基于Hadoop的虚拟筛选海量数据存储及结果处理的设计和实现
发布时间:2019-10-18 15:40
【摘要】:传统的虚拟筛选以及网格环境下的虚拟筛选都需要化学家手动将小分子文件上传以及结果数据收集,无法实现自动对接以及结果文件的自动收集,给化学家造成了一定的工作负担。 本论文在国家自然科学基金重大研究计划中两个重点项目“计算化学e-Science研究和示范应用”以及“网络环境下抗禽流感病毒H5N1药物的大规模虚拟筛选研究”成果的基础上,结合Hadoop平台在海量数据存储中的优势,开展基于Hadoop平台的虚拟筛选的海量数据存储和结果处理的设计和实现工作,以实现虚拟筛选的自动化。本论文主要开展以下两个方面的工作:一、针对大规模虚拟筛选中对海量原始小分子数据、对接结果数据和海量作业进行管理的需求,实现了支持大规模虚拟筛选的数据存储和作业管理的Hadoop平台;二、利用MapReduce编程框架实现了并行分子对接和结果文件的初步处理。 本论文的研究成果为药物开发工作者提供了进行大规模药物虚拟筛选研究和海量数据管理的平台,为云环境下的药物开发提供了借鉴,将促进计算化学e-science的发展。
【学位授予单位】:兰州大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:TP333
本文编号:2551157
【学位授予单位】:兰州大学
【学位级别】:硕士
【学位授予年份】:2012
【分类号】:TP333
【二级参考文献】
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,本文编号:2551157
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