鼻咽癌差异miRNAs表达谱研究

发布时间：2017-07-25 14:05

  本文关键词：鼻咽癌差异miRNAs表达谱研究

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【摘要】：[目的]:通过miRNA芯片技术获得鼻咽癌组织与鼻咽部慢性炎性组织的miRNAs差异表达谱;通过qRT-PCR技术验证鼻咽癌组织及鼻咽癌细胞中两个差异miRNAs的表达水平;生物信息学分析两个差异miRNAs所涉及的信号通路。[方法]:收集鼻咽癌组织及鼻咽部慢性炎性组织,提取RNA,检测总RNA纯度,通过miRNA芯片获得鼻咽癌组织和鼻咽部慢性炎性组织中差异表达的miRNAs;在鼻咽部慢性炎性组织与鼻咽癌组织,人类永生化鼻咽粘膜上皮细胞NP69、鼻咽癌细胞6-10B、5-8F、CNE1、CNE2中,通过qRT-PCR技术检测miR-205和miR-34c-3p的表达水平,并与基因芯片结果进行比较;生物信息学分析获得的差异miRNAs所涉及的信号通路。[结果]:1.通过miRNA基因芯片获得了鼻咽癌的差异miRNAs表达谱,芯片结果显示了133个差异表达的miRNAs,其中鼻咽癌组织中下调的miRNAs有31个,上调的miRNAs有102个,其中,miR-205的上调倍数最大,miR-34c-3p的下调倍数最大。2.miR-205、miR-34c-3p在鼻咽癌组织和鼻咽部慢性炎性组织中的表达的相差倍数分别是5.458和-3.098倍,qRT-PCR与基因芯片结果方向一致。3.miR-205在不同分化和转移的鼻咽癌细胞中,其表达水平高于NP69细胞,差异具有显著性意义(p0.01)。miR-205表达水平在高转移细胞株5-8F中高于低转移细胞株6-10B,在低分化细胞株CNE2中高于高分化细胞株CNE1(p0.01)。4.miR-34c-3p在不同分化和转移的鼻咽癌细胞中,其表达水平低于NP69细胞,差异均有显著性意义(p0.01)。miR-34c-3p表达水平在高转移细胞株5-8F和低转移细胞株6-10B中表达水平无显著性差异(p0.05),在低分化细胞株CNE2中高于高分化细胞株CNE1(p0.01)。5.差异miRNAs调控的靶基因当中,所涉及到的信号通路主要包括:MAPK,Focaladhesion,Insulin,Neurotrophin,ErbB,Axonguidance。其中,MAPK信号通路与鼻咽癌发生发展关系密切。[结论]:1.获得鼻咽癌组织和鼻咽部慢性炎性组织中差异表达的miRNAs表达谱,其中上调的有102个,下调的有31个。2.miR-205和miR-34c-3p的表达水平在鼻咽癌组织与细胞中的表达水平与基因芯片所获得的结果方向一致,芯片结果是可靠的。3.miR-205的上调与miR-34c-3p的下调在鼻咽癌的发生发展中起了重要作用。4.miR-205表达与鼻咽癌分化和转移有关,miR-34c-3p表达与鼻咽癌分化有关,而和转移无关。
【关键词】：鼻咽癌 miRNA 差异表达谱 miR-205 miR-34c-3p
【学位授予单位】：南华大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R739.63
【目录】：

• 摘要5-7
• Abstract7-10
• 主要缩略英文索引10-14
• 第1章 前言14-18
• 1.1 鼻咽癌发病与诊疗现状14
• 1.2 miRNA与肿瘤关系14-15
• 1.3 差异miRNAs芯片在肿瘤研究中作用15-16
• 1.4 研究内容16-18
• 第2章 材料与方法18-28
• 2.1 材料18-21
• 2.2 实验方法21-28
• 第3章 结果28-46
• 3.1 鼻咽癌组织和鼻咽部慢性炎性组织的总RNA的抽提过程28-29
• 3.2 基因芯片检测差异表达miRNAs29-33
• 3.3 qRT-PCR检测miR-205，miR-34c-3p在组织中的表达水平33-34
• 3.4 qRT-PCR检测miR-205，miR-34c-3p在细胞中的表达水平34-38
• 3.5 差异表达miRNAs的生物信息学分析38-46
• 第4章 讨论46-50
• 4.1 miRNA在鼻咽癌中的研究现状46-47
• 4.2 miR-205与鼻咽癌的关系47-48
• 4.3 miR-34c-3p的研究进展48
• 4.4 差异miRNAs的功能分析48-50
• 第5章 结论50-52
• 参考文献52-58
• 文献综述58-66
• 参考文献62-66
• 攻读学位期间的科研成果66-68
• 致谢68-70
• 附表70-75

