基于网络药理学的畲药“十二时辰”治疗类风湿性关节炎的机制研究
发布时间:2020-10-26 04:29
目的:分析畲药“十二时辰”治疗类风湿性关节炎(Rheumatoid Arthritis,RA)的有效成分及可能作用机制。方法:通过文献挖掘并利用TCMSP等数据库获取畲药“十二时辰”的已知化学成分和相关靶点;将获得的靶点信息与Drug Bank数据库中抗RA药物靶点进行映射,分析药物治疗RA的可能性;利用Cytoscape软件分别构建“成分-靶点”网络和“十二时辰抗RA靶点-人体蛋白”蛋白质互作(PPI)网络,分析网络拓扑结构;利用David数据库进行GO富集和KEGG分析,分析药物治疗RA的可能分子机制。结果:畲药“十二时辰”含有油酸、棕榈酸、齐墩果酸、十五烷酸等潜在抗RA化合物,潜在抗RA关键靶点为前列腺素G/H合成酶1、2和凋亡调节因子Bcl-2等; GO结果提示其治疗RA的基因功能主要体现在炎症反应、凋亡过程负调节、NF-κB转录因子活性正调节、蛋白质同源二聚化活性等方面;KEGG结果暗示主要相关信号通路有TNF、PI3K-Akt、Rheumatoid arthritis、Toll样受体和MAPK等信号通路。结论:畲药“十二时辰”可能通过多靶点、多信号途径的相互作用,抑制成纤维样滑膜细胞的异常增殖,减轻炎症反应,发挥治疗RA的作用。
【部分图文】:
另外,网络的拓扑结构分析结果表明:网络集中度为0.299,网络密度为0.038,网络异质性为1.594,最短路径为2808(67%),节点平均中介中心度为0.044,大于平均中介中心度的节点有10个。这说明“十二时辰”中含有的化合物可能作用于整个生物网络系统,而非单一作用于某一个蛋白靶点,从而提示了“十二时辰”作用的整体性和复杂性。2.4“十二时辰抗RA靶点-人体蛋白”PPI网络构建与分析
以HPRD数据库中获取的人体蛋白互作数据作为背景网络,与21个“十二时辰”抗RA靶点,构建“十二时辰抗RA靶点-人体蛋白”PPI网络,如图2所示。各靶点相应的度值见表4,根据表格可发现靶点Bcl-2、前列腺素G/H合成酶1和前列腺素G/H合成酶2的度值排名均较靠前,结合2.3进一步证实了这3个靶点在“十二时辰”治疗RA中具有重要作用。图3“十二时辰”化学成分抗RA相关靶点GO富集分析
“十二时辰”化学成分抗RA相关靶点GO富集分析
本文编号:2856493
【部分图文】:
另外,网络的拓扑结构分析结果表明:网络集中度为0.299,网络密度为0.038,网络异质性为1.594,最短路径为2808(67%),节点平均中介中心度为0.044,大于平均中介中心度的节点有10个。这说明“十二时辰”中含有的化合物可能作用于整个生物网络系统,而非单一作用于某一个蛋白靶点,从而提示了“十二时辰”作用的整体性和复杂性。2.4“十二时辰抗RA靶点-人体蛋白”PPI网络构建与分析
以HPRD数据库中获取的人体蛋白互作数据作为背景网络,与21个“十二时辰”抗RA靶点,构建“十二时辰抗RA靶点-人体蛋白”PPI网络,如图2所示。各靶点相应的度值见表4,根据表格可发现靶点Bcl-2、前列腺素G/H合成酶1和前列腺素G/H合成酶2的度值排名均较靠前,结合2.3进一步证实了这3个靶点在“十二时辰”治疗RA中具有重要作用。图3“十二时辰”化学成分抗RA相关靶点GO富集分析
“十二时辰”化学成分抗RA相关靶点GO富集分析
本文编号:2856493
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