法医学常用17个Y-STR的检测及其应用于群体遗传学的研究

发布时间：2017-06-08 00:01

  本文关键词：法医学常用17个Y-STR的检测及其应用于群体遗传学的研究，由笔耕文化传播整理发布。

【摘要】：目的 Y-STR是Y染色体上的短串联重复序列,由于Y染色体具有的非重组性、单体性、父系遗传等特征,使之成为研究群体遗传多样性的重要标记,被广泛应用于个体识别、亲权鉴定、基因作图以及群体遗传学、民族学等领域。目前应用Y-STR研究人类起源、进化和演变以及人群间的遗传关系已在国内外掀起热潮。蒙古族自古就生息在我国北方草原,是一个有着悠久历史的民族；然而,利用Y-STR数据推测蒙古族起源和进化的研究并不多见。因此,通过对蒙古族男性17个Y-STR的检测来研究蒙古族男性人群多态性,进而研究与其它各族群之间的群体遗传学关系就显得尤为重要。本研究期望通过收集中国不同省份、不同民族的Y-STR基因座频率数据,计算不同群体间的遗传距离,构建不同民族、不同地区间的系统发生树,来分析其遗传距离并探讨它们之间的遗传关系。 方法 使用酚-氯仿法提取125例内蒙古区蒙古族男性DNA,分别使用Y-FilerTM试剂盒和国产GoldeneyeTM试剂盒进行PCR扩增,再用3130XL Genetic Analyzer遗传分析仪进行毛细管电泳,ABI GeneMapper ID software V3.2软件对电泳数据进行分析,获得内蒙古区蒙古族125例健康无关男性个体的17个Y-STR基因座遗传多态性数据。 通过中国知网,Pubmed等公用数据库收集中国其它各省份、各民族群体的Y-STR基因座频率数据；将获得的文献数据与内蒙古蒙古族的检测数据汇总,多次筛选后统计出17个法医学常用Y-STR基因座位点(DYS19、DYS385a/b、 DYS389Ⅰ、DYS389Ⅱ、DYS390、DYS391、DYS392、DYS393、DYS437、DYS438、 DYS439、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、Y-GATA-H4)在中国33个族群中的等位基因频率,用phylip3.65统计软件包计算各群体间的遗传距离,并通过Neighbor-joining法构建系统发生树,分析各族群间的遗传关系。 结果 对125例蒙古族无关男性个体的17个Y-STR基因座进行检测,125例样品共检测出114种单倍型,其中106种单倍型仅出现1次,3种单倍型出现3次,5种单倍型出现2次。DYS19、DYS389Ⅰ、DYS389Ⅱ、DYS390、DYS391、DYS392、 DYS393、DYS437、DYS438、DYS439、DYS448、DYS456、DYS458、DYS635、Y-GATA-H4分别检出了5、3、7、8、4、7、5、4、5、5、6、6、7、8、5个等位基因,DYS385a/b检出42种单倍型。其GD值分别为0.7321、0.5907、0.7286、0.7083、0.6053、0.7350、0.6822、0.4781、0.5059、0.7474、0.7627、0.6115、0.7863、0.7708、0.6396、0.964。其中DYS437的GD值最低,为0.4781,DYS385a/b的GD值最高,为0.964。除DYS437外,其它基因座的GD值均大于0.5,结果表明17个Y-STR基因座在内蒙古区蒙古族人群中均具有较好的多态性,适合法医学应用。 比较所有33个族群的17个Y-STR基因座等位基因频率数据并计算出它们的遗传距离,根据遗传距离采用Neighbor-joining法构建了33个人群之间的系统发生树。在树状图上,可以看出在系统发生树的下半部分,台湾泰雅族和排湾族遗传距离较近,之后与台湾汉族聚为一个亚类。紧接着分别与福建畲族、福建汉族、成都汉族、浙江汉族聚合。广西的九个少数民族依次聚合后与浙江汉族所在的南方群体聚合,构成南方人群。太原汉族和北京汉族相距较近,之后依次与兰州汉族,河南汉族聚为一个亚类,最后和蒙古汉族、山东汉族聚合。第一部分检测的蒙古族与新疆哈萨克族遗传距离较近,并与蒙古汉族,山东汉族聚为一类。而湖南汉族,云南白族,云南佤族则构成了南方汉族和北方汉族之间的过渡人群。 结论 1、对内蒙古125例蒙古族无关男性个体17个Y-STR基因座频率数据进行检测,结果表明17个Y-STR基因座在内蒙古区蒙古族男性人群中均具有较好的多态性,适合法医学应用。可以为蒙古族的Y-STR数据库、亲权鉴定和法医学个体识别等法医学应用提供数据支持,同时也为研究该民族基因多态性,分析人类起源、进化、族群之间的亲缘关系提供了重要理论依据。 2、中国汉族和少数民族之间在遗传信息多态性上存在显著差异,南方汉族人群与北方汉族人群也存在一定的遗传距离,内蒙古蒙古族与新疆哈萨克族遗传距离较近,西藏藏族独自聚为一类。
【关键词】：Y-STR 蒙古族 法医学 民族起源 群体遗传学
【学位授予单位】：郑州大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2014
【分类号】：D919
【目录】：

• 摘要4-6
• Abstract6-11
• 第一部分 内蒙古自治区蒙古族17个Y-STR基因座的多态性研究11-39
• 前言11-13
• 材料和方法13-22
• 1 材料13-14
• 1.1 样本13
• 1.2 主要试剂13-14
• 1.3 主要仪器14
• 2 方法14-22
• 2.1 DNA的提取14-16
• 2.2 PCR扩增16-20
• 2.3 使用ABI3130XL测序仪进行毛细管电泳检测20
• 2.4 分析结果20-21
• 2.5 统计分析21-22
• 结果22-33
• 1、基因分型图22-25
• 2 17个Y-STR等位基因频率分布表25-28
• 3、单倍型分型结果28-33
• 讨论33-36
• 结论36-37
• 参考文献37-39
• 第二部分 17个Y-STR基因座用于中国境内33个人群遗传关系推断的研究39-60
• 前言39-41
• 材料和方法41-49
• 1 材料41
• 2 方法41-49
• 结果49-52
• 讨论52-56
• 1、我国的民族分布52
• 2 选择Y-STR进行统计研究的理由52-53
• 3、系统发生树的对比与讨论53-56
• 结论56-57
• 参考文献57-60
• 综述60-72
• 参考文献70-72
• 中英文缩略词索引72-73
• 个人简历、在学期间发表的学术论文及研究成果73-74
• 致谢74

【参考文献】

中国期刊全文数据库 前10条

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本文编号：430672