基于液相色谱质谱联用技术的胃癌代谢组学研究

发布时间：2017-09-03 00:16

  本文关键词：基于液相色谱质谱联用技术的胃癌代谢组学研究

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【摘要】：目的： 应用液相色谱-质谱联用技术(LC-MS)对胃癌患者和健康人的血液和尿液标本分别进行检测，找出胃癌患者和健康人群之间具有差异的代谢产物，从而寻找与胃癌相关的生物标志物。 方法： 1、样本处理：采用高速离心(14000rpm,5min)等对血液、尿液样本进行处理，取上清供高效液相色谱质谱联用仪检测分析。 2、LC-MS分析：采用高效液相色谱飞行时间质谱联用仪（HPLC-TOFMS）对样本进行检测，得到胃癌患者和健康人血液、尿液的代谢图谱和相关数据进行数据处理。 3、数据处理：采用主成分分析(principal component analysis，PCA)、t检验、偏最小二乘判别分析(partial least square-discriminant analysis,PLS-DA)、分层聚类分析（hierarchical cluster analysis, HCA）等统计方法对得到的实验数据进行分析，分析胃癌患者和健康人之间的代谢图谱差异，找到两者间有意义的差异代谢产物，并且验证这些代谢产物对胃癌组与健康人的判别能力。 结果： 1、在血液样本的研究中，PCA得分图的结果显示胃癌患者和健康人可以很好的区分开来，通过t检验、聚类分析、偏最小二乘判别分析等方法筛选出具有差异的代谢产物，将筛选出的代谢产物在HMDB数据库中进行结构鉴定，正负离子模式下一共找出21种差异代谢产物。最后绘制ROC曲线，找出14种重要差异代谢产物，结果显示这些重要差异代谢产物对胃癌患者与健康人的区分有很好的灵敏度。 2、在尿液样本的研究中，PCA得分图的结果显示胃癌患者和健康人可以很好的区分开来，，通过t检验、聚类分析、偏最小二乘判别分析等方法筛选出具有差异的代谢产物，将筛选出的代谢产物在HMDB数据库中进行结构鉴定，正负离子模式下一共找出27种差异代谢产物。最后绘制ROC曲线，找出3种重要差异代谢产物，结果显示这些重要差异代谢产物对胃癌患者与健康人的区分有很好的灵敏度。 结论： 通过对胃癌患者和健康人的血液、尿液分别进行液相色谱质谱联用技术的分析，得到血液中21种差异代谢产物，其中14种重要差异代谢产物，尿液中27种差异代谢产物，其中有3种重要差异代谢产物，可以很好的将胃癌与健康人进行区分，可能为潜在的生物标志物。血、尿中均发现Quinone以及Acetyl-N-formyl-5-methoxykynure-namine，可能为胃癌特异的代谢产物。
【关键词】：胃癌 代谢组学 生物标志物 液相色谱质谱联用技术 主成分分析
【学位授予单位】：吉林大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：R735.2
【目录】：

• 中文摘要4-6
• Abstract6-10
• 英文缩略词10-11
• 引言11-13
• 第1章 综述13-20
• 1.1 分析技术13-15
• 1.1.1 核磁共振（NMR）13-14
• 1.1.2 质谱（MS）14-15
• 1.2 数据处理方法15-16
• 1.2.1 非监督方法16
• 1.2.2 有监督方法16
• 1.3 在临床中的应用16-18
• 1.3.1 肿瘤的早期诊断16-17
• 1.3.2 评估疗效17-18
• 1.3.3 在其他疾病中的应用18
• 1.4 展望18-20
• 第2章 基于液相色谱-质谱联用技术胃癌血液代谢组学研究20-38
• 2.1 引言20
• 2.2 实验部分20-24
• 2.2.1 实验流程图20
• 2.2.2 实验材料、试剂与仪器20-21
• 2.2.3 样本来源21-22
• 2.2.4 样本处理22
• 2.2.5 分析条件22-23
• 2.2.6 数据处理方法23-24
• 2.3 实验结果24-36
• 2.3.1 LC-MS 总离子流图24-26
• 2.3.2 数据分析结果26-36
• 2.4 小结与讨论36-38
• 第3章 基于液相色谱-质谱联用技术胃癌尿液代谢组学研究38-57
• 3.1 引言38
• 3.2 实验部分38-43
• 3.2.1 实验流程图38-39
• 3.2.2 实验材料、试剂与仪器39
• 3.2.3 样本来源39-40
• 3.2.4 样本处理40
• 3.2.5 分析条件40-41
• 3.2.6 数据处理方法41-43
• 3.3 实验结果43-55
• 3.3.1 尿液 LC-MS 总离子流图43-44
• 3.3.2 数据分析结果44-55
• 3.3.3 血、尿中共同的差异代谢产物55
• 3.4 小结与讨论55-57
• 第4章 总结与展望57-58
• 4.1 总结57
• 4.2 展望57-58
• 参考文献58-65
• 作者简介及在学期间所取得的科研成果65-66
• 致谢66

【参考文献】

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1 周红光;陈海彬;俞晓忆;王瑞平;吴勉华;;代谢组学在恶性肿瘤早期诊断中的应用[J];吉林大学学报(医学版);2013年01期

本文编号：781730