涉案偶蹄目动物DNA条形码构建
发布时间:2021-09-24 16:39
【目的】利用线粒体DNA条形码标记鉴定涉案偶蹄目动物,为解决偶蹄目动物残体、制品的鉴定难题提供技术参考。【方法】对16个偶蹄目动物物种共67份样本,采用试剂盒提取DNA,扩增、测定物种的线粒体DNA的COI基因、Cyt b基因片段;在GenBank上Blast搜索进行同源性分析;利用MEGA 7.0软件分别比较这两个基因片段种内和种间遗传距离,构建系统发育树。【结果】在同源性分析中,西伯利亚狍(Capreolus pygargus)的Cyt b基因片段与GenBank中西伯利亚狍、欧洲狍(Capreolus capreolus)基因序列的同源性均为99.64%~99.82%,该片段不能区分西伯利亚狍与欧洲狍这两个近缘种。其余测序结果与数据库中参考序列一致且相似度较高。对于COI片段,种内遗传距离为0~1.4%,种间遗传距离为1.8%~18.8%。对于Cyt b基因片段种内遗传距离为0~0.5%,种间遗传距离为4.0%~15.8%。两个片段的种内遗传差异均小于种间遗传差异,存在较为明显的条形码间隔。COI和Cyt b基因片段的系统发育树中,同物种的不同个体均能形成具有较高支持度的单分支;...
【文章来源】:南京林业大学学报(自然科学版). 2020,44(06)北大核心CSCD
【文章页数】:6 页
【部分图文】:
涉案动物的COI和Cyt b基因片段种内和种间
使用Mega7.0软件分别构建了COI和Cyt b的系统发育树(图2)。两个片段的发育树均表明,同物种的不同个体均能形成具有较高支持度的单分支,且不同物种间界限清晰,这表明两个片段均能够较好地区分物种。3 讨 论
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于粪便DNA技术的鸟类物种鉴定体系研究[J]. 秦啼,王东权,曲宁新,刘帅齐,李波,柴洪亮. 野生动物学报. 2020(01)
[2]基于线粒体COI基因的马■科鱼类DNA条形码研究[J]. 王业磷,章群,邓春兴,徐示,裴丽梅,黄志基,罗纯. 海洋渔业. 2020(01)
[3]用mtDNA序列鉴定出上海海域须鲸科物种大村鲸[J]. 赵志鹏,向余劲攻,何鑫,宋晨薇,单鹍,刘文亮. 动物学杂志. 2019(04)
[4]3种鹿科动物针毛扫描电镜观察[J]. 侯森林,费宜玲,赵国清,张棒,王远瞩,刘大伟. 江苏林业科技. 2018(05)
[5]COI及cytb基因对河鲀鱼鱼种鉴定的适用性研究[J]. 李楠,王佳慧,韩春卉,张宏元,赵熙,张靖,李凤琴,江涛. 中国食品卫生杂志. 2018(01)
[6]DNA条形码分析方法研究进展[J]. 杨倩倩,刘苏汶,俞晓平. 应用生态学报. 2018(03)
[7]北京地区野生动物资源非法利用状况分析[J]. 熊小倩,尤炜轩,张玲,李又霖,李凯. 野生动物学报. 2017(03)
[8]陕西省非法贸易动物分布及现状[J]. 冯成利,冯慧,王艳. 陕西农业科学. 2012(04)
[9]DNA条形码研究进展[J]. 程希婷,王爱民,顾志峰,王嫣,战欣,石耀华. 基因组学与应用生物学. 2011(06)
[10]华南地区兽类野生动物非法贸易状况及分析[J]. 胡诗佳,彭建军,于冬梅,王利利. 四川动物. 2011(02)
本文编号:3408087
【文章来源】:南京林业大学学报(自然科学版). 2020,44(06)北大核心CSCD
【文章页数】:6 页
【部分图文】:
涉案动物的COI和Cyt b基因片段种内和种间
使用Mega7.0软件分别构建了COI和Cyt b的系统发育树(图2)。两个片段的发育树均表明,同物种的不同个体均能形成具有较高支持度的单分支,且不同物种间界限清晰,这表明两个片段均能够较好地区分物种。3 讨 论
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于粪便DNA技术的鸟类物种鉴定体系研究[J]. 秦啼,王东权,曲宁新,刘帅齐,李波,柴洪亮. 野生动物学报. 2020(01)
[2]基于线粒体COI基因的马■科鱼类DNA条形码研究[J]. 王业磷,章群,邓春兴,徐示,裴丽梅,黄志基,罗纯. 海洋渔业. 2020(01)
[3]用mtDNA序列鉴定出上海海域须鲸科物种大村鲸[J]. 赵志鹏,向余劲攻,何鑫,宋晨薇,单鹍,刘文亮. 动物学杂志. 2019(04)
[4]3种鹿科动物针毛扫描电镜观察[J]. 侯森林,费宜玲,赵国清,张棒,王远瞩,刘大伟. 江苏林业科技. 2018(05)
[5]COI及cytb基因对河鲀鱼鱼种鉴定的适用性研究[J]. 李楠,王佳慧,韩春卉,张宏元,赵熙,张靖,李凤琴,江涛. 中国食品卫生杂志. 2018(01)
[6]DNA条形码分析方法研究进展[J]. 杨倩倩,刘苏汶,俞晓平. 应用生态学报. 2018(03)
[7]北京地区野生动物资源非法利用状况分析[J]. 熊小倩,尤炜轩,张玲,李又霖,李凯. 野生动物学报. 2017(03)
[8]陕西省非法贸易动物分布及现状[J]. 冯成利,冯慧,王艳. 陕西农业科学. 2012(04)
[9]DNA条形码研究进展[J]. 程希婷,王爱民,顾志峰,王嫣,战欣,石耀华. 基因组学与应用生物学. 2011(06)
[10]华南地区兽类野生动物非法贸易状况及分析[J]. 胡诗佳,彭建军,于冬梅,王利利. 四川动物. 2011(02)
本文编号:3408087
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