观赏羽衣甘蓝SSR标记分型与亲缘关系研究

发布时间：2018-02-21 07:33

  本文关键词： 观赏羽衣甘蓝 SSR标记分型 群体结构 聚类分析 亲缘关系　出处：《植物遗传资源学报》2017年02期 　论文类型：期刊论文

【摘要】：观赏羽衣甘蓝凭借优良的观赏特性和抗逆性已经成为重要的冷季观赏植物。国内观赏羽衣甘蓝育种起步较晚,并且缺乏对种质资源遗传背景的系统研究。本研究应用SSR标记对不同类型的观赏羽衣甘蓝材料进行标记分型和亲缘关系分析。从99对均匀分布于甘蓝基因组的SSR引物中筛选出46对多态性好的引物,对27份不同类型的观赏羽衣甘蓝材料进行标记分型,共扩增出210个多态性位点,平均PIC值为0.58。进一步利用标记分型结果进行STRUCTURE群体结构、UPGMA聚类和聚类热图分析,结果显示3种分析结果基本一致,可以将27份材料分为圆叶、羽叶和皱叶3种类型,其中圆叶和羽叶类型的亲缘关系更近,与皱叶类型的亲缘关系较远;STRUCTURE分析还可以将双亲为不同类型的杂交种材料进行区分;聚类热图分析可以将标记分型结果形象的展示出来。本研究为进一步建立观赏羽衣甘蓝分子指纹图谱,明确种质资源的遗传背景,建立观赏羽衣甘蓝分子标记辅助选择育种体系,培育具有自主知识产权的新品种奠定基础。
[Abstract]:Ornamental kale has become an important ornamental plant in cold season by virtue of its excellent ornamental characteristics and resistance. In this study, SSR markers were used to classify and analyze the genetic relationships of different types of ornamental Brassica oleracea. 99 pairs of SSR were homogeneously distributed in the genome of Brassica oleracea. Forty-six pairs of polymorphic primers were screened out of the primer. A total of 210 polymorphic loci were amplified from 27 different ornamental kale materials, with an average PIC value of 0.58.UPGMA clustering and cluster thermogram analysis of STRUCTURE population structure were carried out by using the results of marker typing. The results showed that the results of three kinds of analysis were basically consistent, and 27 materials could be divided into three types: round leaf, feather leaf and wrinkled leaf, among which the relationship between round leaf and feather leaf was closer. The phylogenetic relationship with the wrinkled leaf type was far away from that of Sturcture analysis, which could also distinguish the parents as hybrids of different types. In order to further establish the molecular fingerprint of Brassica oleracea, the genetic background of germplasm resources was clarified. The establishment of molecular marker-assisted selection breeding system for ornamental kale laid the foundation for breeding new varieties with independent intellectual property rights.
【作者单位】： 北京市农林科学院蔬菜研究中心/农业部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室;河北科技师范学院生命科技学院;
【基金】：国家自然科学基金项目(31501752) 北京市农林科学院财政专项(KJCX20140423) 国家星火计划项目(2015GA600004)
【分类号】：S681.9

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