DDX31在结直肠癌中的表达及对结直肠癌细胞增殖、侵袭和迁移影响的研究

发布时间：2022-01-03 17:51

　　【目的】检测DDX31在结直肠癌组织中的表达情况,探究DDX31对结直肠癌细胞功能和结直肠癌细胞系SW480在裸鼠体内成瘤的影响,为结直肠癌在基因治疗方面提供理论基础。【方法】第一部分:（1）.从TCGA数据库,Oncomine数据库下载数据,并对结直肠癌中DDX31的表达量进行分析,再结合数据库中的临床信息,分析DDX31表达水平与患者预后之间的相关性;（2）.收集结直肠癌患者信息及肿瘤样本,并进行了免疫组化检测,分析DDX31的表达水平与患者临床特征之间的相关性。第二部分:（1）.设计DDX31的siRNA,并在SW480细胞系中检测沉默效率;（2）.选择沉默效率最高的siRNA转染SW480细胞系,利用CCK-8法检测沉默DDX31的SW480细胞与对照组细胞的增殖,利用流式细胞仪分析两组细胞的凋亡和周期,采用transwell chamber进行细胞侵袭实验检测两组细胞的侵袭能力,采用细胞划痕的方法定性检测DDX31对结直肠癌细胞迁移能力的影响。第三部分:（1）.获取DDX31干扰序列基因片段,进行慢病毒载体的重组质粒构建,然后进行慢病毒包装及滴度的检测,利用慢病毒转染SW48... 

【文章来源】：苏州大学江苏省 211工程院校

【文章页数】：87 页

【学位级别】：博士

【部分图文】：

TCGA数据聚类热图，TCGA数据库关于结直肠癌(286例结直肠癌患者以及41例正常对照)的差异表达基因（|logFC|>1，P<0.05）（前50高表达以及前50低表

DDX31的mRNA水平在结直肠癌患者中较正常组明显增加，数据来源于TCGA数据库

图 3. DDX31 在多种肿瘤中表达均有上调, 横坐标为不同的肿瘤，纵坐标为 mRNA 水平，红色为肿瘤组，蓝色为正常组二、Oncomine 数据库中验证 DDX31 在结直肠癌组织中表达上调在 TCGA 数据库中，发现结直肠癌患者中 DDX31 表达明显上调，另外，DDX31在其他肿瘤组织中也出现上调。接着，利用 Oncomine 数据库（也称为癌症微阵列数据库和整合数据挖掘平台，通过整合己经发表的利用 DNA 微阵列技术分析肿瘤基因组的数据，形成一个统一的生物信息学资源库，使得各主要的癌症类型和相应的正常组织的基因进行差异表达分析）对单个基因即 DDX31 的表达量进行查询并可视化，发现 DDX31 在结直肠癌患者中也出现上调（图 4），差异具有统计学意义。


本文编号：3566706