lncRNA AC007392.4在结直肠癌发生发展中的作用及机制研究
发布时间:2022-01-14 10:58
结直肠癌(Colorectal cancer,CRC)作为如今普外科最常见的消化道肿瘤之一,由于缺乏有效的分子诊断及治疗靶标,疾病一旦确诊,患者基本都已经位于中晚期,而目前主要的治疗手段还是以手术治疗为主,多数患者预后不是很理想。长链非编码RNA(long non-coding RNA)属于一类长度约为220nt的非编码RNA,已有研究表明其参与结直肠癌等多种恶性肿瘤的发生发展。然而,lnc RNA AC007392.4在结直肠癌中的功能尚不清楚,因此,本研究首次系统性探索其在结直肠癌中的生物学功能,并且初步探索在结直肠癌中AC007392.4发挥生物学功能的潜在分子机制。目的:结直肠癌为我国常见的恶性肿瘤之一,本研究以前期筛选的lnc RNA AC007392.4为研究对象,探讨其参与结直肠癌恶性生物学功能及潜在分子机制,为结直肠癌的临床诊断和治疗提供重要参考依据。方法:通过癌症基因组图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)分析长链非编码RNA AC007392.4在结直肠组织的表达情况,接着通过临床样本验证AC007392.4在结直肠癌中的表达;通过皮尔森相...
【文章来源】:蚌埠医学院安徽省
【文章页数】:52 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
AC007392.4在结直肠癌组织中高表达(A)且与临床病理分期有关(B)
19表达差异性,结果显示:相较于41例正常的癌旁组织,AC007392.4在480例结直肠癌组织中显著高表达,且相对于低分期(StageI-II)的组织中,其在高分期(StageIII-IV)的组织中表达量也具有差异性,说明AC007392.4可能参与结直肠癌的病理进展,与结直肠癌的发生发展具有一定的相关性。3.2临床样本验证AC007392.4在结直肠癌中高表达图2AC007392.4在结直肠癌组织中的表达显著高于其对应的癌旁组织(5对)此步骤由上海康成公司协助完成,样本均来源于蚌埠医学院附属肿瘤医院的结直肠癌术后患者,结果显示AC007392.4在临床样本中的含量具有差异性,相较于配对的癌旁组织来说,其在结直肠癌组织中显著高表达,具有统计学意义,这进一步验证了AC007392.4在结直肠癌中具有表达差异性,提示其可能参与结直肠癌的发生发展。
22与细胞周期的调控与DNA修复等,而在生物学途径中,AC007392.4主要富集与细胞周期及有丝分裂G2/M期等。这些结果共同提示了AC007392.4极有可能与细胞周期有关,尤其在G2/M期中发挥生物学功能。3.5瞬时转染效率的验证图5SW480细胞转染过表达载体及转染siRNA效率的验证为了使后续的实验结果更加的靠,同时也为了保证脂质体Lipofectamine6000的转染效率,我们通过实时荧光定量PCR对瞬时转染效率进行了验证,转染后提取细胞中的总RNA,通过反转录及扩增反应,以β-actin作为内参对照。结果可以看出,无论是过表达或敲低,AC007392.4的RNA表达水平均发生了明显的变化,具有统计学意义(P<0.05),证明了本研究的转染方法及转染效率可信,这对于下一步的功能验证及机制探索具有重要的铺垫作用。
【参考文献】:
期刊论文
[1]HOTAIR:an oncogenic long non-coding RNA in different cancers[J]. Mohammadreza Hajjari,Abbas Salavaty. Cancer Biology & Medicine. 2015(01)
硕士论文
[1]结直肠癌相关长链非编码RNA的筛选与功能研究[D]. 张俏.蚌埠医学院 2015
本文编号:3588382
【文章来源】:蚌埠医学院安徽省
【文章页数】:52 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
AC007392.4在结直肠癌组织中高表达(A)且与临床病理分期有关(B)
19表达差异性,结果显示:相较于41例正常的癌旁组织,AC007392.4在480例结直肠癌组织中显著高表达,且相对于低分期(StageI-II)的组织中,其在高分期(StageIII-IV)的组织中表达量也具有差异性,说明AC007392.4可能参与结直肠癌的病理进展,与结直肠癌的发生发展具有一定的相关性。3.2临床样本验证AC007392.4在结直肠癌中高表达图2AC007392.4在结直肠癌组织中的表达显著高于其对应的癌旁组织(5对)此步骤由上海康成公司协助完成,样本均来源于蚌埠医学院附属肿瘤医院的结直肠癌术后患者,结果显示AC007392.4在临床样本中的含量具有差异性,相较于配对的癌旁组织来说,其在结直肠癌组织中显著高表达,具有统计学意义,这进一步验证了AC007392.4在结直肠癌中具有表达差异性,提示其可能参与结直肠癌的发生发展。
22与细胞周期的调控与DNA修复等,而在生物学途径中,AC007392.4主要富集与细胞周期及有丝分裂G2/M期等。这些结果共同提示了AC007392.4极有可能与细胞周期有关,尤其在G2/M期中发挥生物学功能。3.5瞬时转染效率的验证图5SW480细胞转染过表达载体及转染siRNA效率的验证为了使后续的实验结果更加的靠,同时也为了保证脂质体Lipofectamine6000的转染效率,我们通过实时荧光定量PCR对瞬时转染效率进行了验证,转染后提取细胞中的总RNA,通过反转录及扩增反应,以β-actin作为内参对照。结果可以看出,无论是过表达或敲低,AC007392.4的RNA表达水平均发生了明显的变化,具有统计学意义(P<0.05),证明了本研究的转染方法及转染效率可信,这对于下一步的功能验证及机制探索具有重要的铺垫作用。
【参考文献】:
期刊论文
[1]HOTAIR:an oncogenic long non-coding RNA in different cancers[J]. Mohammadreza Hajjari,Abbas Salavaty. Cancer Biology & Medicine. 2015(01)
硕士论文
[1]结直肠癌相关长链非编码RNA的筛选与功能研究[D]. 张俏.蚌埠医学院 2015
本文编号:3588382
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