乳腺癌组织circRNA差异性表达谱筛选和功能预测分析

发布时间：2021-12-24 02:26

　　第一部分乳腺癌组织特异性circRNAs的筛选及验证研究背景乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一,全球每年约有170万乳腺癌新发病例,严重威胁着女性的健康。随着人们生育和生活方式的改变,乳腺癌发病率呈不断上升的趋势。乳腺癌的发生与肥胖、缺乏运动、酒精使用、初潮年龄、绝经年龄、第一胎生育年龄、雌激素和孕激素使用等因素相关。然而家庭聚集现象以及在相同暴露下只有少数人患病的事实表明,个体遗传因素同样重要。circRNA（环状RNA）最早于上世纪70年代在RNA病毒中被发现,但一直被误认为是外显子转录本错误剪接而形成的低丰度RNA分子。近年来,研究发现circRNA与人类健康和疾病的发生发展密切相关,但与乳腺癌的关联研究还处于起步阶段。本研究采用芯片技术筛选乳腺癌相关的差异性表达circRNAs,评估其作为乳腺癌生物标志物的价值。方法本研究采用两阶段病例-对照研究设计。第一阶段是初筛阶段,收集新发乳腺癌患者癌组织和癌旁组织共4对样本,利用circRNA芯片检测组织中circRNA表达谱,筛选差异表达的circRNAs,筛选标准为表达量差异倍数（fold change,FC）>2倍,P<... 

【文章来源】：南京医科大学江苏省

【文章页数】：86 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

circRNA芯片扫描图

图 2. circRNA 芯片质控箱式图Figure 2. Box plot for quality control of circRNA microarray组织中差异 circRNAsP <0.05 且 FC >2 倍的标准，筛选差异表达 circRNAs 在乳腺癌，共检测到 1155 个差异表达 circRNAs，其中 715 个在癌组织 个在癌组织中表达下调 根据 P 值和 FC 绘制火山图（图 3）为差异表达的 circRNAs，左边的红点代表癌组织中表达下右边的红点代表癌组织中表达上调的 circRNAs 表 3A 和 3B 达倍数最显著的 100 个表达上调的 circRNAs 和 100 个表达其中上调的 circRNAs 中 FC 最大的是 hsa_circRNA_005230（005230），下调的 circRNAs 中 FC 最大的是 hsa_circRNA_40622

24图 3.差异表达 circRNAs 的火山图Figure 3. Volcano plot of differentially expressed circRNAs

【参考文献】：
期刊论文
[1]Pro?ling and Validation of the Circular RNA Repertoire in Adult Murine Hearts[J]. Tobias Jakobi,Lisa F.Czaja-Hasse,Richard Reinhardt,Christoph Dieterich.  Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2016(04)
[2]环状RNA与人类疾病[J]. 付丽云,胡耀仁,郭俊明.  中国生物化学与分子生物学报. 2015(08)
[3]环状RNA的生物学功能及其在疾病发生中的作用[J]. 李培飞,陈声灿,邵永富,蒋孝明,肖丙秀,郭俊明.  生物物理学报. 2014(01)

博士论文
[1]ciRS-7/miR-7/FAK调节轴对宫颈癌侵袭迁移的影响及紫草素干预机制的研究[D]. 郝臻凤.扬州大学 2015



本文编号：3549644