长链非编码RNA XLOC 0 00647在胰腺癌进展及侵袭中的作用与机制研究
发布时间：2022-01-01 08:56
背景长链非编码RNAs（long non-coding RNAs,lncRNAs）在包括胰腺癌（pancreatic cancer,PC）在内的多种肿瘤的发生与发展中发挥重要作用。近年研究表明lncRNAs可通过顺式调控作用的方式调控其附近基因的表达。本研究前期首先通过胰腺癌及癌旁组织lncRNAs芯片鉴定了一个在胰腺癌中低表达的新的lncRNA XLOC000647（简称为XLOC000647）,但目前关于XLOC000647在胰腺癌中的表达及其功能仍不清楚。方法实时定量PCR检测XLOC000647及其附近基因NLRP3（NOD-like receptor family pyrin domain-containing 3,NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3,即NLRP3炎性小体）在胰腺癌组织及细胞中的表达水平。Transwell实验检测胰腺癌细胞的迁移和侵袭能力。Western blot实验检测胰腺癌细胞的上皮-间质转化（epithelial-mesenchymal transition,EMT...
【文章来源】：南京医科大学江苏省
【文章页数】：96 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
胰腺癌组织和癌旁组织中差异表达lncRNAs的鉴定
log10(0.05)；上调基因：2074 个；下调基因：2693 个；无差别基因：7220 个。B 差异 lncRNAs聚类分析的热图。左侧 3 例：癌旁组织（N）；右侧 3 例：癌组织（Ca）。可见我们的目的基因 XLOC_000647 在胰腺癌组织中明显低表达。考虑到芯片检测的高敏感性以及所用样本的数量限制，我们进一步收集了48 例胰腺癌患者手术切除的癌组织及癌旁组织样本，采用实时荧光定量 PCR 技术检测了 XLOC_000647 的表达水平，结果显示 XLOC_000647 在胰腺癌组织中的表达水平明显低于癌旁组织，与芯片分析结果一致（图 2A）。这表明，XLOC_000647 在胰腺癌中很可能是一个发挥抑癌基因功能的关键基因。此外，我们检测了 XLOC_000647 在人胰腺癌细胞株（PANC-1、MIA-PaCa-2、BxPC-3）及人正常胰腺导管上皮细胞（HPDE6）中的表达，结果显示 XLOC_000647 在胰腺癌细胞系中的表达水平明显低于 HPDE6，且 XLOC_000647 在 MIA-PaCa-2 和BxPC-3 细胞株中的表达下调最显著（图 2B），因此我们采用 MIA-PaCa-2 和BxPC-3 两株细胞系进行后续功能研究。
图 3 XLOC_000647 的表达水平与胰腺癌患者的临床病理特征及预后的关系。AXLOC_000647 在不同 TNM 分期胰腺癌患者中的表达水平。TNM I 期：n=19；TNM II 期：n=18；TNM III 期：n=11。B XLOC_000647 在不同程度淋巴结转移胰腺癌患者中的表达水平。N0（无区域淋巴结转移）：n=23；N1（区域淋巴结转移 1-3 枚）：n=16；N2（区域淋巴结转移≥4 枚）：n=9。qRT-PCR 数据以倍数变化（2-ΔΔCt）表示。C 胰腺癌患者的生存曲线。根据 XLOC_000647 的表达水平将胰腺癌患者分为高表达组（中位生存期 17.0±2.1）和低表达组（中位生存期 11.0±5.6），对数秩检验（log-rank test，two-sided）进行统计学分析。NS（not significant），*P<0.05，**P<0.01，***P<0.001。表 2 胰腺癌患者总生存期的单变量和多变量分析（n=48）VariablesUnivariate analysis Multivariate analysisHR 95% CI P-value HR 95% CI P-valueGenderAgeTNMⅠ vs. Ⅱ2.0630.4700.2260.706-6.0250.161-1.3670.063-0.8040.1860.1660.039*0.022*
【参考文献】：
期刊论文
[1]Roles, Functions, and Mechanisms of Long Non-coding RNAs in Cancer[J]. Yiwen Fang,Melissa J.Fullwood. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2016(01)
[2]Long non-coding RNA:dancing on immune stage[J]. HUANG Bo. Science China（Life Sciences）. 2014(06)
本文编号：3562042
【文章来源】：南京医科大学江苏省
【文章页数】：96 页
【学位级别】：博士
【部分图文】：
胰腺癌组织和癌旁组织中差异表达lncRNAs的鉴定
log10(0.05)；上调基因：2074 个；下调基因：2693 个；无差别基因：7220 个。B 差异 lncRNAs聚类分析的热图。左侧 3 例：癌旁组织（N）；右侧 3 例：癌组织（Ca）。可见我们的目的基因 XLOC_000647 在胰腺癌组织中明显低表达。考虑到芯片检测的高敏感性以及所用样本的数量限制，我们进一步收集了48 例胰腺癌患者手术切除的癌组织及癌旁组织样本，采用实时荧光定量 PCR 技术检测了 XLOC_000647 的表达水平，结果显示 XLOC_000647 在胰腺癌组织中的表达水平明显低于癌旁组织，与芯片分析结果一致（图 2A）。这表明，XLOC_000647 在胰腺癌中很可能是一个发挥抑癌基因功能的关键基因。此外，我们检测了 XLOC_000647 在人胰腺癌细胞株（PANC-1、MIA-PaCa-2、BxPC-3）及人正常胰腺导管上皮细胞（HPDE6）中的表达，结果显示 XLOC_000647 在胰腺癌细胞系中的表达水平明显低于 HPDE6，且 XLOC_000647 在 MIA-PaCa-2 和BxPC-3 细胞株中的表达下调最显著（图 2B），因此我们采用 MIA-PaCa-2 和BxPC-3 两株细胞系进行后续功能研究。
图 3 XLOC_000647 的表达水平与胰腺癌患者的临床病理特征及预后的关系。AXLOC_000647 在不同 TNM 分期胰腺癌患者中的表达水平。TNM I 期：n=19；TNM II 期：n=18；TNM III 期：n=11。B XLOC_000647 在不同程度淋巴结转移胰腺癌患者中的表达水平。N0（无区域淋巴结转移）：n=23；N1（区域淋巴结转移 1-3 枚）：n=16；N2（区域淋巴结转移≥4 枚）：n=9。qRT-PCR 数据以倍数变化（2-ΔΔCt）表示。C 胰腺癌患者的生存曲线。根据 XLOC_000647 的表达水平将胰腺癌患者分为高表达组（中位生存期 17.0±2.1）和低表达组（中位生存期 11.0±5.6），对数秩检验（log-rank test，two-sided）进行统计学分析。NS（not significant），*P<0.05，**P<0.01，***P<0.001。表 2 胰腺癌患者总生存期的单变量和多变量分析（n=48）VariablesUnivariate analysis Multivariate analysisHR 95% CI P-value HR 95% CI P-valueGenderAgeTNMⅠ vs. Ⅱ2.0630.4700.2260.706-6.0250.161-1.3670.063-0.8040.1860.1660.039*0.022*
【参考文献】：
期刊论文
[1]Roles, Functions, and Mechanisms of Long Non-coding RNAs in Cancer[J]. Yiwen Fang,Melissa J.Fullwood. Genomics,Proteomics & Bioinformatics. 2016(01)
[2]Long non-coding RNA:dancing on immune stage[J]. HUANG Bo. Science China（Life Sciences）. 2014(06)
本文编号：3562042
本文链接：https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zlx/3562042.html
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