YWHAE在大肠癌中的表达及其生物信息学分析

发布时间：2022-01-09 15:51

　　背景及目的:大肠癌（CRC）是我国常见的恶性肿瘤之一,其发病率及死亡率在近年呈上升趋势,多数病人发病时已处于中晚期,转移及复发是患者死亡的主要原因。目前,手术治疗辅以放、化疗为主要的治疗手段,因此早期筛查与诊断大肠癌尤为重要。随着分子诊断学的不断发展,分子标记物逐渐用来早期筛查及诊断恶性肿瘤,其具有高灵敏度及特异性的特点。大量研究证明酪氨酸3-单加氧酶/色氨酸5-单加氧酶激活蛋白,ε肽（Tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation activation protein,epsilon,YWHAE）参与细胞的多种生理活动,在肿瘤的发生、发展、转移中发挥一定的作用。本文研究YWHAE在大肠癌中的表达情况以及对其生物信息学进行分析。通过挖掘相关专业数据库,探索YWHAE在大肠癌发生、发展、转移中的作用,旨为临床早期诊断大肠癌提供新型肿瘤标志物以及基因治疗靶点。方法:本实验方法涉及以下3个方面:（1）采用色谱与质谱联用技术来筛选差异表达的蛋白。（2）查阅大量相关文献,筛选出YWHAE作为本次实验的目标蛋白。应用We... 

【文章来源】：吉林大学吉林省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：60 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图３．２?ＹＷＨＡＥ的质谱图??

?第４章免疫印＿迹试验验证ＹＷＨＡＥ在大肠癌中的表达情况???根据试剂盒说明书进行ＥＣＬ显色压胶片，然后用凝胶图像分析系统??对胶片进行扫描，选择自动吸光度分析，根据目标蛋白ＹＷＨＡＥ与之??相对应的内参Ｐ?－ａｃｔｉｎ条带的比值，从而来评价ＹＷＨＡＥ的表达水??平。??４．２结果??免疫印迹实验验证了?ＹＷＨＡＥ在大肠癌组织中表达高于癌旁组??织，结果如图４．２所示，其中，Ａ为大肠癌组织，Ｂ为癌旁组织。??Ａ?Ｂ??ＹＷＨＡＥ?３０ＫＤ??４３ＫＤ??图４．２?ＹＷＨＡＥ在大肠癌及癌旁组织中的表达??４．３讨论??免疫印迹实验（蛋白质印迹法）即Ｗｅｓｔｅｒｎ?Ｂｌｏｔ是分子生物学、生??物化学和免疫遗传学中经常使用的一种实验方法。其基本原理是通过??特异性抗体对凝胶电泳处理过的细胞或组织标本进行着色。通过分析??着色的位置和着色深度获得特定蛋白质在所分析的细胞或组织中表??达情况的信息。蛋白质印迹技术逐渐从对复杂混合物中的特定蛋白质??的鉴定演变为直接对单个细胞中蛋白质检测，使其成为临床研究中重??要分析工具。蛋白质印迹技术可以用于作为ＨＩＶ、寄生虫和真菌病的??临床诊断［４５］。??１９??

?ｌ?５ｋ＂?１?．?〇．?〇?？?ｍｕｔａｔｅｄ??ｉ４ｋ－??画?３ｋ－?。?，?？?Ｂ—ｕ＿??ｉ?２ｋ－。細歉。，。、９?—??■?ｉｋ＿。戮，－？??１?ｏ??２?〇－??ａ．??ＬＵ??＜??，?，?，?，?，?ｒ??§?５ｋ?１０ｋ?１５ｋ?２０ｋ?２５ｋ?３０ｋ??Ｅ??ｍＲＮＡ?Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ，?ＲＳＥＭ?（Ｂａｔｃｈ?ｎｏｒｍａｌｉｚｅｄ?ｆｒｏｍ?ｌｌｌｕｍｉｎａ?ＨｉＳｅｑ＿ＲＮＡＳｅｑＶ２）：?ＹＷＨＡＥ??图５．５?ＹＷＨＡＥ与ＴＰ５３之间的表达相关性??５．２．３?ＣＯＳＭＩＣ数据库分赌果??通过分析ＣＯＳＭＩＣ数据库，我们可以得到ＹＷＨＡＥ总突变类型??及其比例，如图３．５所示，该图显示了具有突变的所有类型，一共有??３３１例样本参与研究，括号中的数据表示具有特定突变类型的比率，??因为一种样本不止有一种突变类型，所示说各种突变类型样本数量总??和不等于总体样本数量。在表中，我们可以观察到，在各种突变类型??中，无义突变所占比例最小，占０．９１％，错义突变所占比例最高，达??１７．５２％。其他突变类型所占比列较小，占比区间为０．００％－６．０４％。具??体数据信息如图５．６所示。??２７??

【参考文献】：
期刊论文
[1]14-3-3蛋白与肿瘤发生发展的研究进展[J]. 杨建军,秦环龙.  世界华人消化杂志. 2010(28)



本文编号：3579006