增强子的鉴定及其在肿瘤研究中的应用
发布时间:2022-09-17 19:47
增强子是一类增强靶基因转录活性的DNA顺式作用元件。但是增强子与靶基因的方向和距离不确定,大大增加了研究增强子调控的靶基因及其作用机制的困难。已有大量研究显示,增强子的突变或功能异常与疾病发生发展相关;仅有少量研究报道增强子通过促进靶基因的表达,引发癌症或产生抗药性。目前与癌症发生发展和在癌症治疗过程中抗药性产生相关的增强子尚未得到充分鉴定,这些增强子的调控机制也未得到充分解析。本文对目前可在全基因组水平上预测和鉴定增强子以及解析增强子调控机制的方法进行总结和对比,并对近几年增强子在肿瘤诊断、治疗和发生发展机制中的研究进展进行综述。期望本文为筛选与癌症发生发展相关的增强子和解析这些增强子的调控机制提供参考,为提高癌症的诊断和制定癌症的治疗策略提供新的视角。
【文章页数】:15 页
【文章目录】:
1 增强子及其特性
2 超级增强子及其特性
3 增强子的研究方法
3.1 基于ChIP-Seq技术鉴定增强子
3.1.1 基于转录因子和转录辅助因子结合位点鉴定增强子
3.1.2 基于组蛋白修饰鉴定增强子
3.2 基于DNA甲基化检测技术鉴定有活性的增强子
3.3 基于DNase-Seq、ATAC-Seq、RNA-Seq技术鉴定有活性的增强子
3.4 基于基因编辑技术研究增强子
3.4.1 CRISPR-Cas9系统在增强子研究中的应用
3.4.2 CRISPR-d Cas9系统在增强子研究中的应用
4 超级增强子的研究方法
5 增强子的应用方向
5.1 增强子在肿瘤诊断治疗上的应用潜力
5.2 eRNA在肿瘤诊断治疗上的应用潜力
5.3 超级增强子在肿瘤研究中的进展
5.3.1 超级增强子与肿瘤的关系
5.3.2 超级增强子在肿瘤治疗中的应用潜力
6 结语与展望
【参考文献】:
期刊论文
[1]DNA甲基化检测技术[J]. 杨林林,蒋涛,隋亚鑫,史文杰,宋永波,田亚平,张朋军. 标记免疫分析与临床. 2020(05)
[2]癌症液体活检新思路:数字PCR检测DNA甲基化[J]. 曹雷,郭利娟,郭晓锦,巩燕,李菲. 生物化学与生物物理进展. 2019(11)
[3]miR-150通过调节c-Myb抑制人慢性髓系白血病细胞系K562增殖[J]. 陈连香,曹丽霞. 基础医学与临床. 2019(09)
[4]增强子功能鉴定及其在农业动物中的研究进展[J]. 谢骏辉,孙艳,王昇,田小欢,曹建华. 中国细胞生物学学报. 2019(07)
[5]组蛋白修饰作为表观遗传肿瘤标志物的研究进展[J]. 肖婷,周菊,傅俊江. 西南医科大学学报. 2019(03)
[6]增强子预测及靶向测序技术研究进展[J]. 王锦,赵正伟,马丽娜,马青. 中国畜牧兽医. 2019(05)
[7]增强子劫持:研究肿瘤发生机制的新方向[J]. 汤柳笛,吴楠,金焰. 国际遗传学杂志. 2018 (06)
[8]超级增强子在肿瘤研究中的进展[J]. 吴志强,米泽云. 遗传. 2019(01)
[9]含有前列腺癌风险性SNP rs10486567位点潜在增强子座位在前列腺癌细胞中功能的研究[J]. 莫文慧,张浩琪,赵忠芳,石建党,吕万革. 南开大学学报(自然科学版). 2018(02)
[10]靶向ezrin增强子关键区的CRISPR/Cas9载体的构建[J]. 郭晓龙,张青峰,野庆松,莫镇涛,李文娜,高书颖. 生物学杂志. 2017(06)
硕士论文
[1]肿瘤特异超级增强子PLAU-SE及其组分的鉴定和功能研究[D]. 王冠儒.哈尔滨工业大学 2018
本文编号:3679837
【文章页数】:15 页
【文章目录】:
1 增强子及其特性
2 超级增强子及其特性
3 增强子的研究方法
3.1 基于ChIP-Seq技术鉴定增强子
3.1.1 基于转录因子和转录辅助因子结合位点鉴定增强子
3.1.2 基于组蛋白修饰鉴定增强子
3.2 基于DNA甲基化检测技术鉴定有活性的增强子
3.3 基于DNase-Seq、ATAC-Seq、RNA-Seq技术鉴定有活性的增强子
3.4 基于基因编辑技术研究增强子
3.4.1 CRISPR-Cas9系统在增强子研究中的应用
3.4.2 CRISPR-d Cas9系统在增强子研究中的应用
4 超级增强子的研究方法
5 增强子的应用方向
5.1 增强子在肿瘤诊断治疗上的应用潜力
5.2 eRNA在肿瘤诊断治疗上的应用潜力
5.3 超级增强子在肿瘤研究中的进展
5.3.1 超级增强子与肿瘤的关系
5.3.2 超级增强子在肿瘤治疗中的应用潜力
6 结语与展望
【参考文献】:
期刊论文
[1]DNA甲基化检测技术[J]. 杨林林,蒋涛,隋亚鑫,史文杰,宋永波,田亚平,张朋军. 标记免疫分析与临床. 2020(05)
[2]癌症液体活检新思路:数字PCR检测DNA甲基化[J]. 曹雷,郭利娟,郭晓锦,巩燕,李菲. 生物化学与生物物理进展. 2019(11)
[3]miR-150通过调节c-Myb抑制人慢性髓系白血病细胞系K562增殖[J]. 陈连香,曹丽霞. 基础医学与临床. 2019(09)
[4]增强子功能鉴定及其在农业动物中的研究进展[J]. 谢骏辉,孙艳,王昇,田小欢,曹建华. 中国细胞生物学学报. 2019(07)
[5]组蛋白修饰作为表观遗传肿瘤标志物的研究进展[J]. 肖婷,周菊,傅俊江. 西南医科大学学报. 2019(03)
[6]增强子预测及靶向测序技术研究进展[J]. 王锦,赵正伟,马丽娜,马青. 中国畜牧兽医. 2019(05)
[7]增强子劫持:研究肿瘤发生机制的新方向[J]. 汤柳笛,吴楠,金焰. 国际遗传学杂志. 2018 (06)
[8]超级增强子在肿瘤研究中的进展[J]. 吴志强,米泽云. 遗传. 2019(01)
[9]含有前列腺癌风险性SNP rs10486567位点潜在增强子座位在前列腺癌细胞中功能的研究[J]. 莫文慧,张浩琪,赵忠芳,石建党,吕万革. 南开大学学报(自然科学版). 2018(02)
[10]靶向ezrin增强子关键区的CRISPR/Cas9载体的构建[J]. 郭晓龙,张青峰,野庆松,莫镇涛,李文娜,高书颖. 生物学杂志. 2017(06)
硕士论文
[1]肿瘤特异超级增强子PLAU-SE及其组分的鉴定和功能研究[D]. 王冠儒.哈尔滨工业大学 2018
本文编号:3679837
本文链接:https://www.wllwen.com/yixuelunwen/zlx/3679837.html
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