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1 ;Impact of tiny miRNAs on cancers[J];World Journal of Gastroenterology;2007年04期

2 宋宝;宋现让;刘杰;魏玲;;miRNAs及其靶基因的识别[J];基础医学与临床;2007年09期

3 ;放疗和miRNAs两者关系的研究进展(英文)[J];Chinese-German Journal of Clinical Oncology;2012年05期

4 王宁;黄辰;姚嘉宜;艾婷;李围围;付学海;宋丽萍;;肺癌相关miRNAs研究进展[J];现代肿瘤医学;2012年05期

5 ;Identification of deregulated miRNAs and their targets in hepatitis B virus-associated hepatocellular carcinoma[J];World Journal of Gastroenterology;2012年38期

6 William CS CHO;南娟;;miRNAs作为癌症预测和预后标志物的巨大潜能[J];中国肺癌杂志;2013年01期

7 李长贵;纪艳;;miRNAs和内分泌疾病研究进展[J];中华医学信息导报;2006年21期

8 William CS CHO;南娟;丁燕;;miRNAs在肺癌中的作用[J];中国肺癌杂志;2009年12期

9 Wen Luo,;Qinghua Nie;Xiquan Zhang;;MicroRNAs Involved in Skeletal Muscle Differentiation[J];遗传学报;2013年03期

10 ;Small but influential:the role of microRNAs on gene regulatory network and 3′UTR evolution[J];遗传学报;2009年01期

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1 ;A potential role for Chlamydomonas miRNAs in response to environmental changes[A];中国遗传学会植物遗传和基因组学专业委员会2009年学术研讨会论文摘要汇编[C];2009年

2 Ping Xuan;Maozu Guo;Yangchao Huang;;MaturePred:Efficient Identification of MicroRNAs within Novel Plant Pre-miRNAs[A];第五届全国生物信息学与系统生物学学术大会论文集[C];2012年

3 Zhen-Dong Xiao;Li-Ting Diao;Jian-Hua Yang;Hui Xu;Mian-Bo Huang;Yong-Jin Deng;Hui Zhou;Liang-Hu Qu;;Systematical identification of cis-elements orchestrating the expressions of miRNAs in humans[A];生命的分子机器及其调控网络——2012年全国生物化学与分子生物学学术大会摘要集[C];2012年

4 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];2011医学科学前沿论坛第十二届全国肿瘤药理与化疗学术会议论文集[C];2011年

5 任波;马迪;李毅;;地高辛标记探针结合化学发光技术快速灵敏检测植物总RNA中的miRNAs方法[A];中国植物病理学会2005年学术年会暨植物病理学报创刊50周年纪念会论文摘要集[C];2005年

6 任波;马迪;李毅;;地高辛标记探针结合化学发光技术快速灵敏检测植物总RNA中的miRNAs方法[A];中国植物病理学会2005年学术年会暨植物病理学报创刊50周年纪念会论文集[C];2005年

7 戚鹏;韩金祥;鲁艳芹;王传玺;栾中华;卜范峰;;病毒编码的miRNAs:基因表达新的调控因子[A];山东省药学会2006年生化与生物技术药物学术研讨会论文集[C];2006年

8 ;Bioinformatic identification and expression analysis of new microRNAs from Medicago truncatula[A];华东六省一市生物化学与分子生物学会2008年学术交流会论文摘要汇编[C];2008年

9 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];中华医学会肿瘤学分会第七届全国中青年肿瘤学术会议——中华医学会肿瘤学分会“中华肿瘤 明日之星”大型评选活动暨中青年委员全国遴选论文汇编[C];2011年

10 ;miRNAs involved in Tau expression of BMSCs induced neurons[A];中国神经科学学会第九届全国学术会议暨第五次会员代表大会论文摘要集[C];2011年

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1 江尚;特异性miRNAs与前列腺癌发病密切相关[N];中国医药报;2007年

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1 陈健德;新生儿脓毒症miRNAs表达谱及其免疫调节作用研究[D];复旦大学;2014年

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3 成鹰;大肠杆菌和布鲁氏菌脂多糖刺激条件下巨噬细胞差异表达miRNAs的鉴定及其作用机制[D];海南大学;2014年

4 王奕;MiRNAs在白癜风外周血单个核细胞中的表达及miR-3940-5p对T细胞作用机制的研究[D];山东大学;2015年

5 陈科;小鼠子宫内膜mRNAs和miRNAs时空表达与胚胎着床的关系及SPOP对基质细胞蜕膜化的影响[D];重庆医科大学;2015年

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本文编号：571679