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涉案偶蹄目动物DNA条形码构建

发布时间:2021-09-24 16:39
  【目的】利用线粒体DNA条形码标记鉴定涉案偶蹄目动物,为解决偶蹄目动物残体、制品的鉴定难题提供技术参考。【方法】对16个偶蹄目动物物种共67份样本,采用试剂盒提取DNA,扩增、测定物种的线粒体DNA的COI基因、Cyt b基因片段;在GenBank上Blast搜索进行同源性分析;利用MEGA 7.0软件分别比较这两个基因片段种内和种间遗传距离,构建系统发育树。【结果】在同源性分析中,西伯利亚狍(Capreolus pygargus)的Cyt b基因片段与GenBank中西伯利亚狍、欧洲狍(Capreolus capreolus)基因序列的同源性均为99.64%~99.82%,该片段不能区分西伯利亚狍与欧洲狍这两个近缘种。其余测序结果与数据库中参考序列一致且相似度较高。对于COI片段,种内遗传距离为0~1.4%,种间遗传距离为1.8%~18.8%。对于Cyt b基因片段种内遗传距离为0~0.5%,种间遗传距离为4.0%~15.8%。两个片段的种内遗传差异均小于种间遗传差异,存在较为明显的条形码间隔。COI和Cyt b基因片段的系统发育树中,同物种的不同个体均能形成具有较高支持度的单分支;... 

【文章来源】:南京林业大学学报(自然科学版). 2020,44(06)北大核心CSCD

【文章页数】:6 页

【部分图文】:

涉案偶蹄目动物DNA条形码构建


涉案动物的COI和Cyt b基因片段种内和种间

片段,遗传距离,物种,支持度


使用Mega7.0软件分别构建了COI和Cyt b的系统发育树(图2)。两个片段的发育树均表明,同物种的不同个体均能形成具有较高支持度的单分支,且不同物种间界限清晰,这表明两个片段均能够较好地区分物种。3 讨 论

【参考文献】:
期刊论文
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本文编号:3408087

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