早晚期肝细胞肝癌中差异表达的长链非编码RNA和mRNA的筛选和生物信息学分析

发布时间：2022-01-14 17:26

　　背景:肝细胞肝癌（hepatocellular carcinoma,HCC）是全世界范围内常见的消化系统恶性肿瘤,发病率逐年攀升,其中位生存时间为6-20个月,是全世界癌症相关死亡的第三大主要病因。HCC由于其发病率高、侵袭性高、治疗方法有限、总的预后差,目前仍是一个具有挑战性的临床问题。因此,迫切需要寻找潜在的生物标志物,探索HCC发生的分子机制,为HCC的早期预防和诊治提供依据。随着基因组和新的转录测序技术的迅速发展,HCC的相关基因研究越来越受到关注,其中的长链非编码RNA（long non-codingRNA,lncRNA）已经成为HCC研究的焦点,lncRNA是一类大小超过200个核苷酸长度的RNA分子,作为分子研究领域的后起之秀,其在肿瘤中的作用越来越得到重视。近年来的研究表明,许多异常表达lncRNA在肿瘤相关的生物学过程中,如肿瘤的发生、增殖、浸润和转移,起到了非常重要的作用,有望成为是新的潜在的HCC生物标志物。目的:筛选数据库中早期和晚期HCC相关差异表达的lncRNA和mRNA,并进行相关的生物信息学分析,研究lncRNA作为早期HCC和晚期HCC生物标志物的作用... 

【文章来源】：河北医科大学河北省

【文章页数】：64 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

早期HCC与正常对照组、晚期HCC与正常对照组的差异表达mRNAs和差异表达lncRNAs韦恩图分析

早期和晚期HCC共有差异表达mRNA的前15个显著富集的Go-Terms和KEGG路径Fig4Top15significantlyenrichedGOtermsandKEGGpathwaysforsharedDEmRNAsinearlyandlateHCC

29图7晚期肝癌的lncRNA-mRNA共表达网络Fig7DElncRNAs-DEmRNAsco-expressionnetworkoflateHCCEllipsesandrhombusrepresentDEmRNAsandDElncRNAs,respectively.Redandgreencolorsrepresentupregulationanddownregulation,respectively.Theblueborderindicatesthetop20upregulationanddownregulatedDElncRNAsandDEmRNAs.6.候选基因的筛选结果根据两组共表达网络分析结果，共筛出584个（早期HCC组103个、晚期HCC组481个）差异表达的基因，对所有差异基因验证不太现实，因此我们对两组共有的差异表达基因进行交集，并对筛选出的比较重要的基因进行文献检索，结果见表16。表16文献检索结果Table16theresultsofliteratureretrievalGene疾病PMID数据分析结果文献报道结果备注CDKN3肝细胞癌31043166upup肝细胞癌29962817upup肝癌27314282updownCDC25C肝细胞癌28035361updown药物治疗后，该基因表

【参考文献】：
期刊论文
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本文编号：3588912