肿瘤转移相关基因1（MTA1）对mRNA可变剪接调控的作用研究

发布时间：2017-09-13 09:34

  本文关键词：肿瘤转移相关基因1（MTA1）对mRNA可变剪接调控的作用研究

  更多相关文章： 转移相关基因1 可变剪接 高通量测序

【摘要】：目的mRNA可变剪接是高等生物生命活动复杂性和多样性的基础。目前对mRNA转录后调控的研究尚处于初期阶段。我们的研究显示转移相关基因1(MTA1)结合了大量RNA调控蛋白,在nRNA转录至翻译全过程的各个部位均有分布(核仁一核膜一胞浆—核糖体——RNA颗粒)。基于以上线索,我们拟探索MTA1在]mRNA剪接调控中的作用及这一机制带来的下游生物学表型改变,从而更清晰的了解MTA1在肿瘤发生发展过程中的作用。方法采用大数据分析明确MTA1是否参与mRNA剪接调控过程；利用分子生物学与细胞生物学方法联合转录组测序(RNA-seq)技术确定MTA1对转录组可变剪接的影响；采用紫外交联免疫共沉淀联合高通量测序(crosslinking-immunprecipitation and high-throughput sequencing, CLIP-seq)技术及可获得的网络数据分析MTA1对mRNA进行剪接加工的可能机制及基序；利用多层次组学分析联合免疫互作技术明确MTA1在mRNA剪接加工中的生物学功能和分子机制。结果大数据分析结果表明MTA1在多种类型肿瘤的RNA剪接过程中发挥调控功能；RNA-seq获得MTA1调控下的mRNA可变剪接谱,显示MTA1具有比较广泛的mRNA可变剪接调控作用；CLIP-seq获得与MTA1相互作用的mRNA谱,显示MTA1具有广泛的RNA结合能力；多层次组学分析联合免疫互作技术筛选MTA1在RNA可变剪接调控中的关键相关分子,结果显示PTBP1与MTA1在mRNA剪接调控过程中具有协同作用。结论MTA1是一个RNA结合蛋白,在多种类型的肿瘤中具有mRNA剪接调控功能,MTA1对转录组的可变剪接状态也有比较广泛的影响。在MTA1调控下产生可变剪接的基因,其功能涉及到细胞周期、代谢调控、大分子转运、RNA剪接等领域。MTAl很可能以间接结合pre-mRNAs的方式广泛调控基因的可变剪接模式,该过程的实现部分依赖于PTBP1分子。
【关键词】：转移相关基因1 可变剪接 高通量测序
【学位授予单位】：北京协和医学院
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2016
【分类号】：R730.2
【目录】：

• 中英文缩略词对照5-7
• 中文摘要7-8
• Abstract8-9
• 前言9-12
• 材料与方法12-29
• 结果29-57
• 讨论57-62
• 结论62-63
• 参考文献63-66
• 基金资助66-67
• 已发表文章67-68
• 文献综述68-75
• 参考文献71-75
• 致谢75-76

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本文编号：842900