Achromobacter sp.TB一氧化氮还原酶基因的克隆表达及还原性能研究
发布时间：2020-12-03 07:18
一氧化氮（Nitric oxide,NO）是一种主要大气污染物,极易造成臭氧层耗竭或酸雨酸雾等二次环境污染问题。生物净化法已被证明是绿色治理NO的有效方法,该方法去除NO的主要原理是微生物主导的反硝化反应,即微生物体内的关键还原酶可结合底物NO,通过酶促反应将NO还原为无毒无害的N2。本文以课题组前期筛选获得的一株反硝化细菌Achromobacter denitrificans strain TB为实验菌株,通过细菌De Novo测序获得该菌株基因组序列,并对序列中的反硝化基因进行了鉴定。以测序获得的一氧化氮还原酶（Nitric oxide reductase,NOR）编码序列为参考,PCR扩增成功得到TB菌中的norB基因,并通过表达载体的构建获得了基因工程菌E.coli BL21（DE3）-pET28a-norB。通过IPTG的诱导,使NorB蛋白在大肠杆菌内得到表达,然后从mRNA水平检测了norB基因在菌株内的转录情况,并考察了该菌株对NO的还原性能,主要结论如下:通过细菌De Novo测序获得Achromobacter sp.TB全基因组序列,该序列总长...
【文章来源】：浙江工业大学浙江省
【文章页数】：83 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
TB菌细胞形态
图 3-2 TB 菌基因组圈图Figure 3-2. Genome circle of strain TB从外至内，第一圈是基因组位置信息，第二圈是 GC 含量信息,第三圈基因(红色标注)，第四圈是负链上的编码基因(绿色标注)，第五圈是正息(蓝色标注)，第六圈是负链上的 ncRNA 信息(紫色标注)，第七圈标注组内长片段重复序列信息(橙色标注)m the outside to the inside, the first circle is the genomic location informrcle is the GC content information, the third circle is the coding gene on rked in red), and the fourth circle is the coding gene on the negative cha) The fifth circle is the ncRNAinformation on the positive chain (marke circle is the ncRNAinformation on the negative chain (marked in purpl circle is the long fragment repeat information in the genome (marked in码基因功能注释 Nr、KEGG、COG、GO 数据库分别对 TB 菌基因组中的编码
浙江工业大学硕士学位论文分类为反硝化无色杆菌 Achromobacterdenitrificans。冯洁仪化无色杆菌隶属于产碱杆菌属，故 Alcaligenes denitrifica分类学名称应为 Achromobacter denitrificans strain TB。 数据库（Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG和基因组信息的数据库。它整合了基因组学，生物化学及并按照不同类型的生物过程进行绘制相应的生物通路图。划分为 6 类，分别为：细胞过程（CellularProcesses）、环mental Information Processing）、遗传信息处理（Genetic）、人类疾病（HumanDiseases）、新陈代谢（Metabolism）、alSystems），每一类又被系统分为二级分类，统计二级分的基因数目，如图 3-3 所示。基因组中有 3200 个基因都谢中，占 KEGG 总注释基因数 65.08%，其中氨基酸代谢数量分别是 645 与 609 个。部分基因参与了环境信息处理5 个基因参与到生物体系统、人类疾病和遗传信息处理三条
本文编号：2896184
【文章来源】：浙江工业大学浙江省
【文章页数】：83 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
TB菌细胞形态
图 3-2 TB 菌基因组圈图Figure 3-2. Genome circle of strain TB从外至内，第一圈是基因组位置信息，第二圈是 GC 含量信息,第三圈基因(红色标注)，第四圈是负链上的编码基因(绿色标注)，第五圈是正息(蓝色标注)，第六圈是负链上的 ncRNA 信息(紫色标注)，第七圈标注组内长片段重复序列信息(橙色标注)m the outside to the inside, the first circle is the genomic location informrcle is the GC content information, the third circle is the coding gene on rked in red), and the fourth circle is the coding gene on the negative cha) The fifth circle is the ncRNAinformation on the positive chain (marke circle is the ncRNAinformation on the negative chain (marked in purpl circle is the long fragment repeat information in the genome (marked in码基因功能注释 Nr、KEGG、COG、GO 数据库分别对 TB 菌基因组中的编码
浙江工业大学硕士学位论文分类为反硝化无色杆菌 Achromobacterdenitrificans。冯洁仪化无色杆菌隶属于产碱杆菌属，故 Alcaligenes denitrifica分类学名称应为 Achromobacter denitrificans strain TB。 数据库（Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG和基因组信息的数据库。它整合了基因组学，生物化学及并按照不同类型的生物过程进行绘制相应的生物通路图。划分为 6 类，分别为：细胞过程（CellularProcesses）、环mental Information Processing）、遗传信息处理（Genetic）、人类疾病（HumanDiseases）、新陈代谢（Metabolism）、alSystems），每一类又被系统分为二级分类，统计二级分的基因数目，如图 3-3 所示。基因组中有 3200 个基因都谢中，占 KEGG 总注释基因数 65.08%，其中氨基酸代谢数量分别是 645 与 609 个。部分基因参与了环境信息处理5 个基因参与到生物体系统、人类疾病和遗传信息处理三条
本文编号：2896184
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