三阴性乳腺癌预后相关性微小RNA和信使RNA的综合分析
发布时间:2022-01-15 02:27
1 研究背景与目的三阴性乳腺癌(TNBC)是一种预后较差的乳腺癌亚型,好发于年轻女性,临床特点常表现为组织学分级高、侵袭性强、易复发转移。越来越多的研究表明微小RNA(miRNA)和信使RNA(mRNA)在包括乳腺癌在内的多种实体肿瘤的发生发展发挥着重要的调节作用,但他们在TNBC中的作用机制尚未明确。本研究旨在利用TCGA网站上的乳腺癌数据,通过一系列生物信息学分析,得到与TNBC预后相关的潜在miRNA标志物,并进行文献回顾,尝试探讨miRNA与mRNA在TNBC中的具体影响,为进一步探索肿瘤发生发展的分子作用机制提供理论基础。2材料及方法从癌症基因组图谱(TCGA)网站下载TNBC患者的miRNA和mRNA的测序样本(第3级),经过数据预处理后,利用Bioconductor软件包比较癌组织及正常乳腺组织间存在差异表达的miRNA及mRNA。差异表达miRNA进一步做生存分析,筛选预后相关miRNA。miRDB以及mirDIP两个数据库全面预测并注释差异表达 miRNA(Differential Expressed miRNAs,DEMs)的靶基因后,对预测得到的靶基因和差异表达的...
【文章来源】:南方医科大学广东省
【文章页数】:69 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图3-4排名前20的高连接性关键基因??Figure3-3?Top?20?highly?connective?key?genes??注:(A)为degree算法的前20名关键基因,(B)为closeness算法的前20名关键??24??
本文编号:3589711
【文章来源】:南方医科大学广东省
【文章页数】:69 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
图3-4排名前20的高连接性关键基因??Figure3-3?Top?20?highly?connective?key?genes??注:(A)为degree算法的前20名关键基因,(B)为closeness算法的前20名关键??24??
本文编号:3589711
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