海岛棉GbHCT基因克隆及生物信息学分析

发布时间：2017-10-11 16:09

  本文关键词：海岛棉GbHCT基因克隆及生物信息学分析

  更多相关文章： 海岛棉 HCT 基因克隆 生物信息学

【摘要】：克隆海岛棉木质素合成关键酶基因GbHCT全长cDNA序列,分析其在纤维不同发育时期的表达情况。根据海岛棉转录组数据中的HCT序列设计引物,采用RT-PCR技术克隆基因,通过生物信息学方法分析GbHCT的cDNA序列和氨基酸序列。通过分析转录组数据研究GbHCT在纤维不同发育时期的表达。从海岛棉中克隆了1个编码HCT的基因GbHCT,开放阅读框长度为1311bp,编码436个氨基酸,蛋白质分子量为48.58kD,等电点为6.03。GbHCT氨基酸序列中含有HTLGD和DFGWG2个保守基序。GbHCT氨基酸与陆地棉、亚洲棉和雷蒙德氏棉HCT一致性较高,与其他植物中的HCT氨基酸的一致性为55.7%-60.7%。转录组数据分析发现GbHCT在纤维不同发育阶段都有表达,在5DPA的纤维中表达量最高,表明该基因可能参与棉花纤维的发育。
【作者单位】： 新疆农业大学农学院新疆农业大学农业生物技术重点实验室;中国农业科学院棉花研究所棉花生物学国家重点实验室;
【关键词】： 海岛棉 HCT 基因克隆 生物信息学
【基金】：棉花生物学国家重点实验室开放课题基金资助项目(CB2015A26) 国家自然基金项目(31360264) 国家大学生创新创业训练计划项目(201510758001) 新疆维吾尔自治区自然科学基金资助项目(2014211A025,2013211B19) 新疆维吾尔自治区高技术研究发展计划(201411103) 中国博士后科学基金(2015M582741) 新疆维吾尔自治区优秀博士后普通资助
【分类号】：S562;Q943.2
【正文快照】： 棉花是世界上最重要的纤维作物之一,棉纤维品质优劣直接影响纺织品的市场竞争力[1,2]。棉花为锦葵科棉属,棉属有52个种,包括4个栽培棉种、47个野生棉种。现广泛种植的陆地棉和海岛棉为异源四倍体栽培种[3]。陆地棉适应性广且产量高,占我国所产原棉的99%。海岛棉在我国目前只有，

本文编号：1013470