应用Stepped NCE串级质谱法研究完整糖肽序列
发布时间：2021-04-06 14:33
蛋白质糖基化是一种重要的翻译后修饰,在生理和病理过程中扮演着重要的角色。它不仅参与生命体内的新陈代谢、免疫调节等许多生理过程,而且与癌症等许多重大疾病的发生和发展也密切相关。因此,对于蛋白质糖基化的研究具有十分重要的意义。近年来,随着质谱技术的发展,基于质谱技术的蛋白质糖基化研究已经取得了巨大的成功。但由于糖蛋白低丰度、结构不均一等特性,导致糖蛋白/糖肽的高效富集方面仍然存在很大的困难。并且,将糖蛋白/糖肽从复杂样品中有效地分离富集之后,完整糖肽水平上系统性、高通量的质谱分析也面临着极大的挑战。针对上述问题,本论文关于蛋白质糖基化的研究主要分为两部分:1.应用Hybrid Quadrupole Orbitrap质谱研究一种新合成脯氨酸-天冬氨酸二肽聚合物修饰的介孔二氧化硅（poly-PD@SiO2）材料对糖肽的富集效果。配置一系列不同质量浓度（μg/μL）比的牛胎球蛋白（Bovine fetuin,糖蛋白）与牛血清蛋白（BSA,非糖蛋白、干扰蛋白）的混合干扰模型。混合蛋白样品先使用胰蛋白酶酶解处理,再经实验室自主合成的poly-PD@SiO2...
【文章来源】：武汉理工大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
生命体内诸多生理过程中的蛋白质糖基化
异常的糖基化修饰，如糖蛋白含量的变化、糖链结构和糖基化的改变，通常与恶性肿瘤、糖尿病、自身免疫疾病、类风湿性关节炎、甲状、阿兹海默综合症等许多疾病的发生和发展息息相关[10]。如图 1-2 所示，与细胞相比，肿瘤细胞表面的聚糖结构发生了明显改变，这种改变不仅发生在的核心结构，也可能表现在末端唾液酸化、岩藻糖化这些微小的变化上[11]。
结构决定性质，性质决定功能，糖蛋白在生理和病理过程中独特的生物学，离不开糖基侧链对蛋白质的修饰作用。糖白质的糖基侧链主要由戊糖、己及其衍生物等单糖构成，常见的单糖包括 N-乙酰葡糖胺（N-acetylglucosamlcNAc），甘露糖（Mannose，Man），N-乙酰半乳糖胺（N-acetylgalactosaminalNAc），半乳糖（Galactose，Gal），唾液酸（Sialic Acid，SA）等。根据糖连接方式不同，哺乳动物中蛋白质的糖基化主要包括 N-linked 糖基化、O-lin基化、GPI 糖基磷脂酰肌醇锚、C-linked 糖基化 4 种类型[15-17]。目前糖蛋白学的研究工作主要集中在 N-linked 糖基化和 O-linked 糖基化这两种连接方N-linked 糖基化发生在特定的 NXS/T 多肽特征序列中，是指糖链与蛋白中的天冬酰胺（Asparagine，N）共价连接的过程，其中 X 是除脯氨酸外的必需氨基酸[18]。常见 N-linked 糖基化的糖链可以按照其结构组成的核心来，主要分为高甘露糖型、复合型、杂合型三大类，如图 1-3 所示[19, 20]。在这心结构上连接不同数量和种类的单糖，最终形成了无数种结构各异的糖链ked 糖蛋白多存在于血浆等体液中，因此又称为血浆型糖蛋白。
【参考文献】：
期刊论文
[1]N-糖肽的规模化质谱解析方法进展[J]. 曾文锋,张扬,刘铭琪,吴建强,张晓今,杨皓,刘超,迟浩,张昆,孙瑞祥,杨芃原,贺思敏. 生物化学与生物物理进展. 2016(06)
[2]完整糖肽质谱解析的研究进展[J]. 王继峰,江静,彭博,钟儒刚,应万涛,钱小红. 质谱学报. 2014(02)
[3]糖蛋白质组研究进展[J]. 王林杰,郑德先,高友鹤. 基础医学与临床. 2007(02)
硕士论文
[1]基于功能化磁性纳米材料的糖肽富集与质谱鉴定新方法研究[D]. 匡敏.复旦大学 2013
本文编号：3121609
【文章来源】：武汉理工大学湖北省 211工程院校 教育部直属院校
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
生命体内诸多生理过程中的蛋白质糖基化
异常的糖基化修饰，如糖蛋白含量的变化、糖链结构和糖基化的改变，通常与恶性肿瘤、糖尿病、自身免疫疾病、类风湿性关节炎、甲状、阿兹海默综合症等许多疾病的发生和发展息息相关[10]。如图 1-2 所示，与细胞相比，肿瘤细胞表面的聚糖结构发生了明显改变，这种改变不仅发生在的核心结构，也可能表现在末端唾液酸化、岩藻糖化这些微小的变化上[11]。
结构决定性质，性质决定功能，糖蛋白在生理和病理过程中独特的生物学，离不开糖基侧链对蛋白质的修饰作用。糖白质的糖基侧链主要由戊糖、己及其衍生物等单糖构成，常见的单糖包括 N-乙酰葡糖胺（N-acetylglucosamlcNAc），甘露糖（Mannose，Man），N-乙酰半乳糖胺（N-acetylgalactosaminalNAc），半乳糖（Galactose，Gal），唾液酸（Sialic Acid，SA）等。根据糖连接方式不同，哺乳动物中蛋白质的糖基化主要包括 N-linked 糖基化、O-lin基化、GPI 糖基磷脂酰肌醇锚、C-linked 糖基化 4 种类型[15-17]。目前糖蛋白学的研究工作主要集中在 N-linked 糖基化和 O-linked 糖基化这两种连接方N-linked 糖基化发生在特定的 NXS/T 多肽特征序列中，是指糖链与蛋白中的天冬酰胺（Asparagine，N）共价连接的过程，其中 X 是除脯氨酸外的必需氨基酸[18]。常见 N-linked 糖基化的糖链可以按照其结构组成的核心来，主要分为高甘露糖型、复合型、杂合型三大类，如图 1-3 所示[19, 20]。在这心结构上连接不同数量和种类的单糖，最终形成了无数种结构各异的糖链ked 糖蛋白多存在于血浆等体液中，因此又称为血浆型糖蛋白。
【参考文献】：
期刊论文
[1]N-糖肽的规模化质谱解析方法进展[J]. 曾文锋,张扬,刘铭琪,吴建强,张晓今,杨皓,刘超,迟浩,张昆,孙瑞祥,杨芃原,贺思敏. 生物化学与生物物理进展. 2016(06)
[2]完整糖肽质谱解析的研究进展[J]. 王继峰,江静,彭博,钟儒刚,应万涛,钱小红. 质谱学报. 2014(02)
[3]糖蛋白质组研究进展[J]. 王林杰,郑德先,高友鹤. 基础医学与临床. 2007(02)
硕士论文
[1]基于功能化磁性纳米材料的糖肽富集与质谱鉴定新方法研究[D]. 匡敏.复旦大学 2013
本文编号：3121609
本文链接：https://www.wllwen.com/kejilunwen/huaxue/3121609.html
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