基于分子动力学模拟与靶点预测技术的HO-/MeO-PBDEs内分泌干扰效应研究

发布时间：2023-03-09 21:34

　　多溴联苯醚(Polybrominated diphenyl ethers, PBDEs)是一种常见的添加型溴代阻燃剂,在多种环境介质中都能检出,且对人体健康和生态环境具有潜在的危害,因此受到人们的极大关注。而近年来,其结构类似物——Hydroxylated/Methoxylated-PBDEs (HO/MeO-PBDEs)也受到越来越多环境科学家的关注。目前已经有许多研究关注HO/MeO-PBDEs的内分泌干扰效应,其中就包括雌激素活性、雄激素活性、甲状腺激素活性和芳烃受体活性等。然而这类物质与这些受体相互作用的微观过程没有被详细的研究,激活或者抑制机制不明；另一方面HO/MeO-PBDEs类化合物种类繁多,无法逐一地测定其内分泌干扰活性,所以需要建立模型或者其他计算方法去预测它们的活性。基于上述情况,亟需了解这些化合物与几个典型内分泌受体的相互作用过程,并在此基础上建立模型去预测这类化合物的受体效应。此外,主要受体以外的其他内分泌干扰效应通路也逐渐引起关注,生物组学实验可以有效地帮助人们寻找新化合物潜在的内分泌干扰效应作用模式,但是这种方法成本高昂。因此本研究拟建立高通量虚拟筛选技术...

【文章页数】：74 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
    1.1 HO-/MeO-PBDEs类物质及其内分泌干扰效应
    1.2 AR/TR/AHR的转导通路与结构
    1.3 计算类方法研究内分泌干扰效应
    1.4 分子动力学模拟技术简介
    1.5 靶点预测与反对接技术
    1.6 论文的主要研究内容
    参考文献
第二章 基于细胞测试和MD模拟研究HO-/MeO-PBDEs的抗雄激素活性
    2.1 前言
    2.2 研究方法
        2.2.1 细胞实验材料
        2.2.2 细胞实验方法
        2.2.3 数据处理
        2.2.4 分子动力学模拟
    2.3 结果与讨论
        2.3.1 羟基化与甲氧基化多溴联苯醚的抗雄激素活性
        2.3.2 分子动力学模拟结果
    2.4 小结
    参考文献
第三章 基于MD模拟的HO-/MeO-PBDEs的甲状腺激素受体β活性研究
    3.1 前言
    3.2 研究方法
        3.2.1 化合物及活性数据
        3.2.2 受体结构构建与模拟研究
    3.3 结果与讨论
        3.3.1 TRβ-LBD体系的分子动力学模拟
        3.3.2 TRβ-LBD-NCOR体系的分子动力学模拟
    3.4 小结
    参考文献
第四章 HO-/MeO-PBDEs类化合物的鸟类AHR1活性与种间差异研究
    4.1 前言
    4.2 研究方法
        4.2.1 化合物、实验方法及活性数据
        4.2.2 构建小分子并进行结构优化
        4.2.3 两类鸟的AHR1-LBD结构构建
        4.2.4 分子对接与分子动力学模拟
    4.3 结果与讨论
        4.3.1 模建结果
        4.3.2 对接结果
        4.3.3 分子动力学模拟
    4.4 小结
    参考文献
第五章 内分泌干扰相关靶点预测系统的建立及其对HO-/MeO-PBDEs的应用
    5.1 前言
    5.2 研究方法
        5.2.1 内分泌干扰效应相关蛋白库构建
        5.2.2 基于反对接的SPET构建与检验
        5.2.3 HO-/MeO-PBDEs的活性预测
    5.3 结果与讨论
        5.3.1 对接口袋搜索
        5.3.2 系统的检验与评价
        5.3.3 BDE-47、HO-BDE-47与MeO-BDE-47的潜在内分泌干扰效应相关靶点
    5.4 小结
    参考文献
第六章 结论与展望
    6.1 研究结论
    6.2 展望
攻读硕士学位期间主要成果
致谢



本文编号：3758331