深圳杨梅坑海域石珊瑚资源评价
发布时间:2023-02-19 11:17
近年来,深圳海域频繁遭受台风灾害,对珊瑚礁的分布造成了一定的影响,因此开展对大亚湾海域的珊瑚礁分布调查很有必要。同时,大鹏新区由老工业区向生物产业进行转型,但环境中仍可能存在残留的重工业废物,会潜在的影响本就脆弱的珊瑚礁。尤其是重金属污染物,具有残留时间长、易于富集的特点。因此探究珊瑚对Cu2+的耐受度以及胁迫条件下基因的表达情况,对揭示珊瑚代谢途径的调控规律以及胁迫过程中的分子机理具有重要意义。本研究于2017年11月,采用截线样带法(line intercept transect)对深圳杨梅坑海域进行调查,分析该海域内造礁石珊瑚种类组成、分布特点及多样性。通过ITS序列构建Neighbor-Joining聚类树,对采集到的20种47个造礁石珊瑚样本的虫黄藻进行石珊瑚虫黄藻分类和遗传多样性分析。2018年6月,对采集到的小角孔珊瑚(Goniopora minor)进行重金属Cu2+胁迫实验,实验设置5个Cu2+浓度梯度组(0μg/L、25μg/L、50μg/L、75μg/L、90μg/L)。通过观察记录珊瑚表观生理状态...
【文章页数】:94 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 绪论
1.1 珊瑚礁共生功能体研究进展
1.1.1 虫黄藻
1.1.2 共生菌
1.1.3 珊瑚藻
1.2 珊瑚礁生态系统
1.2.1 珊瑚礁生态系统功能
1.2.2 我国珊瑚礁分布
1.3 环境压力对造礁石珊瑚的影响
1.3.1 珊瑚对几种重金属离子耐受度的研究
1.3.2 重金属对珊瑚生理生化影响
1.3.3 重金属胁迫对珊瑚转录组表达的影响
1.4 技术路线
1.5 研究的目的及意义
第二章 深圳杨梅坑海域石珊瑚分布特点与多样性
2.1 材料与方法
2.1.1 调查区域
2.1.2 调查方法
2.1.3 数据分析
2.2 结果与分析
2.2.1 杨梅坑海域石珊瑚种类组成
2.2.2 杨梅坑海域石珊瑚频度分布
2.2.3 深圳海域造礁石珊瑚多样性指数
2.3 讨论
第三章 基于ITS序列的珊瑚共生系统虫黄藻区系分析
3.1 材料与方法
3.1.1 实验样本采集与处理
3.1.2 主要仪器与试剂
3.1.3 实验方法
3.1.4 数据分析与处理
3.2 结果与分析
3.2.1 实验样本鉴定
3.2.2 基于ITS序列构建的聚类关系分析
3.2.3 虫黄藻ITS基因序列组成
3.2.4 基于ITS序列研究不同海域虫黄藻遗传多样性
3.3 讨论
第四章 Cu2+胁迫对小角孔珊瑚生理生化的影响
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 实验方法
4.1.3 观察与分析指标
4.1.4 数据处理
4.2 结果与分析
4.2.1 不同浓度Cu2+胁迫下,珊瑚虫的表观生理状态
4.2.2 Cu2+胁迫对珊瑚虫黄藻密度的影响
4.2.3 Cu2+胁迫对珊瑚单位叶绿素a浓度的影响
4.2.4 不同浓度Cu2+胁迫对珊瑚酶活性的影响
4.3 讨论
第五章 Cu2+胁迫下小角孔珊瑚转录组分析
5.1 材料与方法
5.1.1 样本获取、处理
5.1.2 主要仪器与试剂
5.2 实验方法
5.2.1 Cu2+胁迫实验
5.2.2 RNA的提取
5.2.3 转录组测序及文库构建
5.2.4 转录组数据处理
5.2.5 转录组生物信息学分析
5.2.6 荧光定量验证
5.3 实验结果与分析
5.3.1 RNA样品检测
5.3.2 转录组测序结果
5.4 讨论
第六章 结论与展望
6.1 结论
6.2 创新点
6.3 展望
参考文献
致谢
附录一 在读期间发表的学术论文及研究成果
附录二 在读期间参与的科研项目
本文编号:3746116
【文章页数】:94 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
ABSTRACT
第一章 绪论
1.1 珊瑚礁共生功能体研究进展
1.1.1 虫黄藻
1.1.2 共生菌
1.1.3 珊瑚藻
1.2 珊瑚礁生态系统
1.2.1 珊瑚礁生态系统功能
1.2.2 我国珊瑚礁分布
1.3 环境压力对造礁石珊瑚的影响
1.3.1 珊瑚对几种重金属离子耐受度的研究
1.3.2 重金属对珊瑚生理生化影响
1.3.3 重金属胁迫对珊瑚转录组表达的影响
1.4 技术路线
1.5 研究的目的及意义
第二章 深圳杨梅坑海域石珊瑚分布特点与多样性
2.1 材料与方法
2.1.1 调查区域
2.1.2 调查方法
2.1.3 数据分析
2.2 结果与分析
2.2.1 杨梅坑海域石珊瑚种类组成
2.2.2 杨梅坑海域石珊瑚频度分布
2.2.3 深圳海域造礁石珊瑚多样性指数
2.3 讨论
第三章 基于ITS序列的珊瑚共生系统虫黄藻区系分析
3.1 材料与方法
3.1.1 实验样本采集与处理
3.1.2 主要仪器与试剂
3.1.3 实验方法
3.1.4 数据分析与处理
3.2 结果与分析
3.2.1 实验样本鉴定
3.2.2 基于ITS序列构建的聚类关系分析
3.2.3 虫黄藻ITS基因序列组成
3.2.4 基于ITS序列研究不同海域虫黄藻遗传多样性
3.3 讨论
第四章 Cu2+胁迫对小角孔珊瑚生理生化的影响
4.1 材料与方法
4.1.1 实验材料
4.1.2 实验方法
4.1.3 观察与分析指标
4.1.4 数据处理
4.2 结果与分析
4.2.1 不同浓度Cu2+胁迫下,珊瑚虫的表观生理状态
4.2.2 Cu2+胁迫对珊瑚虫黄藻密度的影响
4.2.3 Cu2+胁迫对珊瑚单位叶绿素a浓度的影响
4.2.4 不同浓度Cu2+胁迫对珊瑚酶活性的影响
4.3 讨论
第五章 Cu2+胁迫下小角孔珊瑚转录组分析
5.1 材料与方法
5.1.1 样本获取、处理
5.1.2 主要仪器与试剂
5.2 实验方法
5.2.1 Cu2+胁迫实验
5.2.2 RNA的提取
5.2.3 转录组测序及文库构建
5.2.4 转录组数据处理
5.2.5 转录组生物信息学分析
5.2.6 荧光定量验证
5.3 实验结果与分析
5.3.1 RNA样品检测
5.3.2 转录组测序结果
5.4 讨论
第六章 结论与展望
6.1 结论
6.2 创新点
6.3 展望
参考文献
致谢
附录一 在读期间发表的学术论文及研究成果
附录二 在读期间参与的科研项目
本文编号:3746116
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