基于LC-MS的白色链霉菌代谢物差异分析及其应用研究
发布时间：2021-03-25 00:03
链霉菌的次级代谢能力非常强大,代谢形式更是繁复多样,其可以提供丰富的天然产物,被广泛应用于人类医学,动物健康和植物作物保护。但是我们对链霉菌的代谢路径、生物合成基因簇功能的了解还是相对有限,通过对微生物代谢组学的分析,可以对链霉菌的细胞功能有更深层次的了解。（1）目前,代谢物的识别和鉴定是代谢组学进展最重要的限制因素之一,建立代谢物二级质谱数据库可以有效地促进代谢组学的发展。我们利用HPLC-Q-TOF高分辨质谱对模式菌株白色链霉菌（Streptomyces albus）的代谢产物进行检测,然后通过二级质谱（Auto ms/ms）对代谢物的结构进行鉴定,从而建立基础的白色链霉菌代谢物质谱数据库。通过实验本文共获得了1188个二级质谱谱图,297种无重复的化合物二级质谱数据,鉴定了其中52种代谢产物。此数据库为后续分析白色链霉菌以及其为宿主的异源表达菌株的代谢差异和研究SF2768生物合成基因簇功能奠定了坚实的基础。（2）SF2768为双异腈天然活性物质,具有潜在应用价值。本章研究旨在揭示SF2768的生物合成途径,寻找可能的生物合成前体,解释其生物合成基因簇的功能。首先,本文比较了野生...
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：85 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于Metlin的代谢物鉴别工作流程图
、样品前处理方法、液相色谱分离条件、质谱采集参化。养基及培养方式的选择考察了菌体的培养方式，包括固体培养、液体培养、 培养基、MS 培养基)。实验结果显示，在 2CM 培养为 2CM 营养贫瘠，不利于白色链霉菌的代谢，故本实S 培养基中含有大量的大豆饼粉，营养物质丰富，白于此培养基基质复杂，经过样品前处理后进质谱检测扰效应。所以最终本实验选择基质简单，营养程度适中培养被污染时，固体培养易于观察，而且其样品前处最终选择固体培养方式。图 2-1 为液培、固培菌体外
图 2-2 液相方法优化色谱图Fig. 2-2 The Chromatograms in different liquid separation methods3.2 二级质谱数据的采集与初步处理由于Q-TOF-MS的灵敏度很高，而且容易获取大量的二级质谱片段，同时对于Q-TOF-MS来说，具有可以同时获得几百个高分辨率和精确度的二级质谱数据的功能，所以我们利用Q-TOF-MS检测模式菌株白色链霉菌代谢产物，快速获得大批量二级质谱图。0 5 10 15 20 255.0x1051.0x1061.5x1062.0x1062.5x10method 2Aquisition Time(min)
【参考文献】：
期刊论文
[1]Nuclear magnetic resonance based metabolomics and liver diseases: Recent advances and future clinical applications[J]. Roland Amathieu,Mohamed Nawfal Triba,Corentine Goossens,Nadia Bouchemal,Pierre Nahon,Philippe Savarin,Laurence Le Moyec. World Journal of Gastroenterology. 2016(01)
[2]微生物代谢组学研究及应用进展[J]. 席晓敏,张和平. 食品科学. 2016(11)
[3]厦门霉素生物合成基因簇在白色链霉菌及吸水链霉菌FR-008中的异源表达[J]. 张金龙. 信阳师范学院学报(自然科学版). 2015(02)
[4]微生物次级代谢产物生物合成基因簇异源表达研究进展[J]. 杜东霞. 中国抗生素杂志. 2012(08)
[5]代谢组学研究策略与方法的新进展[J]. 夏建飞,梁琼麟,胡坪,王义明,罗国安. 分析化学. 2009(01)
[6]链霉菌基因组及次生代谢研究进展[J]. 吴雪昌,缪克排,钱凯先. 遗传学报. 2005(11)
[7]非核糖体多肽合成酶研究进展[J]. 明镇寰,潘建伟,朱睦元. 生物化学与生物物理进展. 2002(05)
硕士论文
[1]色谱—质谱联用分析微生物代谢网络[D]. 许卫萍.大连工业大学 2011
[2]模式链霉菌可移动基因组的比较分析[D]. 邵钰城.上海交通大学 2011
本文编号：3098642
【文章来源】：华中农业大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：85 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于Metlin的代谢物鉴别工作流程图
、样品前处理方法、液相色谱分离条件、质谱采集参化。养基及培养方式的选择考察了菌体的培养方式，包括固体培养、液体培养、 培养基、MS 培养基)。实验结果显示，在 2CM 培养为 2CM 营养贫瘠，不利于白色链霉菌的代谢，故本实S 培养基中含有大量的大豆饼粉，营养物质丰富，白于此培养基基质复杂，经过样品前处理后进质谱检测扰效应。所以最终本实验选择基质简单，营养程度适中培养被污染时，固体培养易于观察，而且其样品前处最终选择固体培养方式。图 2-1 为液培、固培菌体外
图 2-2 液相方法优化色谱图Fig. 2-2 The Chromatograms in different liquid separation methods3.2 二级质谱数据的采集与初步处理由于Q-TOF-MS的灵敏度很高，而且容易获取大量的二级质谱片段，同时对于Q-TOF-MS来说，具有可以同时获得几百个高分辨率和精确度的二级质谱数据的功能，所以我们利用Q-TOF-MS检测模式菌株白色链霉菌代谢产物，快速获得大批量二级质谱图。0 5 10 15 20 255.0x1051.0x1061.5x1062.0x1062.5x10method 2Aquisition Time(min)
【参考文献】：
期刊论文
[1]Nuclear magnetic resonance based metabolomics and liver diseases: Recent advances and future clinical applications[J]. Roland Amathieu,Mohamed Nawfal Triba,Corentine Goossens,Nadia Bouchemal,Pierre Nahon,Philippe Savarin,Laurence Le Moyec. World Journal of Gastroenterology. 2016(01)
[2]微生物代谢组学研究及应用进展[J]. 席晓敏,张和平. 食品科学. 2016(11)
[3]厦门霉素生物合成基因簇在白色链霉菌及吸水链霉菌FR-008中的异源表达[J]. 张金龙. 信阳师范学院学报(自然科学版). 2015(02)
[4]微生物次级代谢产物生物合成基因簇异源表达研究进展[J]. 杜东霞. 中国抗生素杂志. 2012(08)
[5]代谢组学研究策略与方法的新进展[J]. 夏建飞,梁琼麟,胡坪,王义明,罗国安. 分析化学. 2009(01)
[6]链霉菌基因组及次生代谢研究进展[J]. 吴雪昌,缪克排,钱凯先. 遗传学报. 2005(11)
[7]非核糖体多肽合成酶研究进展[J]. 明镇寰,潘建伟,朱睦元. 生物化学与生物物理进展. 2002(05)
硕士论文
[1]色谱—质谱联用分析微生物代谢网络[D]. 许卫萍.大连工业大学 2011
[2]模式链霉菌可移动基因组的比较分析[D]. 邵钰城.上海交通大学 2011
本文编号：3098642
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/huaxue/3098642.html
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