基于Pthreads的并行DSRC压缩算法设计与实现

发布时间：2019-05-30 15:59

【摘要】：高通量测序仪产生大量的DNA数据,FASTQ是被广泛使用的存储DNA数据的数据格式。对FASTQ格式的数据进行压缩处理,能有效地节省存储空间。DSRC算法具有压缩比高的优点,因此对DSRC算法进行并行能提高压缩FASTQ格式的DNA数据的效率。基于Pthreads,实现了并行DSRC算法。测试结果表明,当使用4线程时加速比达到3.5。
[Abstract]:......
【作者单位】： 中国科学院软件研究所并行软件与计算科学实验室;中国科学院计算技术研究所计算机体系结构国家重点实验室;广州中国科学院软件应用技术研究所;
【基金】：国家“八六三”高技术研究发展计划基金(2012AA010903) 国家自然科学基金项目(61170075,61133005,61272136,61100073) 广州市云计算技术研发与产业化专项资助
【分类号】：TP333

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本文编号：2488975