基于TCGA数据挖掘分析及验证BTK在肺腺癌微环境重塑中的作用及意义

发布时间：2022-08-11 21:28

　　目的:肺癌是导致人类肿瘤相关致死的主要肿瘤类型,同时也是脑转移肿瘤的主要来源,尤其是非小细胞肺癌（non-small cell lung cancer,NSCLC）,几乎占据了一半的脑转移病例。虽然对肺癌的治疗已经取得了相当大的进步,但是患者的生存预后仍不乐观,尤其是肺癌的复发与转移严重地影响着病人的生活质量和生存时间。尽管免疫检查点抑制剂的应用极大地推动了肿瘤免疫治疗的发展与推广,然而较为明显的免疫相关副作用以及应用局限性在一定程度上阻碍了其进一步的发展与应用。因此,有必要更进一步地探索肿瘤微环境（tumor microenvironment,TME）与肿瘤细胞之间的相互关系及影响机制,挖掘微环境重塑的相关因子。尤其是肿瘤免疫微环境（tumor immune microenvironment,TIME）与肿瘤细胞间的相互作用与影响获得普遍的关注,例如研究发现肿瘤浸润淋巴细胞（tumor-infiltrating lymphocyte,TIL）与NSCLC患者的5年生存率显著相关,肿瘤中低丰度的浸润淋巴细胞是早期NSCLC不良预后的指标。正是这种临床上的相关性研究促进了免疫治疗的发展,... 

【文章页数】：96 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
Abstract
英文缩略语
第一部分:通过生物信息学分析挖掘肿瘤微环境重塑指示因子:基于TCGA数据挖掘分析
    1 前言
    2 材料和方法
        2.1 主要数据来源和软件算法
        2.2 研究对象和分组
        2.3 分析方法
        2.4 统计学显著性分析
    3 结果
        3.1 研究对象基本情况
        3.2 分析流程
        3.3 差异基因(DEGs)的产生
        3.4 DEGs 的热图聚类分析
        3.5 TME免疫组分和基质组分含量比例的生存分析
        3.6 免疫和基质成分与LUAD患者临床病理分期的相关性分析
        3.7 免疫与基质共有DEGs的 GO和 KEGG富集分析
        3.8 利用379个DEGs构建蛋白质互作(PPI)网络
        3.9 DEGs单因素COX回归分析
        3.10 DEGs蛋白质互作网络与生存相关因子的交集分析
        3.11 BTK在 LUAD肿瘤样本中表达下调,且与患者的生存相关
        3.12 BTK是 TME重塑的潜在标志物
        3.13 TICs差异分析
        3.14 TICs相关性分析
        3.15 BTK与 TICs相关性分析
        3.16 BTK与 TICs差异相关性的交集分析
        3.17 BTK与 LUAD患者临床病理分期相关性分析
        3.18 BTK在肺癌脑转移不同阶段的表达分析
    4 讨论
    5 结论
第二部分:BTK在脑转移肺癌细胞及共培养巨噬细胞中的表达分析
    1 前言
    2 材料和方法
        2.1 主要试剂和仪器
        2.2 研究对象和分组
        2.3 实验方法
        2.4 统计学显著性分析
    3 结果
        3.1 肺癌脑转移模型建立
        3.2 肿瘤脑转移模型小鼠的体重和生存及偏瘫率分析
        3.3 慢病毒转染脑转移高致瘤性肺癌细胞BrM后的小鼠脑内成瘤
        3.4 小鼠脑转移高致瘤性肺癌细胞的纯度鉴定
        3.5 脑转移肺癌细胞增殖及Wound-healing能力分析
        3.6 BTK在脑转移瘤细胞中的表达
        3.7 BTK在与肿瘤细胞共培养的巨噬细胞中的表达
    4 讨论
    5 结论
本研究创新性的自我评价
参考文献
综述
    参考文献
攻读学位期间取得的研究成果
致谢
个人简历



本文编号：3675423