CD28基因多态性与结直肠癌易感性的关联研究

发布时间：2017-06-23 17:14

  本文关键词：CD28基因多态性与结直肠癌易感性的关联研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的:对人群中CD28等位基因位点上rs3116496及rs3181098多态性与结直肠癌易感性的关系进行分析研究。方法:本实验采用病例-对照研究。选取2013年2月-2015年2月,就诊于河北医科大学第四医院符合该实验条件的对象,其中结肠癌病人102例、直肠癌病人138例、正常人群147例。在患者知情同意的情况下,收集患者肿瘤疾病家族史和性别、年龄、吸烟史、饮酒史一般情况等信息。在无菌操作原则下采集5ml外周静脉血,应用蛋白酶K消化-氯化钠饱和盐析法提取白细胞中脱氧核糖核酸DNA;应用限制性片段长度多态性聚合酶链反应技术(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)对CD28基因rs3116496、rs3181098两个SNP单核苷酸多态性位点的基因型及等位基因进行检测分析。对实验结果的统计学分析使用SPSS13.0版软件包(SPSS Company,Chicago,Illinois,USA):t检验方法分析病例-对照组间年龄差异;χ2检验方法分析病例-对照组间的性别差异、等位基因分布频率及基因型分布频率;logistic回归方法计算OR相对风险度的比值比(odds ratio,OR)和95%CI可信区间(confidence interval,CI);Hardy-Weinberg检验病例-对照组间基因型分布频率的遗传连锁平衡。对CD28基因的rs3116496 C/T、rs3181098 A/G两个SNPs位点应用2LD软件和EH软件进行联合分析,显著性差异的标准取P0.05。结果:1对照组中rs3116496 C/T、rs3181098 A/G基因型分布频率均符合Hardy-Weinberg遗传连锁平衡(P0.05)。2结直肠癌发病风险与rs3116496 C/T基因多态性在正常对照组中CD28基因rs3116496 C/T位点上等位基因C和T分布频率为6.1%和93.9%;在直肠癌组中等位基因C和T分布频率为11.6%和88.4%;在结肠癌组中等位基因C和T分布频率为10.8%和89.2%。直肠癌组及结肠癌组分别与正常对照组相比,差异均具有统计学意义(P分布为0.021,0.049)。TT、CT两种基因型在直肠癌组中的分布频率分别为78.1%和21.9%;TT、CT两种基因型在结肠癌组中分布频率分别为82%和18%;TT、CT两种基因型在正常对照组中分布频率分别为87.8%和12.2%。TT、CT两种基因型在直肠癌组与正常对照组相比,差异具有统计学意义(P为0.03)。而TT、CT两种基因型在结肠癌组与与正常对照组相比,差异无统计学意义(P为0.208)。与携带TT基因型相比,携带CT基因型罹患直肠癌的发病风险显著增加(OR=2.009,95%CI=1.062-3.803)。3结直肠癌发病风险与rs3181098A/G基因多态性在直肠癌组中CD28基因rs3181098A/G位点上等位基因G和A分布频率分别为78.6%和21.4%;在结肠癌组中等位基因G和A分布频率分别为76.5%和23.5%;在正常对照组中等位基因G和A分布频率分别为75.9%和24.1%。直肠癌组及结肠癌组等位基因G和A分布频率分别与正常对照组等位基因G和A分布频率相比,差异均无统计学意义(P分别为0.430和0.873)。GG、AG两种基因型在直肠癌中的分布频率分别为64.4%和35.6%;GG、AG两种基因型在结肠癌中分布频率分别为62.5%和37.5%;而GG、AG两种基因型在正常对照组中分布频率则为62.8%和37.2%。直肠癌组及结肠癌组GG、AG两种基因型分布频率分别与正常对照组对比,差异均无统计学意义(P分别为0.783和0.966)。与携带GG基因型相比,携带AG基因型罹患结直肠癌的风险未见增高无统计学意义(OR=0.932,95%CI=0.567-1.533;OR=1.012,95%CI=0.590-1.735).4采用EH软件和2LD软件对CD28基因的rs3116496 C/T、rs3181098 A/G两个SNPs位点进行联合分析。在结直肠癌病例组中rs3116496 C/T、rs3181098 A/G之间存在连锁不平衡关系(D'=0.994),其中在正常健康组出现频率最高的单体型是rs3116496T-rs3181098G(69.7%),其次为rs3116496T-rs3181098A(24.1%)、rs3116496C-rs3181098G(6.1%)和rs3116496C-rs3181098A(0%)。单体型为rs3116496C-rs3181098A、rs3116496C-rs3181098G可增加结直肠癌发病风险(OR=86.208,95%CI=4.834-1537.469;OR=1.806,95%CI=1.032-3.519);而rs3116496T-rs3181098A(OR=0.864,95%CI=0.612-1.219)、rs3116496T-rs3181098G(OR=0.889,95%CI=0.649-1.216)单体型可能与结直肠癌发病风险无关。结论:1 CD28基因rs3116496 C/T位点的多态性可能与我国北方结直肠癌易感性相关:rs3116496等位基因C增加了结直肠癌的发病风险;与TT相比CT基因型增加了直肠癌的发病风险。2 CD28基因rs3181098A/G位点的多态性可能与我国北方结直肠癌易感性无关。3在结直肠癌中CD28基因的rs3116496 C/T、rs3181098A/G两个位点之间存在连锁不平衡现象。单体型rs3116496C-rs3181098A、rs3116496C-rs3181098G可增加结直肠癌发病风险。
【关键词】：结直肠癌(CRC) CD28 单核苷酸多态性(SNP) 遗传易感性
【学位授予单位】：河北医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R735.34
【目录】：

• 中文摘要4-7
• 英文摘要7-10
• 前言10-12
• 材料与方法12-19
• 结果19-22
• 附图22-25
• 附表25-27
• 讨论27-30
• 结论30-31
• 参考文献31-35
• 综述 CD28与肿瘤的研究进展35-44
• 参考文献41-44
• 致谢44-45
• 个人简历45

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本文编号：475760