MicroRNA生物合成酶单核苷酸多态性与结直肠癌发病风险的关系

发布时间：2017-07-29 18:09

  本文关键词：MicroRNA生物合成酶单核苷酸多态性与结直肠癌发病风险的关系

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【摘要】：目的:结直肠癌是最常见的恶性肿瘤之一,近年来在包括中国在内的亚洲国家,其发病率与死亡率均已呈逐年上升趋势。Micro RNA(mi RNA)是一类广泛存在于真核生物中,长度约为22个核苷酸的小型非编码RNA,mi RNA在许多生理病理过程中,如:胚胎发育,细胞的分化、增殖、凋亡以及肿瘤发展和激素分泌等过程都扮演着不可忽视的作用。单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphisms,SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异引发的DNA的多态性变化。Mi RNA相关单核苷酸多态性(mi RNA-related single nucleotide polymorphisms,mi R-SNPs),是指导致mi RNA基因调控功能紊乱的一类功能型SNP的总称,其可调节mi RNA及靶基因的表达,从而影响肿瘤发生风险、治疗效果及预后。Mi R-SNPs包括:mi RNA核酸序列SNP,mi RNA生物合成酶SNP和mi RNA结合位点SNP。Mi RNA生物合成酶SNP与人类肿瘤发生风险关系密切,但关于其与结直肠癌关系的研究甚少。本研究对生物合成酶XPO5(rs11077),RAN(rs14035),Dicer(rs3742330),TNRC6B(rs9623117),GEMIN3(rs197412),GEMIN4(rs2740348)的SNP进行测序分析,结合病例-对照研究,寻找与结直肠癌发生风险相关的特异SNP位点,筛查易患结直肠癌的高危人群。方法:1研究对象:结直肠癌组患者为2006年1月~2008年12月间,在河北医科大学第四医院外科住院的手术患者,经内镜检查、组织病理确诊为结直肠癌,并行结直肠癌根治手术。结直肠癌组137例抗凝静脉血标本,均取自结直肠癌患者术前静脉血样;对照组134例抗凝静脉血标本,均来自2013年10月~2014年10月间,在河北医科大学第四医院体检的正常人,详细记录体检资料,并除外与结直肠癌相关的疾病,取静脉血样。2基因组DNA提取:用DNA纯化试剂盒(Promega,Madison,WI,USA)提取静脉血标本的基因组DNA,提取后置于4℃恒温冰箱中保存备用。3基因组DNA扩增及mi R-SNP筛查:在NCBI数据库中查找与6个mi RNA生物合成酶相关SNP位点对应的目的基因,设计PCR扩增引物,用PCR预混试剂盒进行扩增,PCR产物经琼脂糖凝胶电泳证实后,送往上海捷瑞生物工程技术服务有限公司用聚合酶链反应-连接酶检测反应(Polymerase Chain Reaction-ligase detection reaction,PCR-LDR)方法对XPO5(rs11077),RAN(rs14035),Dicer(rs3742330),TNRC6B(rs9623117),GEMIN3(rs197412),GEMIN4(rs2740348)的SNP位点进行检测。4统计分析:采用t检验(student t-test)比较计量资料,采用χ2检验(Pearson Chi-Square test)对结直肠癌组和对照组的计数资料如性别、吸烟情况、饮酒情况、肥胖情况进行比较。采用χ2检验对结直肠癌组和对照组的生物合成酶XPO5(rs11077),RAN(rs14035),Dicer(rs3742330),TNRC6B(rs9623117),GEMIN3(rs197412),GEMIN4(rs2740348)的SNP位点基因型频率进行分析。所有数据均采用SPSS17.0(SPSS Inc.,Chicago,IL,USA)统计软件进行统计分析,P0.05被认为有统计学意义。结果:1对结直肠癌组与对照组的年龄、性别进行比较,结果显示两组年龄(t=1.206,P=0.229)、性别(χ2=2.478,P=0.115)差异无统计学意义(P0.05),说明结直肠癌组与对照组均衡可比。2对结直肠癌组与对照组吸烟情况、饮酒情况、肥胖情况进行比较,结果显示两组吸烟情况(χ2=0.588,P=0.293)、饮酒情况(χ2=0.694,P=0.155)、肥胖情况(χ2=1.503,P=0.220),两组间差异无统计学意义(P0.05)。3对mi RNA生物合成酶6个位点的SNP分布频率分析显示,在结直肠癌组与对照组之间,rs11077、rs14035、rs9623117、rs2740348多态性位点进行各组间比较,发现这四个位点SNP分布频率无明显差异。而对于Dicer基因的多态位点rs3742330,AA、AG+GG基因型在结直肠癌组中出现的频率是55.5%和45.5%,而在对照组中出现的频率为37.3%和62.7%,对于rs3742330位点AA基因型携带者相对AG+GG基因型携带者发病风险为2.09倍(odds ratio,2.09;95%CI,1.29-3.40;P=0.003);对于GEMIN3基因的多态位点rs197412,TT、CT+CC基因型在结直肠癌组出现频率为54.7%和45.3%,在对照组出现频率为40.3%和59.7%,TT基因型携带者相对CT+CC基因型携带者具有更高的结肠癌发病风险(odds ratio,1.79;95%CI,1.11-2.90;P=0.017)。结论:1在结直肠癌组与对照组之间,Dicer基因的多态位点rs3742330的SNP和GEMIN3基因的多态位点rs197412的SNP分布频率存在差异,此两个位点可能是与结直肠癌发生相关的SNP位点。2 Mi RNA生物合成酶的单核苷酸多态性可以作为预测结直肠癌发病风险的分子标志物。
【关键词】：mi RNA相关单核苷酸多态性 结直肠癌 生物合成酶 GEMIN3 Dicer
【学位授予单位】：河北医科大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R735.34
【目录】：

• 中文摘要4-7
• 英文摘要7-10
• 英文缩写10-11
• 前言11-12
• 材料与方法12-21
• 结果21-23
• 附图23-32
• 附表32-34
• 讨论34-37
• 结论37-38
• 参考文献38-42
• 综述MicroRNA与结直肠癌关系的研究进展42-54
• 参考文献48-54
• 致谢54-55
• 个人简历55-56

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本文编号：590421