基于高通量测序的食管鳞癌环状RNA组学分析及circFNDC3B功能研究

发布时间：2023-10-03 19:06

　　背景:食管癌是中国发病率最高的5大肿瘤以及肿瘤相关死亡原因之一,在中国食管癌的主要病理类型是食管鳞状细胞癌。环状RNA是一类由前体mRNA通过反向剪切形成的,近年来发现的在真核生物中广泛表达的特殊的环形内源性RNA。与经典的线性的RNA不同,环状RNA形成不具有典型的5’帽子和3’多聚腺苷酸尾巴的头尾相接的共价闭环结构,因此不易受RNA酶消化,比线性RNA更为稳定。得益于高通量测序技术的发展,环状RNA陆续在各物种、细胞及临床样本中被鉴定出来。然而,在食管鳞状细胞癌中,尚缺乏基于高通量测序的环状RNA表达谱分析;同时关于环状RNA在食管鳞状细胞癌中调控功能的研究依然缺乏充分认识,有待进一步的深入研究。因此,本研究期望通过高通量测序的方法探索食管鳞状细胞癌中环状RNA的表达谱并对其肿瘤生物学功能进行初步探讨。方法:收集食管鳞状细胞癌患者癌及癌旁组织样本提取总RNA。通过去除rRNA、线性RNA的方法构建环状RNA测序cDNA文库。采用RNA-seq转录组测序方法检测环状RNA的表达。测序结果使用CIRI及BAW预测潜在环状RNA。差异表达环状RNA进行聚类、GO和KEGG分析。CircF...

【文章页数】：144 页

【学位级别】：博士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
第一章 前言
    1、食管癌的流行病学及危害
    2、circRNA生物学过程及其功能
第二章 食管鳞癌组织circRNA测序及分析
    1 引言
    2 材料和方法
    3 结果
    4 讨论
    5 小结
第三章 circFNDC3B在食管鳞癌组织中的表达
    1 引言
    2 材料和方法
    3 结果
    4 讨论
    5 小结
第四章 circFNDC3B对食管鳞癌细胞生物学功能的影响
    1 引言
    2 材料和方法
    3 结果
    4 讨论
    5 小结
参考文献
攻读学位期间成果
附录
    参考文献
英文缩略词表
致谢



本文编号：3850470