拟糖蛋白与胃癌患者口腔微生物的关联研究
发布时间:2021-11-24 05:01
研究背景及意义:胃癌(Gastric cancer,GC)是一类严重威胁人类健康的全球性恶性肿瘤,具有极高的死亡率。GC早期症状不明显以及缺少早期诊断标志物导致了大多数GC患者发展至进展期才被确诊,从而导致了GC的高死亡率。因此寻找可靠的GC早期诊断标志物,建立高效的早期GC诊断方法仍是目前的研究热点。口腔微生物在维持人体口腔及全身健康中发挥着重要的作用。远端器官病变也会分泌细胞因子等物质,通过血液循环、内分泌和淋巴系统影响口腔微环境,进而影响口腔微生物群落的组成与分布。我们前期的研究表明了GC患者唾液糖蛋白糖型发生了显著的改变,糖型的改变是否会引起口腔微生物群落的变化仍不清楚。因此,本课题首先研究了GC患者与健康志愿者(Healthy volunteers,HV)口腔微生物图谱,为GC的筛查、辅助诊断、风险疗效评估提供新的思路;其次合成GC患者变化的唾液糖蛋白糖型对应的拟糖蛋白,研究拟糖蛋白对GC患者口腔中丰度上调菌群的影响及其潜在影响机制,揭示唾液糖蛋白糖型与GC患者口腔微生物菌群丰度变化的关联性,阐明唾液糖蛋白糖链与口腔微生物在人体远端疾病发生发展过程中的关联作用。方法:本研究共...
【文章来源】:西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】:144 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
革兰氏阴性菌细胞壁结构
第一章引言23体NLRs(如NLRP3)通过接头蛋白ASC与Caspase-1前体结合,激活Caspase-1,激活后的Caspase-1一方面对IL-1β和IL-18的前体进行切割,形成有活性的IL-1β,IL-18并释放到胞外,募集炎症细胞,扩大炎症反应,另一方面对GasderminD进行切割,生成含有N端活性的肽段,与细胞膜中的脂蛋白结合,导致了膜穿孔,发生细胞焦亡[162-164]。此外,LPS诱导炎症反应的非经典通路中,Caspase-4和Caspase-5能够直接与LPS结合,将未成熟的IL-1β和IL-18加工形成成熟的IL-1β和IL-18释放出胞外,并引起细胞焦亡[165]。图1-2细菌LPS诱导炎症反应经典通路Figure1-2TheinflammatorycanonicalpathwayinducedbyLPS1.6本论文的研究目的与意义1.6.1研究目标a.研究GC患者与HV口腔微生物群落分布,筛选GC患者口腔微生物中丰度发生显著变化的菌种。b.根据GC患者唾液糖蛋白糖型的改变,合成拟糖蛋白模拟糖在自然状态下的功能c.筛选对GC患者口腔优势菌(丰度上调的菌种)具有影响作用的拟糖蛋白d.拟糖蛋白对口腔微生物的影响以及其机制的研究e.Fuc-BSA,A.segnis对口腔细胞影响的初步研究
第二章胃癌患者口腔微生物的筛选与分离25第二章胃癌患者口腔微生物的筛选与分离2.1引言16SrDNA存在所有细菌基因组中,包含10个保守区(ConservedRegions)与9个可变区(VariableRegions),被广泛的应用于细菌的分类与鉴定(图2-1)。通常针对保守区设计出细菌通用引物,扩增出包含高变区(如V3、V4、V3-V4或者V4-V5)的DNA片段,对DNA片段进行高通量测序,与微生物16SrDNA数据库进行比对,进行菌种的鉴定以及群落多样性的分析。本章通过对HV与GC患者口腔微生物16SrDNAV3-V4片段扩增子测序,探究GC患者口腔微生物图谱以及与HV口腔微生物的差异,筛选GC患者口腔微生物中丰度发生显著变化的菌种。图2-116SrDNA保守区与可变区示意图Figre2-1Theconservedandvariableregionsof16SrDNA2.2实验材料2.2.1实验主要仪器表2-1主要实验仪器目录主要实验仪器名称生产商生物安全柜HealForceCrop(香港)高压灭菌锅TOMYCrop(日本)生化培养箱天津泰斯特NanoPhotometerImplen(德国)恒温摇床上海捷呈
本文编号:3515285
【文章来源】:西北大学陕西省 211工程院校
【文章页数】:144 页
【学位级别】:博士
【部分图文】:
革兰氏阴性菌细胞壁结构
第一章引言23体NLRs(如NLRP3)通过接头蛋白ASC与Caspase-1前体结合,激活Caspase-1,激活后的Caspase-1一方面对IL-1β和IL-18的前体进行切割,形成有活性的IL-1β,IL-18并释放到胞外,募集炎症细胞,扩大炎症反应,另一方面对GasderminD进行切割,生成含有N端活性的肽段,与细胞膜中的脂蛋白结合,导致了膜穿孔,发生细胞焦亡[162-164]。此外,LPS诱导炎症反应的非经典通路中,Caspase-4和Caspase-5能够直接与LPS结合,将未成熟的IL-1β和IL-18加工形成成熟的IL-1β和IL-18释放出胞外,并引起细胞焦亡[165]。图1-2细菌LPS诱导炎症反应经典通路Figure1-2TheinflammatorycanonicalpathwayinducedbyLPS1.6本论文的研究目的与意义1.6.1研究目标a.研究GC患者与HV口腔微生物群落分布,筛选GC患者口腔微生物中丰度发生显著变化的菌种。b.根据GC患者唾液糖蛋白糖型的改变,合成拟糖蛋白模拟糖在自然状态下的功能c.筛选对GC患者口腔优势菌(丰度上调的菌种)具有影响作用的拟糖蛋白d.拟糖蛋白对口腔微生物的影响以及其机制的研究e.Fuc-BSA,A.segnis对口腔细胞影响的初步研究
第二章胃癌患者口腔微生物的筛选与分离25第二章胃癌患者口腔微生物的筛选与分离2.1引言16SrDNA存在所有细菌基因组中,包含10个保守区(ConservedRegions)与9个可变区(VariableRegions),被广泛的应用于细菌的分类与鉴定(图2-1)。通常针对保守区设计出细菌通用引物,扩增出包含高变区(如V3、V4、V3-V4或者V4-V5)的DNA片段,对DNA片段进行高通量测序,与微生物16SrDNA数据库进行比对,进行菌种的鉴定以及群落多样性的分析。本章通过对HV与GC患者口腔微生物16SrDNAV3-V4片段扩增子测序,探究GC患者口腔微生物图谱以及与HV口腔微生物的差异,筛选GC患者口腔微生物中丰度发生显著变化的菌种。图2-116SrDNA保守区与可变区示意图Figre2-1Theconservedandvariableregionsof16SrDNA2.2实验材料2.2.1实验主要仪器表2-1主要实验仪器目录主要实验仪器名称生产商生物安全柜HealForceCrop(香港)高压灭菌锅TOMYCrop(日本)生化培养箱天津泰斯特NanoPhotometerImplen(德国)恒温摇床上海捷呈
本文编号:3515285
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