转录因子c-Myc对肝癌易感基因EPB41的表达调控与EPB41的生物学功能研究
发布时间:2017-09-03 23:37
本文关键词:转录因子c-Myc对肝癌易感基因EPB41的表达调控与EPB41的生物学功能研究
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【摘要】:肝癌作为一种在我国发病率较高的恶性肿瘤,其预后效果极差。转录因子c-Myc在肝癌的发生发展过程中发挥了至关重要的作用。本课题通过分析肝癌HepG2细胞系的c-Myc全基因组ChIP-chip数据,最终选取EPB41基因翻译起始位点上游259 bp处的单核苷酸多态性(SNP)rs157224为研究对象。确定它与中国人群肝癌发病风险相关,并且T等位基因为风险位点。通过转录因子结合位点预测分析与SNP功能研究等一系列体内外实验,确定肝癌相关EPB41基因的SNP rs157224影响转录因子c-Myc的结合。证实该位置的G/T多态性会影响转录因子c-Myc与EPB41基因调控区是否结合,从而影响c-Myc对EPB41蛋白的表达调控作用。肝癌易感TT基因型携带者的EPB41基因表达下调,引起肝癌细胞的恶性增殖和侵袭转移。本课题首次发现肝癌中EPB41基因的抑癌作用。一系列分子及细胞生物学实验显示,EPB41基因能有效抑制肝癌细胞的增殖、克隆形成以及侵袭转移,并且促进肝癌细胞的凋亡从而达到抑制癌症发生发展的作用。本课题首次揭示了全基因组范畴内的转录因子c-Myc结合位点中的SNP,并试图说明该SNP的功能。在发现一个肝癌中全新的抑癌基因的同时,为进一步深入揭示肝癌恶性转化的分子机理提供了新的线索,进而为肝癌的早期诊断和肝癌的治疗靶标发现提供了新的思路。
【关键词】:肝细胞癌 c-Myc 转录因子 单核苷酸多态性 rs157224 EPB4
【学位授予单位】:北京化工大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2016
【分类号】:R735.7
【目录】:
- 摘要4-6
- ABSTRACT6-13
- 第一章 绪论13-24
- 1.1 肝细胞癌简介13-14
- 1.2 c-Myc的研究进展14-20
- 1.2.1 c-Myc的生物学特征14-15
- 1.2.2 c-Myc蛋白及其转录因子特性15-19
- 1.2.3 与c-Myc结合的靶点相关研究成果19-20
- 1.3 EPB41的研究进展20-21
- 1.3.1 EPB41概述20
- 1.3.2 EPB41蛋白与肿瘤20-21
- 1.4 单核苷酸多态性21-22
- 1.4.1 SNP简介21
- 1.4.2 SNP的研究意义和方法21-22
- 1.5 立题背景与研究意义22-24
- 第二章 研究方法24-48
- 2.1 实验材料24-27
- 2.1.1 细胞系及菌种24
- 2.1.2 实验仪器24-25
- 2.1.3 实验耗材25
- 2.1.4 重要实验试剂25-27
- 2.1.5 探针或引物27
- 2.2 实验方法—rs157224对c-Myc的结合与调控功能的影响27-42
- 2.2.1 利用生物信息学手段筛选相关SNP27-28
- 2.2.2 多种肝癌细胞系rs157224位点的基因型28-32
- 2.2.3 rs157224位点对EPB41基因与c-Myc结合的影响32-39
- 2.2.4 c-Myc与EPB41相互调控作用39-42
- 2.3 实验方法—肝癌相关EPB41基因功能的研究42-48
- 2.3.1 不同细胞系EPB41本底表达量研究42
- 2.3.2 EPB41对肝癌细胞增殖的影响42-45
- 2.3.3 EPB41对肝癌细胞凋亡的影响45
- 2.3.4 EPB41对肝癌细胞迁移侵袭的影响45-46
- 2.3.5 抑癌基因EPB41在肝癌组织样本中的验证46-48
- 第三章 研究结果48-73
- 3.1 rs157224对c-Myc的结合与调控功能的影响48-59
- 3.1.1 利用生物信息学手段筛选相关SNP48-49
- 3.1.2 确定多种肝癌细胞系rs157224位点的基因型49-51
- 3.1.3 rs157224对EPB41基因与c-Myc结合的影响51-57
- 3.1.4 c-Myc与EPB41相互调控作用57-59
- 3.2 肝癌相关EPB41基因功能的研究59-73
- 3.2.1 不同细胞系EPB41本底表达量研究60
- 3.2.2 EPB41对肝癌细胞增殖的影响60-64
- 3.2.3 EPB41对肝癌细胞凋亡的影响64-66
- 3.2.4 EPB41对肝癌细胞迁移侵袭的影响66-70
- 3.2.5 抑癌基因EPB41在肝癌组织中的验证70-73
- 第四章 研究结论与创新点73-74
- 参考文献74-78
- 致谢78-79
- 研究成果及学术论文79-80
- 作者和导师简介80-81
- 北京化工大学硕士研究生学位论文答辩委员会决议书81-82
【参考文献】
中国期刊全文数据库 前4条
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,本文编号:788061
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