌细胞上皮-间质转化中的作用及其机制[J]. 周永春,陈云兰,黄云超. 中国老年学杂志. 2017(04)
[10]EBUS-TBNA联合EBUS-TENA在纵隔淋巴结诊断与分期中的应用[J]. 马煜辉,谭慧,黄云超,周永春,杨凯云,黄秋博. 实用医学杂志. 2016(09)
本文编号：3501833
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