甜瓜乙烯应答因子基因CmERF Ⅰ-14的生物信息学分析

发布时间：2017-10-11 06:30

  本文关键词：甜瓜乙烯应答因子基因CmERF Ⅰ-14的生物信息学分析

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【摘要】：本研究采用生物信息学的方法对甜瓜数据库中的甜瓜乙烯应答因子基因ERFⅠ-14(登录号:MEL O3C014441)的启动子特性、RNA结构、理化性质、导肽、信号肽、跨膜结构域、蛋白质二级结构、三级结构及功能域等进行预测和推断。结果表明,CmERFⅠ-14基因的开放阅读框(ORF)长645 bp,编码214个氨基酸,蛋白质的分子量约为23 kD,理论等电点为6.59,不存在导肽和信号肽,无跨膜结构域,二级结构中最主要的结构元件是无规则卷曲,包含一个AP2/ERF功能结构域,预测到8个可能的互作蛋白和多个启动子元件,没有预测到CpG岛。系统发育分析发现,其与黄瓜ERF3-like蛋白(XP_004140127.1)亲缘关系最近。
【作者单位】： 内蒙古大学生命科学学院内蒙古自治区牧草与特色作物生物技术重点实验室;
【关键词】： 甜瓜 乙烯应答因子 ERF 生物信息学分析
【基金】：国家自然科学基金项目(31360486) 国家级大学生创新创业训练计划项目(201410126032)共同资助
【分类号】：S652;Q943.2
【正文快照】： Bioinformatics Analysis of Melon Ethylene Response Factor Gene Cm ERFⅠ-14Ju Linfang Duan Shangyao Zhang Yan Hasi Agula Niu Yiding*Inner Mongolia Key Laboratory of HerbageEndemic Crop Biotechnology,College of Life Sciences,Inner Mongolia University,Hohh，

本文编号：1010992